Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pinus thunbergii chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_001631ATC4206720771133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %7524595
2NC_001631AGA4227922901266.67 %0 %33.33 %0 %8 %7524595
3NC_001631AAT4457645871266.67 %33.33 %0 %0 %8 %7524596
4NC_001631CTA4621962291133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %7524597
5NC_001631TGT41232112332120 %66.67 %33.33 %0 %8 %7524607
6NC_001631CAT420259202691133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %7524614
7NC_001631TCT42126821278110 %66.67 %0 %33.33 %9 %7524614
8NC_001631CTT42183321843110 %66.67 %0 %33.33 %9 %7524614
9NC_001631GTT42268422695120 %66.67 %33.33 %0 %8 %7524614
10NC_001631CTT52758227595140 %66.67 %0 %33.33 %7 %7524621
11NC_001631GTT43189631906110 %66.67 %33.33 %0 %9 %7524627
12NC_001631AGA436208362181166.67 %0 %33.33 %0 %9 %7524627
13NC_001631TAA437166371771266.67 %33.33 %0 %0 %8 %7524627
14NC_001631TCT43920739218120 %66.67 %0 %33.33 %8 %7524627
15NC_001631AAT441660416701166.67 %33.33 %0 %0 %9 %7524627
16NC_001631GGA445738457491233.33 %0 %66.67 %0 %8 %7524627
17NC_001631ATA449223492331166.67 %33.33 %0 %0 %9 %7524627
18NC_001631AAT456982569921166.67 %33.33 %0 %0 %9 %7524627
19NC_001631ATA462432624431266.67 %33.33 %0 %0 %8 %7524627
20NC_001631CTT56366463677140 %66.67 %0 %33.33 %7 %7524627
21NC_001631TAT464705647151133.33 %66.67 %0 %0 %9 %7524627
22NC_001631TAT465645656551133.33 %66.67 %0 %0 %9 %7524627
23NC_001631TTC46806568075110 %66.67 %0 %33.33 %9 %7524627
24NC_001631TTC47831078321120 %66.67 %0 %33.33 %8 %7524627
25NC_001631AGA478485784951166.67 %0 %33.33 %0 %9 %7524627
26NC_001631CTG48020480215120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %7524627
27NC_001631GAA480250802611266.67 %0 %33.33 %0 %8 %7524627
28NC_001631TTC48308083091120 %66.67 %0 %33.33 %8 %7524627
29NC_001631TTA487305873161233.33 %66.67 %0 %0 %8 %7524627
30NC_001631TCA492382923921133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %7524627
31NC_001631TGG49373893749120 %33.33 %66.67 %0 %8 %7524627
32NC_001631AGA494155941661266.67 %0 %33.33 %0 %8 %7524627
33NC_001631GAA499880998911266.67 %0 %33.33 %0 %8 %7524627
34NC_001631ATT41065371065481233.33 %66.67 %0 %0 %8 %7524627
35NC_001631AGA41069041069161366.67 %0 %33.33 %0 %7 %7524627
36NC_001631ATA41070511070611166.67 %33.33 %0 %0 %9 %7524627
37NC_001631TAA41077651077751166.67 %33.33 %0 %0 %9 %7524627
38NC_001631TAC41082031082131133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %7524627
39NC_001631TCA41090281090381133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %7524627
40NC_001631GTA41098271098381233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %7524627
41NC_001631TAC41185571185671133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %7524751
42NC_001631TCT4118764118775120 %66.67 %0 %33.33 %8 %7524751