ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ascaris suum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001327	TTTAG	3	62	76	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_001327	TGT	4	416	427	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	5834872
3	NC_001327	TTATT	3	644	657	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	5834873
4	NC_001327	AAAT	3	1381	1392	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_001327	AT	44	1924	2011	88	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_001327	AAAT	4	2012	2027	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_001327	TA	30	2027	2087	61	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_001327	AT	23	2218	2261	44	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_001327	TA	14	2311	2337	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_001327	AATATA	4	2352	2375	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_001327	TA	21	2360	2402	43	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_001327	TA	6	2412	2423	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_001327	T	12	2996	3007	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	5834874
14	NC_001327	TTG	4	3323	3333	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	5834874
15	NC_001327	GGTTTT	3	3381	3399	19	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10 %	5834874
16	NC_001327	TTG	4	3752	3762	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	5834875
17	NC_001327	TTTCTA	3	3874	3891	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	5834875
18	NC_001327	GTT	4	4231	4241	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_001327	TGT	4	4440	4451	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	162424482
20	NC_001327	TGTT	3	4542	4553	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	162424482
21	NC_001327	TTAT	6	4853	4875	23	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	162424482
22	NC_001327	GTT	8	5028	5051	24	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	162424482
23	NC_001327	TTGTTT	4	6367	6390	24	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	4 %	5834877
24	NC_001327	TA	7	6546	6558	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_001327	ATC	4	7268	7279	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	5834878
26	NC_001327	GTTT	3	7324	7335	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	5834878
27	NC_001327	T	14	7475	7488	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	5834879
28	NC_001327	TAT	4	8212	8223	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5834879
29	NC_001327	TTAT	3	8492	8503	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	5834879
30	NC_001327	TGGTA	3	8872	8885	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	5834880
31	NC_001327	TGTT	3	9364	9375	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	5834880
32	NC_001327	ATAAG	3	10411	10425	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_001327	GTTT	3	11441	11452	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_001327	ATTTTT	3	11870	11888	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
35	NC_001327	TTTA	3	11970	11981	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_001327	TAA	4	12083	12094	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_001327	TTGGTT	3	12309	12326	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	5834882
38	NC_001327	GTTG	3	12623	12635	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	5834882
39	NC_001327	ATT	4	12871	12882	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	162424483
40	NC_001327	T	12	13695	13706	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	162424483
41	NC_001327	TATTT	3	13877	13890	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	162424483
42	NC_001327	CTTTT	3	14128	14141	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	162424483

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ascaris suum mitochondrion