ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Allomyces macrogynus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001715	TTC	4	4071	4081	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_001715	TTC	4	6341	6353	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11467574
3	NC_001715	AGT	4	6428	6439	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467574
4	NC_001715	ATT	4	9926	9940	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11467574
5	NC_001715	ATT	4	11788	11799	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467574
6	NC_001715	CTT	4	11890	11902	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11467574
7	NC_001715	CAA	4	13365	13376	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11467580
8	NC_001715	ATT	4	13421	13432	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467580
9	NC_001715	CTT	5	14680	14694	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
10	NC_001715	ATT	4	16366	16378	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11467581
11	NC_001715	ATA	4	21207	21217	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_001715	ATT	4	21590	21600	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467585
13	NC_001715	TCT	4	25009	25019	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11467587
14	NC_001715	TCT	4	27264	27275	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11467587
15	NC_001715	GTA	4	28602	28613	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467587
16	NC_001715	TTA	6	28721	28738	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11467587
17	NC_001715	TAA	4	29690	29700	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467587
18	NC_001715	TAT	4	31497	31509	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11467587
19	NC_001715	ATT	4	32470	32481	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467587
20	NC_001715	GAC	4	34527	34538	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_001715	TAT	4	36750	36761	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467591
22	NC_001715	TAT	4	40033	40045	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_001715	TAT	4	46411	46421	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467595
24	NC_001715	TAA	4	49787	49797	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467596
25	NC_001715	TCT	4	50732	50743	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11467596
26	NC_001715	TAT	4	51506	51516	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467598
27	NC_001715	TAT	4	52441	52452	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467599
28	NC_001715	ATT	4	52588	52599	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467600
29	NC_001715	GAT	4	52716	52728	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	11467600
30	NC_001715	TTA	4	54093	54103	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467602

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Allomyces macrogynus mitochondrion