ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Odontella sinensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001713	TAT	4	396	407	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_001713	TTA	4	1875	1886	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_001713	ATTT	3	1942	1952	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_001713	GAAA	3	3172	3182	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_001713	AGCG	3	4210	4220	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_001713	AGGT	3	5615	5626	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_001713	TTCA	3	7063	7074	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
8	NC_001713	ATTT	3	7496	7506	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_001713	AATA	3	8910	8920	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467437
10	NC_001713	TTCT	3	10942	10952	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11467441
11	NC_001713	TTGC	3	12396	12406	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	11467441
12	NC_001713	TTTC	3	13057	13068	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11467441
13	NC_001713	TA	6	13897	13908	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_001713	TTG	4	14965	14977	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	11467443
15	NC_001713	TTAA	3	15831	15841	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467444
16	NC_001713	ACTA	3	16240	16251	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11467444
17	NC_001713	AT	7	17424	17436	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_001713	T	13	17821	17833	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11467448
19	NC_001713	TAA	4	17876	17886	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_001713	TATT	3	18013	18025	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11467449
21	NC_001713	TAA	4	18180	18190	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467449
22	NC_001713	TAAA	3	20192	20202	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467453
23	NC_001713	TTAA	3	20813	20824	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467453
24	NC_001713	TAAA	3	20934	20946	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11467453
25	NC_001713	ATA	4	21073	21085	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11467453
26	NC_001713	CAA	4	21561	21572	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	11467454
27	NC_001713	TTTTTA	3	22123	22140	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	11467455
28	NC_001713	TTTA	3	22192	22203	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_001713	ATTTTT	3	22208	22226	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	11467456
30	NC_001713	CTT	4	23049	23059	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11467457
31	NC_001713	TCA	4	23438	23449	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	126022787
32	NC_001713	TGAA	3	23975	23985	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11467459
33	NC_001713	AAT	4	25930	25941	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	12751545
34	NC_001713	AGG	4	26715	26726	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	11467466
35	NC_001713	CAC	4	27594	27605	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11467468
36	NC_001713	TTGTA	3	29794	29808	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	126022788
37	NC_001713	AT	8	29960	29975	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_001713	TAAA	3	30033	30043	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_001713	ATTT	3	30172	30183	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_001713	AATTA	3	30185	30198	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_001713	ACAA	3	30339	30350	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11467472
42	NC_001713	AAAG	3	31776	31786	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11467472
43	NC_001713	TTG	4	32287	32298	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467473
44	NC_001713	TAA	4	33049	33059	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467473
45	NC_001713	TAT	4	33868	33880	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_001713	AAT	4	34834	34845	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_001713	GTA	4	35160	35170	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11467475
48	NC_001713	AAAG	3	35512	35522	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11467476
49	NC_001713	AAGC	3	35960	35970	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11467476
50	NC_001713	ATT	4	36052	36066	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11467476
51	NC_001713	ATAA	3	37098	37109	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_001713	TCT	4	37689	37699	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11467479
53	NC_001713	TGAA	3	37788	37798	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11467479
54	NC_001713	GCT	4	37961	37972	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467479
55	NC_001713	TAT	4	39013	39023	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467480
56	NC_001713	TGT	4	39459	39469	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11467480
57	NC_001713	TAA	4	40498	40509	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467481
58	NC_001713	AAT	4	40933	40944	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467481
59	NC_001713	ATT	4	41353	41364	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_001713	TAAA	3	41611	41622	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467483
61	NC_001713	GTTT	3	42105	42116	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11467483
62	NC_001713	TTTA	3	44537	44548	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467485
63	NC_001713	TAAA	3	45432	45443	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_001713	AAGA	3	45463	45473	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_001713	ATA	4	45747	45758	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467486
66	NC_001713	T	12	45876	45887	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11467486
67	NC_001713	ATTT	3	46885	46895	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_001713	TTAC	3	47535	47547	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
69	NC_001713	ATTT	3	48765	48775	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_001713	CTTT	3	51176	51186	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_001713	ATTTTT	3	52158	52176	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
72	NC_001713	GAA	4	52336	52347	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_001713	AAAT	3	52407	52417	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_001713	TAA	4	52473	52484	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_001713	TAAA	3	53333	53345	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11467489
76	NC_001713	ATA	4	53952	53963	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_001713	TTTTA	3	54204	54218	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_001713	TTCA	3	54425	54436	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
79	NC_001713	AAAT	3	54789	54799	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_001713	TTTAA	3	55131	55144	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	11467491
81	NC_001713	ATT	4	56463	56473	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_001713	GTTTT	3	56743	56756	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	11467492
83	NC_001713	TAA	4	58120	58130	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_001713	GTTT	3	58264	58275	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_001713	ATA	5	58346	58360	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11467496
86	NC_001713	ATT	4	60091	60103	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11467496
87	NC_001713	AAAT	3	60748	60759	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_001713	CAA	4	61795	61806	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11467499
89	NC_001713	T	13	62689	62701	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_001713	TAAA	3	65340	65351	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_001713	ATTTT	3	65743	65756	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11467504
92	NC_001713	CAA	4	65983	65993	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	11467505
93	NC_001713	TAT	4	66473	66484	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_001713	TA	11	66531	66552	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_001713	TTAA	3	68837	68848	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_001713	ATTT	3	70391	70401	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467509
97	NC_001713	ATT	4	71722	71733	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467511
98	NC_001713	CTG	4	72243	72254	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467512
99	NC_001713	AATT	3	73630	73641	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467514
100	NC_001713	CAAA	3	73873	73884	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11467515
101	NC_001713	TGT	4	74480	74491	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467516
102	NC_001713	TTTA	3	75038	75049	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467516
103	NC_001713	TAAA	3	75903	75913	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_001713	TTTA	3	77743	77754	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467519
105	NC_001713	AATT	3	78182	78193	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_001713	TTAA	3	78341	78351	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467521
107	NC_001713	TAT	4	78539	78550	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_001713	TGT	4	79082	79092	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11467524
109	NC_001713	TA	9	79356	79372	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
110	NC_001713	AT	7	79418	79431	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_001713	T	14	80076	80089	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11467526
112	NC_001713	AAT	4	81930	81942	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11467528
113	NC_001713	TCTG	3	82301	82311	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	11467529
114	NC_001713	TGA	4	82549	82560	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467529
115	NC_001713	AT	7	82734	82746	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_001713	AGA	4	83405	83416	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11467531
117	NC_001713	ATTT	3	84455	84465	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467536
118	NC_001713	TACA	3	84719	84729	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11467537
119	NC_001713	AAT	4	85476	85488	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11467537
120	NC_001713	GTTA	3	86585	86595	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_001713	CAG	4	87225	87236	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	193735612
122	NC_001713	AAG	4	87272	87283	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	193735612
123	NC_001713	TAA	4	88053	88065	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	193735612
124	NC_001713	AAT	4	89472	89483	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467543
125	NC_001713	TA	6	90124	90135	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_001713	TTA	4	90233	90244	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467545
127	NC_001713	TAT	4	90319	90330	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_001713	ATA	4	90628	90638	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_001713	TA	6	90675	90685	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_001713	TAAA	3	91938	91948	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_001713	TAT	4	92735	92746	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_001713	ACGT	3	93173	93183	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11467551
133	NC_001713	TTA	4	93446	93456	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467551
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Odontella sinensis chloroplast