ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Marchantia polymorpha mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001660	TTTG	3	312	322	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_001660	A	13	2435	2447	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_001660	ATT	4	2703	2713	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467099
4	NC_001660	AT	6	3828	3839	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467099
5	NC_001660	GAT	4	4581	4591	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11467099
6	NC_001660	AT	7	6421	6434	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_001660	TAT	4	6928	6938	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467100
8	NC_001660	ATTTT	3	7929	7942	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11467100
9	NC_001660	GGTT	3	9014	9026	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	11467101
10	NC_001660	TGTT	3	9417	9428	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11467101
11	NC_001660	AT	6	10382	10393	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467101
12	NC_001660	AT	6	10585	10596	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467101
13	NC_001660	TTTG	3	11505	11515	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11467101
14	NC_001660	CTTT	3	11699	11709	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11467101
15	NC_001660	ATTTT	3	12816	12830	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_001660	TCAA	3	12877	12888	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
17	NC_001660	TAT	4	13376	13386	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_001660	ATTT	3	13486	13497	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_001660	TA	10	14646	14664	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_001660	TA	9	14704	14720	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_001660	TA	6	14798	14808	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_001660	AT	6	15033	15044	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_001660	ATTT	3	16926	16937	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_001660	AT	6	17136	17147	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_001660	G	15	17161	17175	15	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_001660	AT	7	17329	17342	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_001660	AT	6	18610	18621	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_001660	A	12	18825	18836	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_001660	A	13	20225	20237	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_001660	GAAA	3	21319	21329	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_001660	AAAT	3	21333	21343	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_001660	TCT	4	21356	21367	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_001660	AAG	4	21560	21570	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_001660	ATTT	3	23685	23696	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_001660	AATAA	3	25519	25532	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_001660	AT	6	25888	25899	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_001660	TTGG	3	26106	26117	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_001660	TTTA	3	27186	27196	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_001660	TTA	7	28941	28961	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_001660	G	12	29095	29106	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001660	AT	6	29574	29585	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_001660	A	15	30480	30494	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_001660	AT	7	31420	31433	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_001660	AT	6	31856	31867	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_001660	TC	6	34260	34271	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
46	NC_001660	TA	6	35014	35025	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_001660	AT	6	35065	35076	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_001660	TTTA	3	35083	35094	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001660	TCTA	3	35095	35106	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_001660	ATT	4	35153	35164	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_001660	ACT	4	35471	35481	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_001660	ACTT	3	35673	35683	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_001660	T	12	36834	36845	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11467108
54	NC_001660	TA	6	37291	37301	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_001660	TTTG	3	38346	38356	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_001660	CTTT	3	38540	38550	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_001660	AT	7	40940	40954	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11467110
58	NC_001660	AT	6	40956	40967	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467110
59	NC_001660	TATTT	4	41145	41163	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	11467110
60	NC_001660	ATA	4	42484	42495	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_001660	TAT	5	42500	42513	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_001660	TTTTC	3	43733	43746	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
63	NC_001660	AGAT	3	45150	45161	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001660	AT	6	48724	48735	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_001660	AAAT	3	50028	50040	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_001660	AAAT	3	50313	50323	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_001660	AT	9	51049	51066	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_001660	ACT	4	54513	54524	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_001660	ATAA	3	54717	54728	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_001660	AACC	3	55516	55526	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
71	NC_001660	AT	10	57764	57783	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
72	NC_001660	AATA	4	57833	57848	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_001660	C	12	58646	58657	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	Non-Coding
74	NC_001660	ATT	4	62630	62641	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467119
75	NC_001660	TTA	4	63414	63425	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467119
76	NC_001660	GGGAAA	3	64066	64083	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	11467120
77	NC_001660	ATAAA	3	64222	64235	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11467120
78	NC_001660	CTTT	3	65846	65857	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
79	NC_001660	TTTGT	3	68549	68563	15	0 %	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001660	CAA	4	68591	68601	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
81	NC_001660	TTTG	3	69318	69328	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11467124
82	NC_001660	A	14	69595	69608	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11467124
83	NC_001660	TAA	4	69780	69791	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467125
84	NC_001660	ATTT	3	69980	69991	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_001660	AT	6	70774	70785	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_001660	ACA	4	71207	71217	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	11467127
87	NC_001660	CAAG	3	71291	71302	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	11467127
88	NC_001660	A	12	71726	71737	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11467127
89	NC_001660	TAT	4	72479	72489	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467128
90	NC_001660	CTTT	3	75119	75129	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_001660	GAT	4	77973	77983	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11467131
92	NC_001660	T	12	78701	78712	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11467131
93	NC_001660	AT	16	79206	79237	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467131
94	NC_001660	AT	6	79756	79767	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_001660	CTTT	3	79954	79965	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11467132
96	NC_001660	AAAT	3	80126	80138	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11467132
97	NC_001660	TTTGT	3	80167	80181	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	11467132
98	NC_001660	AGGA	3	83824	83835	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	11467134
99	NC_001660	TCAC	3	84519	84530	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11467134
100	NC_001660	TTTG	3	85973	85983	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11467135
101	NC_001660	GTCC	3	87257	87268	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	11467136
102	NC_001660	ACAT	3	87570	87580	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11467136
103	NC_001660	AAGT	3	88106	88116	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11467136
104	NC_001660	TTG	4	89026	89037	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467136
105	NC_001660	AGTT	3	89959	89969	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_001660	TTA	4	93181	93191	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467139
107	NC_001660	AACC	3	93256	93267	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	11467139
108	NC_001660	GGTA	3	93656	93666	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_001660	AT	6	95704	95715	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_001660	GGCC	3	98178	98189	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
111	NC_001660	AT	6	99580	99591	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_001660	A	12	99629	99640	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_001660	TTAA	3	100252	100263	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_001660	AT	16	100312	100342	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_001660	TA	6	100510	100521	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_001660	TGAT	3	101393	101405	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_001660	GAAA	3	101456	101466	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_001660	AT	6	101639	101650	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_001660	TTGG	3	101865	101876	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	11467143
120	NC_001660	CAAA	3	102429	102440	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11467143
121	NC_001660	GGCG	3	105100	105111	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	11467143
122	NC_001660	AAT	4	108311	108321	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_001660	AT	6	109575	109588	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_001660	AAAT	3	109596	109607	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_001660	GGAG	3	110117	110127	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	11467144
126	NC_001660	A	12	111149	111160	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11467144
127	NC_001660	ACG	4	111247	111258	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467144
128	NC_001660	GAAA	3	111994	112009	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
129	NC_001660	AT	10	112475	112496	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467145
130	NC_001660	AT	7	112502	112515	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11467145
131	NC_001660	AT	6	112628	112638	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467145
132	NC_001660	GA	6	116787	116797	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11467148
133	NC_001660	A	13	117722	117734	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11467148
134	NC_001660	CCCT	3	121341	121351	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
135	NC_001660	ATGGG	3	121392	121406	15	20 %	20 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_001660	GTTT	3	126034	126044	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11467152
137	NC_001660	AT	6	126804	126815	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_001660	ACAA	3	127853	127864	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11467153
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199	NC_001660	AGTA	3	183763	183777	15	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
200	NC_001660	TACTTG	3	185111	185129	19	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	11467169
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Marchantia polymorpha mitochondrion