ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cyanophora paradoxa cyanelle

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001675	TAT	5	5394	5408	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_001675	GTA	4	5784	5795	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	126165882
3	NC_001675	ATT	4	7937	7948	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_001675	TCA	4	9197	9208	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11467284
5	NC_001675	TGT	5	9388	9402	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	11467284
6	NC_001675	TAT	4	10076	10087	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_001675	TAA	4	10120	10134	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_001675	TAA	4	16420	16430	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_001675	TGG	4	17094	17105	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	11467293
10	NC_001675	TAA	4	21986	21997	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467296
11	NC_001675	TAT	4	23860	23871	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467299
12	NC_001675	TAA	4	24035	24046	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_001675	ATA	4	24069	24079	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_001675	TAT	4	24105	24117	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_001675	GTA	4	25516	25527	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467301
16	NC_001675	AAG	4	28689	28700	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11467303
17	NC_001675	TAA	4	31459	31469	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467306
18	NC_001675	CAA	4	31716	31727	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11467306
19	NC_001675	AAT	4	34843	34855	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_001675	GAA	4	35114	35125	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11467311
21	NC_001675	TAA	4	36262	36273	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_001675	AGT	4	38774	38786	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	11467316
23	NC_001675	TAT	4	38946	38957	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_001675	ATT	4	40176	40187	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_001675	AGT	4	44877	44887	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_001675	TAA	4	45717	45728	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467328
27	NC_001675	AGC	4	47331	47341	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11467329
28	NC_001675	CAG	4	47782	47793	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467329
29	NC_001675	GCA	4	50319	50330	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467332
30	NC_001675	CTT	4	51377	51387	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11467334
31	NC_001675	GTT	4	53239	53249	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11467338
32	NC_001675	CAA	4	53765	53776	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11467339
33	NC_001675	CAC	4	54868	54879	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11467342
34	NC_001675	GGT	4	56896	56907	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	11467345
35	NC_001675	CAA	4	57182	57192	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	11467346
36	NC_001675	TAA	4	57963	57974	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_001675	TAA	8	58021	58044	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
38	NC_001675	AGA	4	62118	62128	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11467353
39	NC_001675	AAT	4	62875	62885	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467354
40	NC_001675	ATT	4	64065	64076	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_001675	TTC	4	65132	65143	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11467357
42	NC_001675	ATT	4	65702	65713	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467357
43	NC_001675	ATA	4	69352	69363	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467362
44	NC_001675	TTG	4	70906	70917	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467365
45	NC_001675	TAA	4	76861	76872	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467371
46	NC_001675	TAA	4	79374	79384	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467372
47	NC_001675	TCT	4	82968	82979	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11467373
48	NC_001675	CTT	4	83737	83748	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11467373
49	NC_001675	TAA	4	85727	85738	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_001675	TTA	4	86629	86641	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_001675	TTA	4	87340	87351	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467377
52	NC_001675	ATT	5	87514	87528	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_001675	ATT	17	88056	88106	51	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_001675	TAT	4	88143	88154	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_001675	ATA	4	88910	88921	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_001675	TAA	4	88923	88934	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_001675	TAT	4	89102	89113	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_001675	AAG	4	89904	89914	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11467381
59	NC_001675	TAA	7	90631	90652	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_001675	TAA	4	90843	90854	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_001675	CTG	6	92597	92614	18	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	5 %	11467383
62	NC_001675	TAA	4	96557	96567	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_001675	TTC	4	100114	100125	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	193735608
64	NC_001675	TTG	4	101576	101587	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467395
65	NC_001675	ATT	7	102520	102541	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_001675	TAT	4	105606	105616	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_001675	TGG	4	106146	106156	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	11467403
68	NC_001675	TAT	4	107387	107398	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_001675	TAA	4	107431	107445	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_001675	ACA	5	108115	108129	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	11467406
71	NC_001675	ATG	4	108311	108322	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467406
72	NC_001675	TAC	4	111722	111733	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	126165885
73	NC_001675	TAA	5	112098	112112	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_001675	ATA	5	112109	112123	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_001675	TAA	4	118180	118191	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467409
76	NC_001675	TAA	4	118333	118345	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11467409
77	NC_001675	TAA	4	119518	119529	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467410
78	NC_001675	ATT	7	121777	121797	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_001675	TAT	9	121800	121825	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_001675	TAT	5	121914	121927	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_001675	AAT	4	122479	122489	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467414
82	NC_001675	GCT	4	122614	122625	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467414
83	NC_001675	TAA	4	124496	124507	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11467416
84	NC_001675	TAT	4	125929	125940	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_001675	TAA	4	126603	126613	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_001675	ATT	4	126842	126852	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_001675	ATT	4	127010	127021	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_001675	GCT	4	128323	128334	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467422
89	NC_001675	GCT	4	128591	128602	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467423
90	NC_001675	TAA	4	128933	128943	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_001675	TTA	4	128976	128987	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_001675	ATT	4	131425	131436	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467427
93	NC_001675	TAA	4	133553	133564	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467429
94	NC_001675	ATA	4	134681	134692	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467430
95	NC_001675	ACA	4	134996	135007	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cyanophora paradoxa cyanelle