ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Paramecium aurelia mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001324	ATA	5	627	641	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_001324	AGA	4	3530	3541	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	8928578
3	NC_001324	AAG	4	4768	4780	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	8928580
4	NC_001324	TAA	4	6544	6555	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8928582
5	NC_001324	TCC	4	7270	7281	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	8928584
6	NC_001324	GAA	4	7657	7667	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	8928584
7	NC_001324	AGA	4	8115	8126	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	8928585
8	NC_001324	GAA	5	9422	9436	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	8928586
9	NC_001324	AAG	5	9786	9800	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	8928586
10	NC_001324	AGA	4	9808	9819	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	8928586
11	NC_001324	GAA	4	10601	10612	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	8928586
12	NC_001324	TCT	4	16593	16604	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	8928591
13	NC_001324	AAG	4	20759	20770	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	8928593
14	NC_001324	AAG	4	24086	24098	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_001324	TAG	4	25701	25712	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	8928600
16	NC_001324	TCT	4	26397	26407	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	8928601
17	NC_001324	CAT	4	27867	27878	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	8928603
18	NC_001324	CTC	4	28959	28969	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	8928606
19	NC_001324	TTC	5	29024	29038	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	8928606
20	NC_001324	GAA	4	29847	29858	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	8928607
21	NC_001324	GAA	6	30053	30070	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001324	TCG	4	30158	30169	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	8928608
23	NC_001324	CCT	4	31002	31013	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001324	GAA	5	34256	34269	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	8928613
25	NC_001324	GAA	4	34406	34417	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	8928613
26	NC_001324	GAA	4	35028	35039	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	8928614
27	NC_001324	GAA	5	36248	36262	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	8928617
28	NC_001324	AGA	5	36796	36810	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	8928618
29	NC_001324	AGA	4	37089	37100	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	8928619
30	NC_001324	AAG	7	37331	37351	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	8928619
31	NC_001324	GAA	4	37561	37572	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	8928619
32	NC_001324	GAA	4	38382	38393	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	8928621
33	NC_001324	GAG	4	38849	38860	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	8928622
34	NC_001324	GAG	5	38915	38928	14	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	8928622
35	NC_001324	GAA	10	38983	39013	31	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	8928622
36	NC_001324	TAA	4	39878	39888	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_001324	AAT	4	40373	40384	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_001324	ATA	4	40455	40466	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Paramecium aurelia mitochondrion