ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Euglena gracilis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001603	ATCC	5	354	372	19	25 %	25 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
2	NC_001603	ATTG	3	3555	3566	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_001603	ATTT	3	4036	4046	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	89363015
4	NC_001603	TTTA	3	4345	4356	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	89363015
5	NC_001603	TTTC	3	5642	5653	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	89363015
6	NC_001603	GAAT	3	6079	6089	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	89363015
7	NC_001603	TTAT	3	6342	6352	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	89363015
8	NC_001603	ATTT	3	6907	6918	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	89363015
9	NC_001603	TTTA	3	8716	8726	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	89363015
10	NC_001603	ATTT	4	10307	10321	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	89363015
11	NC_001603	TTTG	3	11611	11621	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	89363015
12	NC_001603	TTAA	3	13907	13918	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466985
13	NC_001603	ATTT	3	14923	14933	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466985
14	NC_001603	ATTT	3	15382	15393	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466985
15	NC_001603	TTTC	3	17615	17625	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11466985
16	NC_001603	TTGT	3	17793	17803	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11466985
17	NC_001603	TTAA	3	18155	18165	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466985
18	NC_001603	TTTA	3	18789	18799	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466985
19	NC_001603	AAAT	3	20964	20974	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466985
20	NC_001603	TTTG	3	21488	21499	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11466985
21	NC_001603	TTAT	3	21598	21609	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466985
22	NC_001603	ATTT	3	21853	21863	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466985
23	NC_001603	AAAC	3	22069	22080	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11466985
24	NC_001603	TTTC	3	22661	22671	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11466985
25	NC_001603	ACAA	3	22849	22859	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11466985
26	NC_001603	TTAA	3	23916	23926	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466985
27	NC_001603	CTTT	3	24445	24455	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11466985
28	NC_001603	TTTA	3	25184	25195	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466988
29	NC_001603	TTTA	4	25340	25355	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11466988
30	NC_001603	TTTA	3	30412	30423	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466991
31	NC_001603	TTTA	3	30485	30495	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466991
32	NC_001603	GTTT	3	30737	30747	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_001603	AAAT	3	31062	31073	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001603	ATTT	3	31081	31092	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_001603	TGTA	3	31394	31405	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_001603	ATTT	3	31609	31619	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466992
37	NC_001603	TTAT	3	32065	32077	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11466992
38	NC_001603	GTTT	3	32297	32308	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11466992
39	NC_001603	TTAT	3	33336	33346	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466993
40	NC_001603	TTAG	3	35141	35151	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_001603	GTTT	3	35782	35792	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11466996
42	NC_001603	TATT	3	36311	36322	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_001603	TAAT	3	38603	38613	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466999
44	NC_001603	TTTA	3	38870	38882	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11466999
45	NC_001603	ATTG	3	39324	39335	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	11466999
46	NC_001603	AATT	3	39541	39551	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466999
47	NC_001603	TTAA	3	40517	40528	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466999
48	NC_001603	TTTA	3	42873	42884	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467000
49	NC_001603	ATTT	3	43134	43144	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467000
50	NC_001603	AATT	3	43583	43594	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	11467000
51	NC_001603	GTTA	3	44468	44478	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11467000
52	NC_001603	ATTT	3	44643	44653	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467000
53	NC_001603	TTAA	3	46114	46125	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467000
54	NC_001603	ATTT	4	46198	46213	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11467000
55	NC_001603	TTTA	3	46850	46861	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467001
56	NC_001603	TATT	3	47683	47693	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467002
57	NC_001603	TATT	3	47780	47790	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467002
58	NC_001603	ATTT	3	48155	48166	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	11467002
59	NC_001603	TTAA	3	48270	48280	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467002
60	NC_001603	ATTT	4	49353	49368	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11467005
61	NC_001603	TTTA	3	49568	49579	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467005
62	NC_001603	ATTT	4	51072	51087	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11467007
63	NC_001603	GTTT	3	51976	51987	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11467008
64	NC_001603	TGTA	3	52153	52163	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11467008
65	NC_001603	AAAG	3	53074	53085	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11467009
66	NC_001603	TTTC	3	55237	55249	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	11467010
67	NC_001603	ATTT	3	55376	55387	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467010
68	NC_001603	ATTT	3	55705	55716	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467010
69	NC_001603	ATTT	3	56167	56177	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467010
70	NC_001603	ATTT	3	56700	56710	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467011
71	NC_001603	ATTT	3	56781	56792	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467011
72	NC_001603	ATTT	3	56969	56979	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467011
73	NC_001603	TTTG	3	57059	57070	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11467011
74	NC_001603	ATTT	3	57341	57352	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467011
75	NC_001603	GTTC	3	57675	57685	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_001603	CTTT	3	58863	58874	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	11467013
77	NC_001603	ATTT	3	60450	60460	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_001603	ATTA	3	62211	62222	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467017
79	NC_001603	ATTT	3	62686	62696	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_001603	CAAA	3	63228	63239	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	11467018
81	NC_001603	TAAT	3	63906	63917	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467018
82	NC_001603	ATTT	3	66255	66265	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467020
83	NC_001603	AATT	3	67902	67912	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467021
84	NC_001603	AAAT	3	69648	69658	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467021
85	NC_001603	ATTT	3	70402	70413	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467022
86	NC_001603	TAAA	3	71148	71160	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_001603	ATAA	3	72864	72874	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467025
88	NC_001603	AAAT	3	74474	74484	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467026
89	NC_001603	TAAA	4	75334	75348	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	11467027
90	NC_001603	ATAA	3	76091	76102	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467028
91	NC_001603	TAAA	3	78014	78024	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467029
92	NC_001603	ATAA	3	78503	78513	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467029
93	NC_001603	ATAA	3	79699	79709	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467029
94	NC_001603	ATTA	3	79762	79773	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	11467029
95	NC_001603	AATT	3	80584	80595	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467029
96	NC_001603	TTAA	3	80864	80876	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11467029
97	NC_001603	ATAA	3	80989	81000	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467029
98	NC_001603	GTAA	3	81302	81312	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11467029
99	NC_001603	GATA	3	81469	81480	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	11467029
100	NC_001603	TTTA	3	81646	81656	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467029
101	NC_001603	AGTT	3	81941	81953	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_001603	AACT	3	82903	82914	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_001603	AATT	3	83985	83995	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467031
104	NC_001603	TTTC	3	84202	84212	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11467031
105	NC_001603	TTCA	3	85423	85433	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11467032
106	NC_001603	AAAT	3	87921	87932	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467033
107	NC_001603	ATAA	3	88353	88363	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467033
108	NC_001603	AAAT	4	88874	88888	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	11467033
109	NC_001603	AAGA	3	89006	89016	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11467033
110	NC_001603	GAAA	3	89035	89045	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11467033
111	NC_001603	ATAA	3	89495	89506	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_001603	AAAG	3	91115	91125	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11467034
113	NC_001603	TAAA	3	93486	93497	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467035
114	NC_001603	CATT	3	93735	93746	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11467035
115	NC_001603	CAAA	3	95242	95252	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11467037
116	NC_001603	TAAA	3	95945	95956	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467038
117	NC_001603	ATTA	3	96045	96056	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467038
118	NC_001603	TTTA	3	96954	96965	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467038
119	NC_001603	TTAA	3	99874	99884	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467039
120	NC_001603	AAAT	3	101726	101738	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_001603	ATAA	3	102578	102588	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_001603	ATAA	3	102754	102766	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_001603	AATT	3	105043	105053	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467042
124	NC_001603	TAAA	3	107728	107738	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467043
125	NC_001603	AAAT	3	109153	109164	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467043
126	NC_001603	TTAA	3	109186	109197	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467043
127	NC_001603	TTTA	3	109287	109297	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467043
128	NC_001603	GTTT	3	109678	109689	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11467043
129	NC_001603	AATT	3	111342	111352	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467044
130	NC_001603	TTTC	3	112300	112311	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11467044
131	NC_001603	ATTT	4	114262	114277	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11467044
132	NC_001603	TAAA	3	114705	114716	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001603	TTTA	3	115486	115496	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_001603	AAAT	3	120692	120702	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_001603	ATTT	3	120713	120724	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_001603	AAAT	3	126610	126620	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_001603	ATTT	3	126631	126642	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_001603	AAAT	3	132528	132538	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_001603	ATTT	3	132549	132560	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_001603	ATAA	3	133596	133607	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_001603	CCTT	3	136583	136593	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
142	NC_001603	ATAA	5	142911	142929	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Euglena gracilis chloroplast