ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Rattus norvegicus strain BN/SsNHsdMCW mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_001665TTAA35255351150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
2NC_001665CATA39409511250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
3NC_001665GTTC324632474120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
4NC_001665AGCTA3384438571440 %20 %20 %20 %7 %Non-Coding
5NC_001665TCA4412141321233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %110189716
6NC_001665CAA4457445861366.67 %0 %0 %33.33 %7 %110189716
7NC_001665CAA4482048321366.67 %0 %0 %33.33 %7 %110189716
8NC_001665CAC4484948601233.33 %0 %0 %66.67 %8 %110189716
9NC_001665ATCT3699170021225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
10NC_001665AAC4714371531166.67 %0 %0 %33.33 %9 %110189718
11NC_001665CCCT372357247130 %25 %0 %75 %7 %110189718
12NC_001665TATTT3781678291420 %80 %0 %0 %7 %110189719
13NC_001665ATA4984898591266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
14NC_001665CTTT31165811669120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
15NC_001665GAT412202122121133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %110189725
16NC_001665ATC412910129201133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %110189725
17NC_001665AAT513561135751566.67 %33.33 %0 %0 %6 %110189725
18NC_001665AAAC313782137931275 %0 %0 %25 %8 %110189726
19NC_001665CCAT314790148021325 %25 %0 %50 %7 %110189727