ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Prototheca wickerhamii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001613	ATCT	3	63	75	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	11497453
2	NC_001613	TTTA	3	1087	1097	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_001613	TAA	4	1358	1368	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_001613	AAAT	3	1860	1871	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_001613	GTAA	3	1986	1996	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_001613	TTA	4	2118	2129	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_001613	ATTCTT	3	3720	3738	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
8	NC_001613	ATAA	3	3836	3847	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_001613	TAAA	3	3857	3868	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_001613	AAAT	3	3881	3891	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_001613	TACA	3	4702	4712	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11497456
12	NC_001613	AGAAT	3	5014	5027	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	11497456
13	NC_001613	TTTA	3	6607	6618	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11497456
14	NC_001613	TAT	4	6921	6932	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11497456
15	NC_001613	TTTA	3	7144	7155	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11497456
16	NC_001613	ATA	4	7370	7381	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11497456
17	NC_001613	TAAT	3	7608	7619	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	11497456
18	NC_001613	AAAT	3	7872	7882	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11497456
19	NC_001613	TTTTC	3	8938	8951	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	11497456
20	NC_001613	TAA	4	9077	9088	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11497456
21	NC_001613	AT	7	9601	9613	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_001613	ATA	4	10834	10844	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11497457
23	NC_001613	TAA	4	11383	11394	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_001613	ATC	4	12057	12067	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11497458
25	NC_001613	CAA	4	12655	12666	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11497458
26	NC_001613	TTTA	3	13778	13789	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001613	ATA	4	13818	13828	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_001613	ATA	4	13868	13878	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_001613	ATTTAT	3	13915	13932	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_001613	TAAAA	3	14123	14137	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_001613	T	14	14330	14343	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11497459
32	NC_001613	AAT	4	15278	15289	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_001613	TTTA	3	15330	15340	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_001613	T	15	15671	15685	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_001613	TAA	4	15825	15835	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_001613	ATA	4	15845	15856	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_001613	CATA	3	16871	16882	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11497462
38	NC_001613	CATA	4	18007	18023	17	50 %	25 %	0 %	25 %	5 %	11497463
39	NC_001613	AAT	4	18025	18036	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11497463
40	NC_001613	TAAA	3	19286	19297	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001613	TTTA	3	19325	19336	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_001613	AT	8	20014	20029	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11497465
43	NC_001613	TTAA	3	20060	20070	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_001613	T	12	20077	20088	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11497466
45	NC_001613	AT	6	20698	20709	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11497466
46	NC_001613	TTTA	3	21110	21121	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_001613	TTTAT	4	21387	21407	21	20 %	80 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_001613	TA	15	21511	21538	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_001613	AATA	3	22527	22538	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001613	AGA	4	22853	22863	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11497469
51	NC_001613	TAT	4	23138	23149	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11497469
52	NC_001613	ATTTG	3	23410	23423	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	11497470
53	NC_001613	AT	6	23468	23479	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11497470
54	NC_001613	AATT	3	24177	24189	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_001613	TAAA	3	24724	24734	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11497471
56	NC_001613	CTAAA	3	25518	25532	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
57	NC_001613	AATA	3	25667	25678	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_001613	AT	6	25777	25787	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_001613	AAAT	3	26037	26048	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_001613	TAA	4	27396	27406	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11497472
61	NC_001613	TTTA	3	27779	27789	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_001613	TAAA	3	28770	28780	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11497473
63	NC_001613	AAT	4	29102	29112	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_001613	ATA	4	29174	29185	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_001613	AT	7	29231	29244	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_001613	AAAT	3	29448	29458	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11497474
67	NC_001613	TAA	5	29590	29604	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11497474
68	NC_001613	AATA	4	29614	29629	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	11497474
69	NC_001613	AAT	4	29834	29845	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_001613	TGAAA	3	29875	29888	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_001613	TAATTT	3	29927	29944	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
72	NC_001613	AT	6	30161	30173	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_001613	AT	8	30202	30216	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_001613	TA	9	30234	30250	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
75	NC_001613	AACT	4	30297	30311	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
76	NC_001613	AT	8	30335	30351	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_001613	AT	7	30450	30462	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_001613	TTCA	3	31014	31024	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11497475
79	NC_001613	TA	6	31467	31479	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11497475
80	NC_001613	TAT	5	31514	31527	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11497475
81	NC_001613	T	12	31572	31583	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11497475
82	NC_001613	AAAG	3	31701	31712	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_001613	TTA	5	32209	32223	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11497476
84	NC_001613	TAT	4	32279	32290	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11497476
85	NC_001613	TTA	4	32582	32592	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11497476
86	NC_001613	TA	6	32730	32741	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_001613	TAA	4	32793	32804	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_001613	ATTG	3	33164	33174	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11497477
89	NC_001613	TTA	4	33194	33205	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11497477
90	NC_001613	CATT	3	33411	33421	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_001613	TAT	4	33430	33442	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_001613	AT	7	33700	33712	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_001613	T	16	33761	33776	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_001613	TTTA	3	33784	33794	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_001613	TAA	4	33958	33969	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_001613	ATT	4	34327	34339	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_001613	TGC	4	35146	35157	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11497478
98	NC_001613	ATTT	4	36018	36034	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
99	NC_001613	TA	6	36220	36233	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_001613	TAT	4	38039	38049	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_001613	AAAT	3	38688	38698	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11497481
102	NC_001613	TAT	4	39306	39317	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11497481
103	NC_001613	TCT	4	39668	39679	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11497481
104	NC_001613	TA	7	40084	40096	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_001613	CAAT	3	40111	40122	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	11497482
106	NC_001613	TAAA	3	40475	40486	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11497482
107	NC_001613	AAAT	3	41285	41296	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001613	TAT	4	41850	41861	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_001613	TATT	3	42016	42027	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11497484
110	NC_001613	TAT	4	42162	42172	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11497484
111	NC_001613	TTTA	3	43260	43270	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11497484
112	NC_001613	TAA	4	43275	43286	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11497484
113	NC_001613	TATT	3	43357	43368	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11497484
114	NC_001613	ATTT	3	44014	44024	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_001613	AAAT	3	44035	44046	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_001613	ATA	4	44171	44181	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_001613	AAAT	3	44710	44720	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11497486
118	NC_001613	TAAA	4	44971	44986	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_001613	AT	8	45068	45085	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
120	NC_001613	TA	6	45096	45106	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_001613	TTAT	4	45251	45265	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_001613	AAAAT	3	45280	45293	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11497487
123	NC_001613	ACAA	3	45297	45307	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11497487
124	NC_001613	TTAA	3	45746	45757	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11497487
125	NC_001613	TAC	4	45874	45884	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11497487
126	NC_001613	TAA	4	48609	48620	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_001613	ATTATA	3	48691	48707	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
128	NC_001613	ATTAA	4	49368	49387	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
129	NC_001613	TAA	4	51579	51591	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_001613	AAAAC	3	51601	51615	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
131	NC_001613	TAA	4	51720	51731	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_001613	TAAA	3	51790	51800	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_001613	TAA	4	53123	53134	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_001613	TCAA	3	53702	53712	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
135	NC_001613	TAA	4	54087	54098	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_001613	TAAC	3	54451	54461	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
137	NC_001613	TAT	4	54654	54665	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_001613	AT	6	54920	54931	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Prototheca wickerhamii mitochondrion