ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Epifagus virginiana chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001568	TAA	4	439	450	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_001568	TAA	5	1473	1487	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466955
3	NC_001568	TAG	4	2865	2876	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_001568	TAT	5	5031	5044	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_001568	ACG	4	5658	5669	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466957
6	NC_001568	ATA	4	5968	5980	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_001568	TAA	4	7251	7261	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_001568	TAT	4	7525	7535	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_001568	TTA	4	8200	8210	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_001568	TAA	5	12005	12018	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_001568	ATT	4	12909	12921	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466974
12	NC_001568	ATA	4	15265	15275	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466974
13	NC_001568	TAT	5	16033	16047	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466974
14	NC_001568	TAT	5	17980	17995	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466974
15	NC_001568	CTT	4	19973	19984	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466974
16	NC_001568	GAT	4	20440	20450	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11466974
17	NC_001568	ATT	4	25016	25026	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466974
18	NC_001568	CTT	4	25897	25908	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466974
19	NC_001568	TGA	4	26379	26390	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11466974
20	NC_001568	TAT	4	27150	27161	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466974
21	NC_001568	ATT	4	27626	27637	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466974
22	NC_001568	GAA	4	34055	34066	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	59374957
23	NC_001568	ATT	5	43971	43984	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	59374957
24	NC_001568	TAT	4	44137	44148	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	59374957
25	NC_001568	ATT	4	44922	44933	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	59374957
26	NC_001568	TAA	4	62190	62201	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466978
27	NC_001568	TCA	4	62955	62966	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11466978
28	NC_001568	CAA	4	63916	63927	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11466978
29	NC_001568	TAA	4	64801	64811	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466978
30	NC_001568	ATC	4	69378	69388	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11466979
31	NC_001568	GAA	5	69843	69857	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	11466979

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Epifagus virginiana chloroplast