ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Allomyces macrogynus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001715	AC	6	403	413	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
2	NC_001715	TTC	4	4071	4081	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_001715	GGAA	3	4814	4824	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_001715	ATAA	3	4931	4941	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_001715	TTC	4	6341	6353	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11467574
6	NC_001715	AGT	4	6428	6439	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467574
7	NC_001715	CAATT	3	8360	8373	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	11467574
8	NC_001715	CATAT	3	9785	9798	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	11467574
9	NC_001715	ATT	4	9926	9940	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11467574
10	NC_001715	ATT	4	11788	11799	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467574
11	NC_001715	CTT	4	11890	11902	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11467574
12	NC_001715	AATT	4	12215	12230	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11467579
13	NC_001715	CAA	4	13365	13376	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11467580
14	NC_001715	ATT	4	13421	13432	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467580
15	NC_001715	CTT	5	14680	14694	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
16	NC_001715	TTCAAT	3	15254	15271	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	11467581
17	NC_001715	ATTA	3	16102	16113	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467581
18	NC_001715	ATT	4	16366	16378	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11467581
19	NC_001715	CAATG	3	16816	16829	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	11467581
20	NC_001715	TATT	3	17063	17074	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467581
21	NC_001715	GTGG	3	18567	18577	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	11467581
22	NC_001715	GGGT	3	19891	19901	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_001715	G	12	20134	20145	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001715	CTTA	3	21019	21029	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11467584
25	NC_001715	ATA	4	21207	21217	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_001715	ATT	4	21590	21600	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467585
27	NC_001715	TCT	4	25009	25019	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11467587
28	NC_001715	TGGT	3	25825	25836	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	11467587
29	NC_001715	TTAC	3	26887	26898	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11467587
30	NC_001715	TCT	4	27264	27275	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11467587
31	NC_001715	AT	6	27303	27313	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467587
32	NC_001715	CA	6	28399	28409	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	11467587
33	NC_001715	GTA	4	28602	28613	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467587
34	NC_001715	TTA	6	28721	28738	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11467587
35	NC_001715	TA	7	29655	29668	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11467587
36	NC_001715	TAA	4	29690	29700	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467587
37	NC_001715	TTCT	3	29989	29999	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11467587
38	NC_001715	TAT	4	31497	31509	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11467587
39	NC_001715	ATT	4	32470	32481	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467587
40	NC_001715	C	12	32657	32668	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	11467587
41	NC_001715	TATT	3	33865	33876	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467587
42	NC_001715	CG	11	33992	34012	21	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	11467587
43	NC_001715	GAC	4	34527	34538	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_001715	CG	6	35230	35241	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
45	NC_001715	GC	6	35261	35271	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_001715	ACCC	3	35588	35600	13	25 %	0 %	0 %	75 %	7 %	Non-Coding
47	NC_001715	GTTT	3	36314	36324	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11467591
48	NC_001715	ATTTT	3	36410	36423	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11467591
49	NC_001715	TAT	4	36750	36761	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467591
50	NC_001715	CTCG	3	37036	37048	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
51	NC_001715	TCAG	3	39523	39534	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_001715	TAT	4	40033	40045	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_001715	TAAA	3	40104	40115	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_001715	GGGT	3	41493	41503	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_001715	G	14	42059	42072	14	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_001715	GAAG	3	42578	42589	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_001715	TATT	3	42715	42726	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467594
58	NC_001715	ATTC	3	43719	43730	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11467594
59	NC_001715	TCAAAT	3	43923	43940	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	0 %	11467594
60	NC_001715	CTTT	3	45649	45660	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001715	TAT	4	46411	46421	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467595
62	NC_001715	TTCA	3	46537	46547	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11467595
63	NC_001715	TA	6	49378	49389	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467596
64	NC_001715	TAA	4	49787	49797	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467596
65	NC_001715	AATC	3	50017	50028	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11467596
66	NC_001715	TCT	4	50732	50743	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11467596
67	NC_001715	TAT	4	51506	51516	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467598
68	NC_001715	TAT	4	52441	52452	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467599
69	NC_001715	ATTT	3	52567	52577	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467600
70	NC_001715	ATT	4	52588	52599	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467600
71	NC_001715	GAT	4	52716	52728	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	11467600
72	NC_001715	TTAT	3	53873	53884	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467602
73	NC_001715	TTA	4	54093	54103	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467602
74	NC_001715	AG	7	54467	54480	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_001715	CATG	3	56876	56886	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Allomyces macrogynus mitochondrion