ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Prototheca wickerhamii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001613	TAA	4	1358	1368	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_001613	TTA	4	2118	2129	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_001613	TAT	4	6921	6932	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11497456
4	NC_001613	ATA	4	7370	7381	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11497456
5	NC_001613	TAA	4	9077	9088	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11497456
6	NC_001613	ATA	4	10834	10844	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11497457
7	NC_001613	TAA	4	11383	11394	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_001613	ATC	4	12057	12067	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11497458
9	NC_001613	CAA	4	12655	12666	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11497458
10	NC_001613	ATA	4	13818	13828	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_001613	ATA	4	13868	13878	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_001613	AAT	4	15278	15289	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_001613	TAA	4	15825	15835	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_001613	ATA	4	15845	15856	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_001613	AAT	4	18025	18036	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11497463
16	NC_001613	AGA	4	22853	22863	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11497469
17	NC_001613	TAT	4	23138	23149	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11497469
18	NC_001613	TAA	4	27396	27406	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11497472
19	NC_001613	AAT	4	29102	29112	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_001613	ATA	4	29174	29185	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_001613	TAA	5	29590	29604	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11497474
22	NC_001613	AAT	4	29834	29845	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_001613	TAT	5	31514	31527	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11497475
24	NC_001613	TTA	5	32209	32223	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11497476
25	NC_001613	TAT	4	32279	32290	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11497476
26	NC_001613	TTA	4	32582	32592	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11497476
27	NC_001613	TAA	4	32793	32804	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_001613	TTA	4	33194	33205	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11497477
29	NC_001613	TAT	4	33430	33442	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_001613	TAA	4	33958	33969	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_001613	ATT	4	34327	34339	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_001613	TGC	4	35146	35157	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11497478
33	NC_001613	TAT	4	38039	38049	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_001613	TAT	4	39306	39317	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11497481
35	NC_001613	TCT	4	39668	39679	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11497481
36	NC_001613	TAT	4	41850	41861	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_001613	TAT	4	42162	42172	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11497484
38	NC_001613	TAA	4	43275	43286	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11497484
39	NC_001613	ATA	4	44171	44181	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_001613	TAC	4	45874	45884	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11497487
41	NC_001613	TAA	4	48609	48620	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_001613	TAA	4	51579	51591	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_001613	TAA	4	51720	51731	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_001613	TAA	4	53123	53134	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_001613	TAA	4	54087	54098	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_001613	TAT	4	54654	54665	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Prototheca wickerhamii mitochondrion