ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Euglena gracilis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001603	ATCC	5	354	372	19	25 %	25 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
2	NC_001603	AT	6	661	672	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_001603	TTA	5	747	761	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_001603	TAA	4	1154	1165	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_001603	TA	6	1325	1335	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_001603	TAT	4	1778	1789	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_001603	TAA	4	1789	1801	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_001603	TAT	5	2418	2431	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466981
9	NC_001603	TTC	4	2627	2638	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466981
10	NC_001603	TAA	5	3401	3415	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466981
11	NC_001603	ATTG	3	3555	3566	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_001603	ATTT	3	4036	4046	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	89363015
13	NC_001603	GAT	4	4318	4328	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	89363015
14	NC_001603	TTTA	3	4345	4356	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	89363015
15	NC_001603	TTTTTA	3	5082	5100	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	89363015
16	NC_001603	TTTC	3	5642	5653	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	89363015
17	NC_001603	TAA	4	5882	5893	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89363015
18	NC_001603	TTTATT	3	5963	5981	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	89363015
19	NC_001603	GAAT	3	6079	6089	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	89363015
20	NC_001603	ATT	4	6216	6228	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	89363015
21	NC_001603	TTAT	3	6342	6352	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	89363015
22	NC_001603	ATTT	3	6907	6918	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	89363015
23	NC_001603	TAG	4	7673	7683	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	89363015
24	NC_001603	TAA	4	8181	8192	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89363015
25	NC_001603	TA	7	8515	8528	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	89363015
26	NC_001603	TTTA	3	8716	8726	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	89363015
27	NC_001603	TTATA	4	9504	9523	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	89363015
28	NC_001603	ATTT	4	10307	10321	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	89363015
29	NC_001603	A	25	10829	10853	25	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	89363015
30	NC_001603	TTG	4	11104	11115	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	89363015
31	NC_001603	TTTG	3	11611	11621	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	89363015
32	NC_001603	T	15	12776	12790	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	89363015
33	NC_001603	TAT	5	13330	13344	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	89363015
34	NC_001603	TTAA	3	13907	13918	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466985
35	NC_001603	ATTT	3	14923	14933	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466985
36	NC_001603	ATTT	3	15382	15393	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466985
37	NC_001603	TGAAT	3	15415	15429	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	11466985
38	NC_001603	TAT	4	15453	15464	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466985
39	NC_001603	ATT	4	15637	15648	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11466985
40	NC_001603	A	13	15893	15905	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466985
41	NC_001603	TAA	4	15909	15920	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466985
42	NC_001603	TCT	5	15956	15969	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11466985
43	NC_001603	T	12	16101	16112	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11466985
44	NC_001603	ATT	4	17144	17155	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466985
45	NC_001603	TTCTT	3	17253	17266	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	11466985
46	NC_001603	TTTC	3	17615	17625	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11466985
47	NC_001603	GTT	4	17729	17741	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	11466985
48	NC_001603	TTGT	3	17793	17803	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11466985
49	NC_001603	TAA	4	18100	18110	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466985
50	NC_001603	TTAA	3	18155	18165	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466985
51	NC_001603	TTTA	3	18789	18799	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466985
52	NC_001603	ATT	4	19307	19318	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466985
53	NC_001603	TAT	4	20548	20558	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466985
54	NC_001603	TA	6	20876	20886	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466985
55	NC_001603	AAAT	3	20964	20974	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466985
56	NC_001603	TTTG	3	21488	21499	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11466985
57	NC_001603	TTAT	3	21598	21609	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466985
58	NC_001603	ATTT	3	21853	21863	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466985
59	NC_001603	AAAC	3	22069	22080	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11466985
60	NC_001603	GGT	4	22369	22380	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	11466985
61	NC_001603	ATTTTT	3	22580	22598	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	11466985
62	NC_001603	TTTC	3	22661	22671	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11466985
63	NC_001603	ATTTT	3	22796	22810	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	11466985
64	NC_001603	ACAA	3	22849	22859	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11466985
65	NC_001603	TTAA	3	23916	23926	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466985
66	NC_001603	CTTT	3	24445	24455	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11466985
67	NC_001603	TA	6	24705	24715	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_001603	TTTA	3	25184	25195	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466988
69	NC_001603	TA	6	25233	25244	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466988
70	NC_001603	TTTA	4	25340	25355	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11466988
71	NC_001603	TAG	4	25787	25798	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11466988
72	NC_001603	TGC	4	26125	26136	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466988
73	NC_001603	AAG	4	26397	26408	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11466988
74	NC_001603	TAA	4	27862	27873	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_001603	AAATT	3	27924	27938	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_001603	TAA	4	29801	29812	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_001603	TTTA	3	30412	30423	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466991
78	NC_001603	TTTA	3	30485	30495	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466991
79	NC_001603	ATT	6	30611	30627	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11466991
80	NC_001603	GTTT	3	30737	30747	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_001603	AAT	4	30754	30765	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_001603	ATT	4	30787	30797	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_001603	AAAT	3	31062	31073	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001603	ATTT	3	31081	31092	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_001603	TGTA	3	31394	31405	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_001603	ATTT	3	31609	31619	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466992
87	NC_001603	TTTATA	3	31848	31865	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11466992
88	NC_001603	TTAT	3	32065	32077	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11466992
89	NC_001603	GTTT	3	32297	32308	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11466992
90	NC_001603	TATTT	13	32491	32555	65	20 %	80 %	0 %	0 %	4 %	11466993
91	NC_001603	TGT	4	32918	32929	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11466993
92	NC_001603	TTAT	3	33336	33346	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466993
93	NC_001603	TA	6	33985	33995	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466994
94	NC_001603	TCT	4	34446	34457	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466994
95	NC_001603	TGT	4	34796	34806	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11466995
96	NC_001603	TTAG	3	35141	35151	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_001603	GTTT	3	35782	35792	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11466996
98	NC_001603	T	15	35907	35921	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11466996
99	NC_001603	ATT	4	36165	36175	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_001603	AAT	5	36213	36227	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_001603	TATT	3	36311	36322	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_001603	TTA	4	36326	36340	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466997
103	NC_001603	TAT	4	36515	36526	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_001603	TAT	4	36803	36814	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466998
105	NC_001603	CAT	4	38251	38261	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11466999
106	NC_001603	TAAT	3	38603	38613	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466999
107	NC_001603	TTTA	3	38870	38882	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11466999
108	NC_001603	ATTG	3	39324	39335	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	11466999
109	NC_001603	AATT	3	39541	39551	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466999
110	NC_001603	TAT	4	39626	39636	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466999
111	NC_001603	TTAA	3	40517	40528	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466999
112	NC_001603	CAT	4	41913	41923	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11467000
113	NC_001603	TTTA	3	42873	42884	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467000
114	NC_001603	ATTT	3	43134	43144	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467000
115	NC_001603	AATT	3	43583	43594	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	11467000
116	NC_001603	ATT	4	43770	43781	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11467000
117	NC_001603	GTTA	3	44468	44478	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11467000
118	NC_001603	ATTT	3	44643	44653	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467000
119	NC_001603	TTATT	4	45502	45520	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	11467000
120	NC_001603	TTAA	3	46114	46125	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467000
121	NC_001603	ATTT	4	46198	46213	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11467000
122	NC_001603	TTTA	3	46850	46861	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467001
123	NC_001603	TATT	3	47683	47693	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467002
124	NC_001603	TATT	3	47780	47790	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467002
125	NC_001603	AT	7	47840	47854	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11467002
126	NC_001603	TTA	4	47972	47983	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467002
127	NC_001603	T	13	48031	48043	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11467002
128	NC_001603	ATTT	3	48155	48166	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	11467002
129	NC_001603	TTAA	3	48270	48280	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467002
130	NC_001603	T	12	48300	48311	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11467002
131	NC_001603	TTA	4	48912	48924	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_001603	T	13	49244	49256	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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242	NC_001603	TACAC	3	87447	87460	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
243	NC_001603	AAAT	3	87921	87932	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467033
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245	NC_001603	AAAT	4	88874	88888	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	11467033
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255	NC_001603	AAAAT	3	95170	95185	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	11467036
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257	NC_001603	ATTTT	3	95482	95495	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
258	NC_001603	TAA	4	95575	95586	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
259	NC_001603	AT	6	95787	95797	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467038
260	NC_001603	TAAA	3	95945	95956	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467038
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339	NC_001603	TA	9	143150	143166	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Euglena gracilis chloroplast