ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Apis mellifera ligustica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001566	ATAA	3	264	275	12	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_001566	TAAA	3	346	357	12	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_001566	TAA	4	371	383	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_001566	ATTT	3	531	542	12	25 %	75 %	0 %	0 %	5834926
5	NC_001566	TAA	4	560	571	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	5834926
6	NC_001566	ATTA	3	669	680	12	50 %	50 %	0 %	8 %	5834926
7	NC_001566	AAAT	3	845	855	11	75 %	25 %	0 %	9 %	5834926
8	NC_001566	TATTTT	3	1045	1061	17	16.67 %	83.33 %	0 %	5 %	5834926
9	NC_001566	ATTT	3	1107	1118	12	25 %	75 %	0 %	8 %	5834926
10	NC_001566	ATTTTA	3	1157	1175	19	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	5834926
11	NC_001566	AAT	4	1329	1340	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	5834926
12	NC_001566	TAT	4	1350	1361	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	5834926
13	NC_001566	AT	7	1425	1437	13	50 %	50 %	0 %	7 %	5834926
14	NC_001566	TTTA	5	1683	1702	20	25 %	75 %	0 %	10 %	Non-Coding
15	NC_001566	AAAATT	3	1759	1777	19	66.67 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
16	NC_001566	ATA	4	2292	2303	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	5834927
17	NC_001566	TAT	4	3229	3239	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	5834927
18	NC_001566	TAA	4	3474	3484	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_001566	ATT	5	3705	3719	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	5834928
20	NC_001566	ACA	4	4071	4082	12	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	5834928
21	NC_001566	AATT	3	4145	4156	12	50 %	50 %	0 %	8 %	5834928
22	NC_001566	TAA	4	4305	4315	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_001566	TATT	5	4480	4500	21	25 %	75 %	0 %	9 %	5834929
24	NC_001566	ATTA	3	4513	4525	13	50 %	50 %	0 %	7 %	5834929
25	NC_001566	ATT	4	4677	4688	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	5834930
26	NC_001566	ATTAT	3	4719	4732	14	40 %	60 %	0 %	7 %	5834930
27	NC_001566	TAT	5	4799	4813	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	5834930
28	NC_001566	TAATT	3	4933	4946	14	40 %	60 %	0 %	7 %	5834930
29	NC_001566	TTTAT	3	5533	5546	14	20 %	80 %	0 %	7 %	5834931
30	NC_001566	ATTC	3	5679	5690	12	25 %	50 %	25 %	8 %	5834931
31	NC_001566	TAAT	3	5733	5743	11	50 %	50 %	0 %	9 %	5834931
32	NC_001566	TA	22	6094	6136	43	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_001566	AT	6	6176	6186	11	50 %	50 %	0 %	9 %	5834932
34	NC_001566	TAT	4	6237	6248	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	5834932
35	NC_001566	TAA	4	6360	6371	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	5834932
36	NC_001566	ATT	4	6395	6405	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	5834932
37	NC_001566	AATA	4	6914	6930	17	75 %	25 %	0 %	5 %	5834933
38	NC_001566	TAT	4	7063	7074	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	5834933
39	NC_001566	ATT	4	7301	7312	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	5834933
40	NC_001566	TCT	4	7337	7347	11	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	5834933
41	NC_001566	TA	6	7617	7627	11	50 %	50 %	0 %	9 %	5834933
42	NC_001566	TAA	4	8091	8103	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	5834933
43	NC_001566	AAATTA	3	8265	8282	18	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	5834933
44	NC_001566	ATCT	3	8320	8331	12	25 %	50 %	25 %	8 %	5834933
45	NC_001566	TAA	4	8692	8703	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	5834934
46	NC_001566	TAAA	3	8772	8783	12	75 %	25 %	0 %	0 %	5834934
47	NC_001566	AAT	4	8927	8938	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	5834934
48	NC_001566	AATT	3	9076	9088	13	50 %	50 %	0 %	7 %	5834934
49	NC_001566	TTA	7	9099	9119	21	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	5834934
50	NC_001566	TAAA	3	9409	9424	16	75 %	25 %	0 %	6 %	5834934
51	NC_001566	ATA	4	9639	9649	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	5834934
52	NC_001566	TAA	4	9682	9693	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	5834934
53	NC_001566	TAT	4	9717	9727	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	5834934
54	NC_001566	TCAAT	3	9820	9833	14	40 %	40 %	20 %	7 %	5834934
55	NC_001566	TAA	4	9861	9873	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	5834934
56	NC_001566	ATTT	3	9898	9908	11	25 %	75 %	0 %	9 %	5834934
57	NC_001566	TAA	6	9961	9981	21	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	5834934
58	NC_001566	TAA	4	10051	10062	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	5834935
59	NC_001566	ATA	4	10224	10235	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	5834935
60	NC_001566	TAATT	3	10547	10560	14	40 %	60 %	0 %	7 %	5834936
61	NC_001566	ATTAAA	3	10698	10715	18	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	5834936
62	NC_001566	TTA	6	10732	10750	19	33.33 %	66.67 %	0 %	10 %	5834936
63	NC_001566	TATT	3	10850	10860	11	25 %	75 %	0 %	9 %	5834936
64	NC_001566	TAT	4	10980	10991	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_001566	AT	6	11286	11296	11	50 %	50 %	0 %	9 %	5834937
66	NC_001566	TAA	4	11648	11659	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	5834937
67	NC_001566	ATCTT	3	11712	11725	14	20 %	60 %	20 %	7 %	5834937
68	NC_001566	ATA	6	11929	11945	17	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	5834937
69	NC_001566	ATTAA	4	12146	12165	20	60 %	40 %	0 %	5 %	5834937
70	NC_001566	TAAA	3	12303	12314	12	75 %	25 %	0 %	8 %	5834938
71	NC_001566	AAAT	3	12449	12460	12	75 %	25 %	0 %	0 %	5834938
72	NC_001566	A	12	12719	12730	12	100 %	0 %	0 %	0 %	5834938
73	NC_001566	TAT	4	12755	12766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	5834938
74	NC_001566	ATAA	3	13004	13015	12	75 %	25 %	0 %	0 %	5834938
75	NC_001566	AAAT	3	13192	13203	12	75 %	25 %	0 %	8 %	5834938
76	NC_001566	ATT	4	13218	13230	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	5834938
77	NC_001566	AATT	3	13241	13253	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_001566	ATTAAA	3	14156	14174	19	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_001566	AAAT	3	14361	14373	13	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_001566	A	15	14560	14574	15	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_001566	TTA	5	14575	14589	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_001566	TA	29	14579	14632	54	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_001566	ATT	4	14953	14964	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_001566	ATT	5	15218	15233	16	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_001566	AT	20	15539	15575	37	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_001566	TTTA	3	15607	15617	11	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_001566	TAA	5	15690	15705	16	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_001566	T	18	15712	15729	18	0 %	100 %	0 %	5 %	Non-Coding
89	NC_001566	TTTA	3	15734	15745	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001566	AT	13	15751	15777	27	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_001566	TA	6	15775	15785	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_001566	AT	8	15801	15815	15	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_001566	TA	7	15851	15866	16	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_001566	AT	7	15885	15899	15	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_001566	AATT	3	15974	15986	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_001566	TAAA	4	16093	16107	15	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_001566	TAAA	3	16145	16155	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_001566	TAAA	3	16164	16175	12	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_001566	TAAA	3	16185	16195	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_001566	TAAA	3	16203	16214	12	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_001566	TAAA	3	16219	16229	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_001566	TAAAA	4	16237	16257	21	80 %	20 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_001566	TAATAT	3	16300	16317	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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