ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Odontella sinensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001713	TAT	4	396	407	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_001713	TTA	4	1875	1886	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_001713	TTG	4	14965	14977	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	11467443
4	NC_001713	TAA	4	17876	17886	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_001713	TAA	4	18180	18190	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467449
6	NC_001713	ATA	4	21073	21085	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11467453
7	NC_001713	CAA	4	21561	21572	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	11467454
8	NC_001713	CTT	4	23049	23059	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11467457
9	NC_001713	TCA	4	23438	23449	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	126022787
10	NC_001713	AAT	4	25930	25941	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	12751545
11	NC_001713	AGG	4	26715	26726	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	11467466
12	NC_001713	CAC	4	27594	27605	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11467468
13	NC_001713	TTG	4	32287	32298	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467473
14	NC_001713	TAA	4	33049	33059	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467473
15	NC_001713	TAT	4	33868	33880	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_001713	AAT	4	34834	34845	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_001713	GTA	4	35160	35170	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11467475
18	NC_001713	ATT	4	36052	36066	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11467476
19	NC_001713	TCT	4	37689	37699	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11467479
20	NC_001713	GCT	4	37961	37972	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467479
21	NC_001713	TAT	4	39013	39023	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467480
22	NC_001713	TGT	4	39459	39469	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11467480
23	NC_001713	TAA	4	40498	40509	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467481
24	NC_001713	AAT	4	40933	40944	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467481
25	NC_001713	ATT	4	41353	41364	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_001713	ATA	4	45747	45758	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467486
27	NC_001713	GAA	4	52336	52347	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_001713	TAA	4	52473	52484	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_001713	ATA	4	53952	53963	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_001713	ATT	4	56463	56473	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_001713	TAA	4	58120	58130	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_001713	ATA	5	58346	58360	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11467496
33	NC_001713	ATT	4	60091	60103	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11467496
34	NC_001713	CAA	4	61795	61806	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11467499
35	NC_001713	CAA	4	65983	65993	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	11467505
36	NC_001713	TAT	4	66473	66484	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_001713	ATT	4	71722	71733	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467511
38	NC_001713	CTG	4	72243	72254	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467512
39	NC_001713	TGT	4	74480	74491	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467516
40	NC_001713	TAT	4	78539	78550	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_001713	TGT	4	79082	79092	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11467524
42	NC_001713	AAT	4	81930	81942	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11467528
43	NC_001713	TGA	4	82549	82560	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467529
44	NC_001713	AGA	4	83405	83416	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11467531
45	NC_001713	AAT	4	85476	85488	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11467537
46	NC_001713	CAG	4	87225	87236	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	193735612
47	NC_001713	AAG	4	87272	87283	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	193735612
48	NC_001713	TAA	4	88053	88065	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	193735612
49	NC_001713	AAT	4	89472	89483	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467543
50	NC_001713	TTA	4	90233	90244	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467545
51	NC_001713	TAT	4	90319	90330	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_001713	ATA	4	90628	90638	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_001713	TAT	4	92735	92746	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_001713	TTA	4	93446	93456	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467551
55	NC_001713	TGG	4	95604	95614	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	11467554
56	NC_001713	ATA	4	98318	98329	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467559
57	NC_001713	AAT	4	100230	100242	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11467561
58	NC_001713	TTA	5	102830	102843	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_001713	GAT	4	105817	105828	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467566
60	NC_001713	AAG	4	114514	114525	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11467570
61	NC_001713	ACC	4	115477	115488	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11467571
62	NC_001713	ATA	5	116739	116752	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11467571
63	NC_001713	GTT	4	119470	119481	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467572

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Odontella sinensis chloroplast