ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Drosophila melanogaster mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001709	ATA	4	379	390	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5835234
2	NC_001709	T	13	840	852	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	5835234
3	NC_001709	ATA	4	1068	1079	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5835234
4	NC_001709	ATAAAT	3	1161	1178	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	5835234
5	NC_001709	AT	6	1192	1204	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	5835234
6	NC_001709	TTTAT	3	1244	1258	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	5835234
7	NC_001709	TAT	6	2043	2059	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	5835235
8	NC_001709	GAG	4	2136	2146	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	5835235
9	NC_001709	TTTA	3	3328	3340	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	5835236
10	NC_001709	ATT	7	3930	3951	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	5835237
11	NC_001709	TTAA	3	4117	4128	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	5835238
12	NC_001709	TTAAT	3	4296	4310	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	5835238
13	NC_001709	TTTAAC	4	4355	4378	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	5835238
14	NC_001709	TTA	4	4650	4661	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835238
15	NC_001709	TTTAT	3	4990	5003	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	5835239
16	NC_001709	ATT	4	5785	5796	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835240
17	NC_001709	ATT	4	5839	5850	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835240
18	NC_001709	TA	12	5959	5981	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	5835240
19	NC_001709	CTTT	3	6214	6224	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_001709	ATTTAT	3	6240	6257	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_001709	TAA	4	6289	6299	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_001709	ATA	4	6444	6456	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	5835241
23	NC_001709	ATT	4	6469	6481	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	5835241
24	NC_001709	TACAA	3	6733	6746	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	5835241
25	NC_001709	TTA	4	7278	7289	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835241
26	NC_001709	ATA	5	7383	7397	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	5835241
27	NC_001709	AAG	4	7527	7538	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	5835241
28	NC_001709	AAAT	3	8121	8132	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	5835241
29	NC_001709	AACT	3	8836	8846	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	5835242
30	NC_001709	AAAT	3	8991	9003	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	5835242
31	NC_001709	AAAT	3	9110	9120	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	5835242
32	NC_001709	AAAAT	3	9199	9212	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	5835242
33	NC_001709	AAT	8	9246	9268	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5835242
34	NC_001709	TAA	4	9272	9283	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5835242
35	NC_001709	TTA	4	9288	9299	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835242
36	NC_001709	TAA	4	9323	9334	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5835242
37	NC_001709	AT	6	9482	9492	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	5835242
38	NC_001709	A	13	9522	9534	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	5835242
39	NC_001709	TAAA	5	9685	9705	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	5835243
40	NC_001709	TAAAA	3	9787	9800	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	5835243
41	NC_001709	TTAATT	4	10237	10260	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835244
42	NC_001709	CTT	4	10283	10294	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5835244
43	NC_001709	AATT	3	11891	11902	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	5835246
44	NC_001709	A	15	12145	12159	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	5835246
45	NC_001709	TAAA	3	12179	12190	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	5835246
46	NC_001709	TAA	4	12616	12628	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	5835246
47	NC_001709	TAAA	3	13198	13208	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_001709	TTA	4	13466	13477	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_001709	ATTA	4	13664	13679	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_001709	TAT	5	14382	14396	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_001709	TAT	4	14668	14679	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_001709	ATTTTT	3	14917	14935	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_001709	ATA	4	15052	15062	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_001709	TAA	4	15165	15177	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_001709	AAAT	3	15372	15383	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_001709	AT	8	15535	15549	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_001709	TA	33	15624	15687	64	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_001709	ATTTAT	4	15896	15919	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_001709	AT	12	15906	15930	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_001709	TA	13	16000	16024	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_001709	TTAA	3	16172	16183	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_001709	TA	9	16248	16265	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_001709	TA	16	16339	16370	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_001709	ATTTAT	4	16579	16602	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_001709	AT	12	16589	16613	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_001709	TA	13	16683	16707	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_001709	TTAA	3	16855	16866	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_001709	TA	9	16931	16948	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_001709	TA	16	17022	17053	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_001709	TA	15	17216	17243	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_001709	TAA	4	17267	17279	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_001709	ATT	4	17313	17324	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_001709	TAA	4	17329	17341	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_001709	TAA	4	17345	17357	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_001709	TAA	4	17391	17402	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_001709	T	24	17404	17427	24	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
77	NC_001709	AT	11	17481	17501	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_001709	TAAA	3	17601	17611	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_001709	ATTT	3	17651	17662	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001709	TA	8	17747	17762	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_001709	TATT	4	17852	17866	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_001709	ATATA	3	17877	17890	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_001709	AT	12	17943	17965	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_001709	TAAA	3	18065	18075	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_001709	ATTT	3	18115	18126	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001709	TA	8	18211	18226	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_001709	TATT	4	18316	18330	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_001709	ATATA	3	18341	18354	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_001709	AT	12	18407	18429	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_001709	TAAA	3	18529	18539	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_001709	ATTT	3	18579	18590	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001709	TA	8	18675	18690	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_001709	TATT	4	18780	18794	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_001709	ATATA	3	18805	18818	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_001709	AT	12	18871	18893	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_001709	ATTT	3	19043	19054	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001709	TA	8	19139	19154	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_001709	TATT	4	19244	19258	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_001709	ATATA	3	19269	19282	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_001709	TA	14	19330	19356	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_001709	A	24	19478	19501	24	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
102	NC_001709	ATT	4	19507	19517	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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