ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pichia canadensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001762	AAAT	3	273	284	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_001762	TAAA	3	334	345	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_001762	AACT	3	467	478	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_001762	TA	8	517	533	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_001762	TTAA	3	649	661	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_001762	AT	6	662	672	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_001762	ATTAAT	4	782	805	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_001762	TAAT	3	910	921	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001762	ATA	4	970	981	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_001762	TTA	4	979	990	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_001762	AT	13	1035	1060	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_001762	AATTTA	5	1146	1175	30	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_001762	AT	6	1197	1210	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_001762	TTA	5	1829	1843	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466049
15	NC_001762	AGG	4	1912	1923	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	11466049
16	NC_001762	AATT	3	2022	2032	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466049
17	NC_001762	TAAATT	3	2038	2055	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11466049
18	NC_001762	TA	7	2059	2071	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466049
19	NC_001762	ATT	4	2619	2629	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466049
20	NC_001762	AAAT	3	2665	2675	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466049
21	NC_001762	TA	6	2938	2948	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466049
22	NC_001762	AT	12	3908	3931	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_001762	TAA	4	3940	3951	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_001762	ATA	4	4020	4031	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_001762	TTA	4	4181	4192	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466051
26	NC_001762	TAA	6	4272	4289	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_001762	AT	6	4300	4311	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_001762	AT	14	4341	4368	28	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
29	NC_001762	TAA	6	4375	4391	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_001762	AAAAAT	3	4422	4439	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_001762	TTTATA	3	4738	4755	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11466052
32	NC_001762	ATTA	3	5207	5219	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466052
33	NC_001762	TA	6	5221	5233	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_001762	TA	8	5270	5284	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_001762	AT	7	5286	5299	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_001762	TA	6	5376	5389	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_001762	TTATAT	3	5430	5448	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
38	NC_001762	AT	17	5551	5583	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_001762	TATT	4	5688	5702	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_001762	ATT	5	5697	5712	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_001762	AT	6	5900	5910	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_001762	AT	6	6220	6231	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_001762	TA	12	6289	6311	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_001762	AT	6	6486	6497	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466053
45	NC_001762	TA	6	6535	6545	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466053
46	NC_001762	TAT	4	6559	6570	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466053
47	NC_001762	ATA	4	6661	6671	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466053
48	NC_001762	TAA	5	6685	6699	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466053
49	NC_001762	AT	6	6727	6737	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466053
50	NC_001762	ATA	4	6742	6755	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466053
51	NC_001762	AAT	4	6756	6769	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466053
52	NC_001762	ATA	5	6955	6969	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_001762	A	16	6969	6984	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_001762	TAA	4	6989	7001	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_001762	TAA	4	7044	7055	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_001762	ATT	4	7104	7114	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_001762	ATA	4	7123	7133	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_001762	ATA	4	7341	7352	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466054
59	NC_001762	TAA	5	7369	7383	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466054
60	NC_001762	ATA	4	7615	7625	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466054
61	NC_001762	ATA	4	7850	7860	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466054
62	NC_001762	ATCT	3	8039	8049	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11466054
63	NC_001762	TTTA	3	8138	8148	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466054
64	NC_001762	TA	7	8256	8271	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_001762	TA	6	8282	8295	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_001762	AT	12	8375	8397	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_001762	TA	6	8560	8570	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_001762	TAT	4	8586	8596	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_001762	AAT	7	8639	8658	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
70	NC_001762	AT	7	8657	8669	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_001762	AAT	4	8671	8683	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_001762	TA	8	8693	8707	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_001762	AT	9	8713	8729	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_001762	AAAT	3	8730	8745	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_001762	ATAAA	3	8766	8780	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_001762	TTAA	3	9593	9604	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466055
77	NC_001762	TAAAA	3	9662	9676	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_001762	TAAT	4	9691	9706	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_001762	TAAT	3	9716	9726	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_001762	TAA	4	9761	9772	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466056
81	NC_001762	TAA	4	9932	9943	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466056
82	NC_001762	TAA	4	10105	10115	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466057
83	NC_001762	AT	7	10586	10601	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11466057
84	NC_001762	TAT	5	10660	10673	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466057
85	NC_001762	ATT	4	10847	10857	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466057
86	NC_001762	ATGT	3	11013	11023	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11466057
87	NC_001762	TTTA	3	11041	11051	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466057
88	NC_001762	AT	6	11140	11151	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466057
89	NC_001762	TTTA	3	11254	11265	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466057
90	NC_001762	AT	6	11298	11309	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466057
91	NC_001762	ATTTAA	3	11401	11418	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11466057
92	NC_001762	TTTA	3	11533	11544	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	11466057
93	NC_001762	ATT	4	11668	11680	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466057
94	NC_001762	TTAA	3	11871	11883	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466057
95	NC_001762	TAT	4	11934	11946	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466057
96	NC_001762	TA	9	12082	12099	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_001762	ATAAAA	4	12287	12310	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_001762	AT	10	12309	12329	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_001762	ATA	4	12406	12417	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_001762	ATA	4	12431	12443	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_001762	AT	7	12666	12678	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_001762	TA	6	12709	12719	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_001762	TAAA	3	12723	12733	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_001762	AT	6	12868	12878	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_001762	AT	11	12884	12906	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_001762	A	16	13373	13388	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_001762	TAAA	3	13393	13403	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_001762	TAA	4	13450	13462	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_001762	TAT	4	13466	13477	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_001762	TA	6	13923	13933	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_001762	AAAAT	5	14123	14146	24	80 %	20 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_001762	TTAT	3	14191	14202	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_001762	ATT	4	14351	14362	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_001762	ATATT	3	14556	14569	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_001762	TA	6	14724	14736	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_001762	AT	14	14742	14768	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_001762	AT	12	14859	14882	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_001762	TTAT	3	15033	15044	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_001762	AT	7	15186	15198	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_001762	AT	14	15222	15249	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_001762	TA	6	15325	15336	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_001762	AT	7	15341	15354	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_001762	TGTA	3	15751	15762	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	11466058
124	NC_001762	TTC	5	16454	16468	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	11466058
125	NC_001762	TAAT	4	16636	16651	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11466058
126	NC_001762	AT	7	16685	16699	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_001762	TAT	8	16694	16716	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_001762	TAA	4	16720	16730	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_001762	AAT	4	16772	16784	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466059
130	NC_001762	ATC	4	16802	16813	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11466059
131	NC_001762	TAT	4	16862	16873	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466059
132	NC_001762	TA	6	16885	16896	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466059
133	NC_001762	AT	6	16910	16920	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466059
134	NC_001762	ATA	5	16930	16944	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466059
135	NC_001762	AT	6	16951	16964	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466059
136	NC_001762	AT	8	16993	17007	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11466059
137	NC_001762	ATA	6	17080	17096	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11466059
138	NC_001762	AT	7	17131	17145	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11466059
139	NC_001762	TAT	4	17176	17187	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466059
140	NC_001762	TA	6	17242	17252	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466059
141	NC_001762	ATT	5	17294	17307	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466059
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164	NC_001762	TAT	4	18950	18961	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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182	NC_001762	TAAT	5	20913	20933	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
183	NC_001762	AAT	4	21028	21039	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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186	NC_001762	TA	14	21708	21733	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
187	NC_001762	TAAA	3	21780	21791	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_001762	AAAATA	3	22765	22782	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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210	NC_001762	AAAT	3	25170	25181	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
211	NC_001762	AAAAAT	3	25299	25317	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
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213	NC_001762	TA	6	25416	25426	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
214	NC_001762	AACTT	3	26053	26067	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
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216	NC_001762	TA	6	26149	26161	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
217	NC_001762	TA	6	26292	26303	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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219	NC_001762	TA	6	26721	26732	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
220	NC_001762	ATAA	3	26827	26842	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	11466066
221	NC_001762	AAAT	3	26854	26864	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466066
222	NC_001762	TTAT	3	27266	27277	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466066
223	NC_001762	ATTTAA	3	27382	27400	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	11466066
224	NC_001762	TAA	4	27422	27433	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466066

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pichia canadensis mitochondrion