ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Toxoplasma gondii RH apicoplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001799	TAT	4	305	317	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_001799	ATTT	3	946	957	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_001799	CCTT	3	1363	1373	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_001799	TA	7	1875	1890	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_001799	TA	7	2453	2466	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_001799	AAAAAT	3	2505	2521	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
7	NC_001799	AT	6	3275	3285	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_001799	AAAT	3	4604	4615	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_001799	TAA	4	5028	5039	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_001799	TA	6	5785	5798	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11496535
11	NC_001799	TAT	4	6172	6182	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_001799	CCTT	3	6363	6373	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
13	NC_001799	GTAG	3	7012	7023	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_001799	AAAT	3	7232	7243	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11496536
15	NC_001799	TTAA	4	7258	7273	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11496536
16	NC_001799	AT	7	7511	7523	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11496536
17	NC_001799	TAA	4	7820	7831	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11496537
18	NC_001799	TA	7	8166	8178	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11496537
19	NC_001799	TTAA	3	8886	8897	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11496539
20	NC_001799	AAT	4	8922	8932	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11496539
21	NC_001799	TAAA	3	9057	9067	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11496539
22	NC_001799	TATT	3	9094	9104	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11496539
23	NC_001799	TTATT	3	9259	9272	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11496539
24	NC_001799	AAAT	3	9910	9920	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11496540
25	NC_001799	AAATA	3	9989	10002	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11496541
26	NC_001799	TTTAAA	3	10719	10736	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_001799	TAT	4	10764	10775	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_001799	AATTT	3	10872	10885	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_001799	TAT	4	11129	11139	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11496543
30	NC_001799	AT	6	11141	11151	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11496543
31	NC_001799	AATT	3	11219	11230	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11496543
32	NC_001799	AAT	4	11476	11487	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11496543
33	NC_001799	AAATT	3	11524	11537	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	11496543
34	NC_001799	TAAA	3	11644	11656	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11496544
35	NC_001799	ATTT	3	11694	11704	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11496544
36	NC_001799	TATT	3	11705	11716	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11496544
37	NC_001799	TA	6	11888	11900	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11496544
38	NC_001799	TTTTA	3	12161	12175	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11496544
39	NC_001799	ATT	5	12181	12194	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11496544
40	NC_001799	TAT	4	12220	12232	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11496544
41	NC_001799	TTAA	3	12377	12388	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11496544
42	NC_001799	CTAATA	3	12600	12618	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	11496559
43	NC_001799	AGAA	3	12687	12698	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11496559
44	NC_001799	ATT	4	12732	12742	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11496559
45	NC_001799	CTAT	3	12858	12868	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11496559
46	NC_001799	A	16	12974	12989	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	11496546
47	NC_001799	AAAT	3	13291	13303	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11496546
48	NC_001799	ATTT	3	13352	13362	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11496547
49	NC_001799	TTTAA	3	13423	13437	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	11496547
50	NC_001799	ATA	4	15224	15235	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_001799	ATT	4	15230	15241	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_001799	AATT	3	15497	15508	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11496550
53	NC_001799	TAT	4	15975	15986	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11496551
54	NC_001799	AT	6	16049	16060	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11496560
55	NC_001799	ATT	4	16171	16181	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11496560
56	NC_001799	TTA	4	16450	16460	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11496552
57	NC_001799	ATTT	4	16757	16772	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11496552
58	NC_001799	AAAATT	3	17033	17050	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11496552
59	NC_001799	TAA	4	17051	17061	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11496552
60	NC_001799	ATA	4	17608	17618	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11496552
61	NC_001799	AAAT	3	17652	17663	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11496552
62	NC_001799	TAT	4	18590	18601	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11496552
63	NC_001799	TTA	4	18877	18887	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11496553
64	NC_001799	TA	8	19130	19144	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_001799	TA	9	19639	19655	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11496554
66	NC_001799	TAA	4	19864	19875	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11496554
67	NC_001799	ATAAAT	3	19896	19913	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11496554
68	NC_001799	TAT	4	19962	19972	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11496554
69	NC_001799	TA	6	20525	20535	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_001799	AT	6	21279	21289	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_001799	ATTTT	3	21301	21314	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_001799	ATA	4	21342	21352	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_001799	TTAA	3	21491	21502	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_001799	TAA	4	21657	21668	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_001799	TTTAAA	3	21738	21756	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
76	NC_001799	TAAA	3	22038	22048	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_001799	AAAT	3	22117	22127	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_001799	ATT	4	22566	22577	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_001799	TAA	4	22577	22589	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_001799	TTAA	4	22592	22607	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_001799	TAT	4	24480	24491	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11496557
82	NC_001799	TAAA	3	24754	24765	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11496557
83	NC_001799	AAAT	3	24975	24986	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11496557
84	NC_001799	TTAA	3	25010	25020	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11496557
85	NC_001799	TAAA	3	25249	25259	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11496555
86	NC_001799	ATA	5	26372	26385	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11496555
87	NC_001799	CTAT	3	26536	26547	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11496555
88	NC_001799	AACT	3	27037	27047	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11496555
89	NC_001799	ATTTAT	3	27155	27171	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11496555
90	NC_001799	TAATT	3	27483	27498	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	11496555
91	NC_001799	AATT	3	27629	27639	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11496555
92	NC_001799	TAAA	3	27698	27710	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11496555
93	NC_001799	AAAT	3	27952	27963	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11496555
94	NC_001799	TAAAA	3	28184	28198	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	11496555
95	NC_001799	TTCTAA	3	28334	28351	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	11496556
96	NC_001799	TAA	4	29321	29332	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11496556
97	NC_001799	ATTTAT	3	29404	29421	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11496556
98	NC_001799	TAT	4	29644	29657	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11496556
99	NC_001799	ATTT	3	30382	30393	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_001799	TA	6	31711	31723	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_001799	TA	6	32406	32417	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_001799	ATTTTT	3	32476	32492	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
103	NC_001799	TA	6	32533	32544	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_001799	TAGT	3	32754	32766	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_001799	TATAT	3	33090	33104	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001799	TA	12	33107	33129	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_001799	GAAG	3	33623	33633	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_001799	ATA	4	34684	34696	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Toxoplasma gondii RH apicoplast