ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Podospora anserina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001329	CTGG	5	132	155	24	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_001329	TAA	5	199	213	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_001329	TGT	4	308	319	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_001329	TTTAG	3	348	362	15	20 %	60 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001329	ATA	4	635	646	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_001329	TTAA	3	680	691	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_001329	TTTA	4	981	996	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_001329	CTC	4	1376	1387	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
9	NC_001329	TATT	3	1418	1429	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_001329	CTAT	3	2215	2226	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_001329	TATAA	5	2704	2728	25	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_001329	GTA	4	3025	3037	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_001329	AAGGAA	3	3052	3070	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
14	NC_001329	TAA	4	3616	3626	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	12408582
15	NC_001329	CTA	4	3948	3958	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	12408582
16	NC_001329	ATT	4	4388	4398	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	12408582
17	NC_001329	ATTT	3	5193	5204	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001329	AAAT	3	5300	5311	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001329	TAA	4	5582	5593	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_001329	TGC	4	5898	5908	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_001329	TAA	4	5982	5993	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_001329	T	13	6494	6506	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_001329	AAAT	3	6515	6527	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_001329	TAA	4	6864	6875	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	12408583
25	NC_001329	AAAT	3	6929	6940	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	12408583
26	NC_001329	CAG	4	7596	7606	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	12408583
27	NC_001329	A	12	8382	8393	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_001329	TA	6	9387	9397	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_001329	TA	6	9674	9685	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_001329	CTC	5	10029	10043	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	6 %	Non-Coding
31	NC_001329	TA	6	10353	10363	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_001329	CTC	4	10857	10869	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
33	NC_001329	TTA	4	10870	10880	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_001329	AGG	4	10969	10980	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_001329	CGTA	4	11088	11102	15	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
36	NC_001329	TA	6	11144	11155	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_001329	GTTG	3	11338	11349	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_001329	TTGG	5	11355	11374	20	0 %	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_001329	T	17	11589	11605	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_001329	CATT	3	11885	11895	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	12408584
41	NC_001329	TAT	4	11988	11998	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	12408584
42	NC_001329	TTA	4	12191	12203	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	12408584
43	NC_001329	TTA	4	12633	12643	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	12408584
44	NC_001329	TAAA	3	13029	13041	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	12408584
45	NC_001329	TAT	4	13200	13212	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	12408584
46	NC_001329	ATTT	3	14715	14725	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	12408585
47	NC_001329	TTA	4	15324	15334	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_001329	GTAT	3	15563	15574	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001329	TAATT	5	15628	15651	24	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_001329	TTCT	3	15817	15829	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
51	NC_001329	CTC	4	16843	16855	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
52	NC_001329	TA	7	17535	17548	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_001329	TA	8	17583	17597	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_001329	TTCCT	3	17671	17684	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
55	NC_001329	CATA	3	17736	17747	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001329	ATA	4	17806	17816	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_001329	CAAAA	5	17832	17856	25	80 %	0 %	0 %	20 %	8 %	Non-Coding
58	NC_001329	CAAAT	3	17867	17880	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
59	NC_001329	A	15	17894	17908	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_001329	TAT	4	18428	18439	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12408629
61	NC_001329	ACCAC	3	19126	19140	15	40 %	0 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
62	NC_001329	GAG	6	19155	19172	18	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001329	TACA	3	19663	19674	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
64	NC_001329	TA	6	19960	19970	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	12408587
65	NC_001329	ATTT	3	20092	20102	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	12408587
66	NC_001329	AAT	4	20190	20201	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	12408587
67	NC_001329	GTAT	3	20445	20456	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_001329	CTC	4	20488	20500	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
69	NC_001329	TA	6	20759	20769	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_001329	GTAT	3	20822	20833	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_001329	AAGC	3	21129	21140	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_001329	TCA	4	21322	21333	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_001329	GAT	7	21342	21362	21	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_001329	TA	7	21518	21530	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	12408588
75	NC_001329	AAATT	3	21575	21589	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	12408588
76	NC_001329	TAA	4	21620	21630	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	12408588
77	NC_001329	ATTT	3	21668	21679	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	12408588
78	NC_001329	CTAT	3	22032	22042	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	12408588
79	NC_001329	TAC	4	22876	22887	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
80	NC_001329	TTA	4	23648	23659	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12408589
81	NC_001329	TAC	4	25006	25017	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	12408589
82	NC_001329	CTG	4	25251	25261	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	12408589
83	NC_001329	ATTT	3	25804	25815	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_001329	TA	6	26052	26062	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_001329	CTCA	3	26688	26698	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
86	NC_001329	GATA	3	27263	27274	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_001329	ATTT	3	27318	27329	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_001329	AATT	3	28382	28392	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_001329	AT	6	29773	29783	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_001329	AATT	3	29909	29920	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29448941
91	NC_001329	TAT	4	30312	30324	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29448941
92	NC_001329	TAA	4	30406	30417	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29448941
93	NC_001329	AAATTA	3	30512	30530	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	29448941
94	NC_001329	TAT	4	31121	31131	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29448941
95	NC_001329	AAT	4	31321	31333	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29448941
96	NC_001329	TA	6	31458	31469	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29448941
97	NC_001329	TTTA	3	31689	31699	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29448941
98	NC_001329	TAA	4	31868	31879	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29448941
99	NC_001329	GTT	4	32248	32258	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	29448941
100	NC_001329	TAAA	4	32401	32415	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	29448941
101	NC_001329	AGTTAT	3	32730	32747	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	29448941
102	NC_001329	ATA	4	32825	32835	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29448941
103	NC_001329	TA	7	33033	33045	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	29448941
104	NC_001329	AATA	3	33159	33170	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29448941
105	NC_001329	TGT	4	33516	33526	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	29448941
106	NC_001329	TTATA	3	33751	33765	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	29448941
107	NC_001329	TA	6	34055	34065	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29448941
108	NC_001329	ATAAA	3	34504	34518	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	29448941
109	NC_001329	TATT	3	35353	35364	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29448941
110	NC_001329	A	13	35835	35847	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	29448941
111	NC_001329	A	15	35917	35931	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_001329	ATT	4	36100	36111	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_001329	TTTCA	3	36144	36158	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001329	TTAA	3	36878	36888	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_001329	AAGA	3	36896	36907	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_001329	GTAA	3	37089	37100	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_001329	TA	6	37245	37255	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_001329	TTATA	3	37427	37440	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_001329	A	13	37505	37517	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_001329	AATTAT	3	37530	37548	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
121	NC_001329	TTAA	3	37553	37564	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_001329	TA	7	37609	37621	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_001329	AAGAGC	3	39959	39977	19	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	10 %	12408633
124	NC_001329	CTTA	3	40230	40240	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	12408633
125	NC_001329	TCAA	3	41877	41888	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	12408633
126	NC_001329	GTA	4	42261	42272	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	12408633
127	NC_001329	TAA	5	42392	42406	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	12408633
128	NC_001329	AAAAT	3	42427	42441	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	12408633
129	NC_001329	TA	6	42958	42968	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	12408633
130	NC_001329	GCT	4	44390	44401	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	12408633
131	NC_001329	TGAA	3	45165	45175	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	12408633
132	NC_001329	CTAA	3	47861	47871	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	12408633
133	NC_001329	TTAA	3	48109	48119	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	12408633
134	NC_001329	AAAT	3	48228	48238	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	12408633
135	NC_001329	TATT	3	48519	48530	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	12408633
136	NC_001329	GCGG	3	49386	49396	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	12408633
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Podospora anserina mitochondrion