ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Euglena gracilis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001603	TTA	5	747	761	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_001603	TAA	4	1154	1165	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_001603	TAT	4	1778	1789	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_001603	TAA	4	1789	1801	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_001603	TAT	5	2418	2431	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466981
6	NC_001603	TTC	4	2627	2638	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466981
7	NC_001603	TAA	5	3401	3415	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466981
8	NC_001603	GAT	4	4318	4328	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	89363015
9	NC_001603	TAA	4	5882	5893	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89363015
10	NC_001603	ATT	4	6216	6228	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	89363015
11	NC_001603	TAG	4	7673	7683	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	89363015
12	NC_001603	TAA	4	8181	8192	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89363015
13	NC_001603	TTG	4	11104	11115	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	89363015
14	NC_001603	TAT	5	13330	13344	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	89363015
15	NC_001603	TAT	4	15453	15464	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466985
16	NC_001603	ATT	4	15637	15648	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11466985
17	NC_001603	TAA	4	15909	15920	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466985
18	NC_001603	TCT	5	15956	15969	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11466985
19	NC_001603	ATT	4	17144	17155	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466985
20	NC_001603	GTT	4	17729	17741	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	11466985
21	NC_001603	TAA	4	18100	18110	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466985
22	NC_001603	ATT	4	19307	19318	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466985
23	NC_001603	TAT	4	20548	20558	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466985
24	NC_001603	GGT	4	22369	22380	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	11466985
25	NC_001603	TAG	4	25787	25798	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11466988
26	NC_001603	TGC	4	26125	26136	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466988
27	NC_001603	AAG	4	26397	26408	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11466988
28	NC_001603	TAA	4	27862	27873	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_001603	TAA	4	29801	29812	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_001603	ATT	6	30611	30627	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11466991
31	NC_001603	AAT	4	30754	30765	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_001603	ATT	4	30787	30797	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_001603	TGT	4	32918	32929	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11466993
34	NC_001603	TCT	4	34446	34457	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466994
35	NC_001603	TGT	4	34796	34806	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11466995
36	NC_001603	ATT	4	36165	36175	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_001603	AAT	5	36213	36227	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_001603	TTA	4	36326	36340	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466997
39	NC_001603	TAT	4	36515	36526	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_001603	TAT	4	36803	36814	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466998
41	NC_001603	CAT	4	38251	38261	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11466999
42	NC_001603	TAT	4	39626	39636	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466999
43	NC_001603	CAT	4	41913	41923	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11467000
44	NC_001603	ATT	4	43770	43781	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11467000
45	NC_001603	TTA	4	47972	47983	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467002
46	NC_001603	TTA	4	48912	48924	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_001603	TAT	5	49754	49767	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11467005
48	NC_001603	TAT	4	54007	54018	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467010
49	NC_001603	ATT	4	54606	54617	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467010
50	NC_001603	ATA	4	57816	57826	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467012
51	NC_001603	GTA	4	58332	58343	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_001603	TTA	4	59178	59189	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467014
53	NC_001603	TAT	8	59945	59967	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467014
54	NC_001603	TAA	4	60885	60895	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_001603	ATA	4	60910	60921	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001603	ATT	4	61757	61767	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467017
57	NC_001603	TTA	4	62717	62727	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467018
58	NC_001603	CTT	4	62800	62810	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11467018
59	NC_001603	TAT	4	64607	64617	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467019
60	NC_001603	TAA	4	65063	65074	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467020
61	NC_001603	ATT	4	68409	68419	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467021
62	NC_001603	ATT	5	68902	68916	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11467021
63	NC_001603	TAT	7	68926	68947	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467021
64	NC_001603	AAC	4	70758	70769	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	225258180
65	NC_001603	ATA	4	72897	72908	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467025
66	NC_001603	ATA	4	73023	73034	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467025
67	NC_001603	AAT	4	73405	73417	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11467026
68	NC_001603	CTT	4	73502	73514	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11467026
69	NC_001603	TTA	4	73764	73775	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467026
70	NC_001603	CAC	4	74640	74651	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11467026
71	NC_001603	TAT	4	76490	76501	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467029
72	NC_001603	AGC	4	76831	76842	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467029
73	NC_001603	TTA	4	77812	77822	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467029
74	NC_001603	CAG	5	80172	80186	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	11467029
75	NC_001603	TAA	5	81785	81798	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_001603	ATT	5	81846	81860	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_001603	TAA	9	82502	82527	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	3 %	Non-Coding
78	NC_001603	TAA	4	82959	82970	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_001603	AAT	4	83032	83042	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_001603	TTA	4	84331	84342	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467031
81	NC_001603	TAA	4	84398	84408	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467031
82	NC_001603	ATA	4	84946	84957	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_001603	TAA	5	85356	85369	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_001603	ACA	4	86116	86126	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	11467032
85	NC_001603	TTG	4	89928	89939	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467034
86	NC_001603	ATA	4	93785	93796	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467035
87	NC_001603	TAA	4	95575	95586	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_001603	CTA	4	97898	97908	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11467039
89	NC_001603	TAA	4	98100	98110	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467039
90	NC_001603	TAA	4	104412	104423	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467042
91	NC_001603	CAA	4	107790	107801	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11467043
92	NC_001603	TAA	4	109724	109735	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467043
93	NC_001603	ATT	4	109785	109795	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467043
94	NC_001603	TAA	4	113799	113809	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467044
95	NC_001603	TTA	4	113936	113947	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467044
96	NC_001603	TCT	4	120004	120014	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
97	NC_001603	TCT	4	125922	125932	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
98	NC_001603	TCT	4	131840	131850	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
99	NC_001603	TCT	4	136546	136556	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Euglena gracilis chloroplast