ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Equus asinus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001788	TTA	4	94	106	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_001788	GTTC	3	2489	2500	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_001788	TTCTA	3	2554	2567	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
4	NC_001788	CAT	4	2962	2973	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	5835346
5	NC_001788	CAT	4	3458	3469	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	5835346
6	NC_001788	ATC	4	4154	4165	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	5835347
7	NC_001788	CAT	4	4215	4227	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	5835347
8	NC_001788	CTT	4	5687	5699	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	5835348
9	NC_001788	CTT	4	6385	6396	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	5835348
10	NC_001788	TAA	4	6750	6761	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5835348
11	NC_001788	CCCT	3	7272	7284	13	0 %	25 %	0 %	75 %	7 %	5835349
12	NC_001788	TA	6	7293	7303	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	5835349
13	NC_001788	TCA	4	8897	8907	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	5835352
14	NC_001788	TCT	5	8912	8925	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	5835352
15	NC_001788	TTGC	3	10108	10118	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	5835354
16	NC_001788	TA	6	12093	12103	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	5835356
17	NC_001788	CAT	4	12223	12233	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	5835356
18	NC_001788	GAT	4	12246	12256	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	5835356
19	NC_001788	AATC	3	14220	14230	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	5835358
20	NC_001788	TCCTAC	3	14885	14902	18	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	5835358
21	NC_001788	AC	7	16148	16161	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
22	NC_001788	AC	7	16172	16185	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
23	NC_001788	AC	7	16196	16209	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
24	NC_001788	AC	7	16220	16233	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
25	NC_001788	AC	7	16244	16257	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
26	NC_001788	AC	7	16268	16281	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
27	NC_001788	AC	7	16292	16305	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
28	NC_001788	AC	7	16316	16329	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
29	NC_001788	AC	19	16340	16377	38	50 %	0 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
30	NC_001788	ACCCC	3	16409	16422	14	20 %	0 %	0 %	80 %	7 %	Non-Coding
31	NC_001788	CA	6	16516	16526	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Equus asinus mitochondrion