ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pichia canadensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001762	ATA	4	970	981	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_001762	TTA	4	979	990	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_001762	TTA	5	1829	1843	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466049
4	NC_001762	AGG	4	1912	1923	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	11466049
5	NC_001762	ATT	4	2619	2629	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466049
6	NC_001762	TAA	4	3940	3951	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_001762	ATA	4	4020	4031	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_001762	TTA	4	4181	4192	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466051
9	NC_001762	TAA	6	4272	4289	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_001762	TAA	6	4375	4391	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_001762	ATT	5	5697	5712	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_001762	TAT	4	6559	6570	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466053
13	NC_001762	ATA	4	6661	6671	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466053
14	NC_001762	TAA	5	6685	6699	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466053
15	NC_001762	ATA	4	6742	6755	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466053
16	NC_001762	AAT	4	6756	6769	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466053
17	NC_001762	ATA	5	6955	6969	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_001762	TAA	4	6989	7001	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_001762	TAA	4	7044	7055	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_001762	ATT	4	7104	7114	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_001762	ATA	4	7123	7133	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_001762	ATA	4	7341	7352	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466054
23	NC_001762	TAA	5	7369	7383	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466054
24	NC_001762	ATA	4	7615	7625	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466054
25	NC_001762	ATA	4	7850	7860	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466054
26	NC_001762	TAT	4	8586	8596	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_001762	AAT	7	8639	8658	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
28	NC_001762	AAT	4	8671	8683	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_001762	TAA	4	9761	9772	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466056
30	NC_001762	TAA	4	9932	9943	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466056
31	NC_001762	TAA	4	10105	10115	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466057
32	NC_001762	TAT	5	10660	10673	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466057
33	NC_001762	ATT	4	10847	10857	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466057
34	NC_001762	ATT	4	11668	11680	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466057
35	NC_001762	TAT	4	11934	11946	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466057
36	NC_001762	ATA	4	12406	12417	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_001762	ATA	4	12431	12443	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_001762	TAA	4	13450	13462	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_001762	TAT	4	13466	13477	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_001762	ATT	4	14351	14362	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_001762	TTC	5	16454	16468	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	11466058
42	NC_001762	TAT	8	16694	16716	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_001762	TAA	4	16720	16730	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_001762	AAT	4	16772	16784	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466059
45	NC_001762	ATC	4	16802	16813	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11466059
46	NC_001762	TAT	4	16862	16873	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466059
47	NC_001762	ATA	5	16930	16944	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466059
48	NC_001762	ATA	6	17080	17096	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11466059
49	NC_001762	TAT	4	17176	17187	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466059
50	NC_001762	ATT	5	17294	17307	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466059
51	NC_001762	AAT	4	17327	17338	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466059
52	NC_001762	TTA	4	17352	17362	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466059
53	NC_001762	TAA	4	17426	17437	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466059
54	NC_001762	TAT	4	17452	17464	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466059
55	NC_001762	TAT	4	17512	17522	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466059
56	NC_001762	TAA	7	17642	17662	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11466059
57	NC_001762	TAT	8	17674	17697	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466059
58	NC_001762	TAA	7	17806	17827	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466059
59	NC_001762	TAA	6	17915	17932	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11466059
60	NC_001762	ATT	4	18012	18023	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11466059
61	NC_001762	TTA	4	18117	18129	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466059
62	NC_001762	ATA	15	18187	18230	44	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466059
63	NC_001762	TAT	4	18421	18432	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466059
64	NC_001762	TAA	4	18532	18544	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466060
65	NC_001762	ATA	4	18871	18882	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466060
66	NC_001762	ATT	4	18894	18905	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_001762	TAT	4	18950	18961	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_001762	ATA	4	18966	18978	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_001762	TAA	5	19363	19377	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11466061
70	NC_001762	ATA	5	19389	19402	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466061
71	NC_001762	TAA	4	19511	19522	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466061
72	NC_001762	ATA	5	19707	19721	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466061
73	NC_001762	TAA	7	19826	19846	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466061
74	NC_001762	TAA	6	19853	19869	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11466061
75	NC_001762	ATA	4	19978	19990	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466061
76	NC_001762	TAA	5	20203	20218	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466061
77	NC_001762	TAT	4	20473	20483	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466061
78	NC_001762	ATT	4	20759	20770	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11466061
79	NC_001762	AAT	4	21028	21039	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_001762	TTA	4	21262	21272	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466062
81	NC_001762	TAT	4	22158	22168	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466063
82	NC_001762	CTG	4	22394	22405	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466063
83	NC_001762	ATA	4	22659	22671	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_001762	ATA	4	22886	22896	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466064
85	NC_001762	TAA	7	23042	23062	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466064
86	NC_001762	ATA	4	23179	23191	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466064
87	NC_001762	ATA	8	23247	23271	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466064
88	NC_001762	TAA	7	23771	23792	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	11466064
89	NC_001762	TAA	4	23882	23894	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466064
90	NC_001762	TAA	4	24428	24439	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466065
91	NC_001762	TAT	4	24765	24777	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_001762	ATA	5	24828	24841	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_001762	TAA	4	27422	27433	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466066

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pichia canadensis mitochondrion