ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Drosophila yakuba mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001322	ATA	4	382	393	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5834830
2	NC_001322	TAA	4	1072	1083	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5834830
3	NC_001322	TAA	4	1184	1195	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5834830
4	NC_001322	GGA	4	2137	2147	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	5834831
5	NC_001322	TAT	4	2707	2717	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	5834831
6	NC_001322	TAT	5	3292	3305	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	5834832
7	NC_001322	TAA	4	3833	3844	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_001322	ATT	4	3937	3948	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5834833
9	NC_001322	ATT	4	3986	3998	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	5834833
10	NC_001322	TTAAT	3	4300	4314	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	5834834
11	NC_001322	TTTAAC	4	4359	4382	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	5834834
12	NC_001322	ATT	4	4865	4876	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5834835
13	NC_001322	TTTAT	3	4994	5007	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	5834835
14	NC_001322	TAT	4	5622	5633	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	5834836
15	NC_001322	ATT	4	5845	5855	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	5834836
16	NC_001322	TA	15	6041	6068	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_001322	CTTT	3	6230	6240	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
18	NC_001322	TAA	5	6306	6319	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_001322	TAT	4	6489	6501	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	5834837
20	NC_001322	TTA	4	7293	7304	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5834837
21	NC_001322	AAG	4	7542	7553	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	5834837
22	NC_001322	ATT	4	7601	7612	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5834837
23	NC_001322	AAAT	3	7637	7647	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	5834837
24	NC_001322	AAG	4	7687	7697	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	5834837
25	NC_001322	AATT	3	8833	8844	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	5834838
26	NC_001322	AAAT	3	9006	9018	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	5834838
27	NC_001322	AAAT	3	9125	9135	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	5834838
28	NC_001322	AAAAT	3	9214	9227	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	5834838
29	NC_001322	AAT	4	9261	9272	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5834838
30	NC_001322	TAA	4	9287	9298	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5834838
31	NC_001322	ATT	4	9308	9318	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	5834838
32	NC_001322	AT	6	9497	9507	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	5834838
33	NC_001322	TAAA	5	9700	9720	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	5834839
34	NC_001322	TTTA	3	10178	10189	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	5834840
35	NC_001322	TTATTT	3	10260	10278	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	5834840
36	NC_001322	ATT	4	10869	10879	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	5834841
37	NC_001322	ATTA	5	11642	11662	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	5834841
38	NC_001322	AAAT	3	11913	11923	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	5834842
39	NC_001322	TAAA	3	12201	12212	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	5834842
40	NC_001322	TAAAGA	3	12420	12437	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	5834842
41	NC_001322	TAA	4	12638	12650	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	5834842
42	NC_001322	TTAA	3	13123	13134	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_001322	AAATA	3	13158	13171	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_001322	TAAA	3	13223	13233	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_001322	TAT	5	14405	14419	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_001322	ATT	4	14636	14646	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_001322	TAAAAA	3	14940	14958	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
48	NC_001322	AAAT	3	15020	15030	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_001322	TA	11	15089	15111	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_001322	ATTA	3	15152	15162	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_001322	TATAA	3	15261	15275	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_001322	T	13	15580	15592	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001322	TA	7	15638	15651	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_001322	TAATA	3	15656	15670	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_001322	TA	11	15804	15825	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_001322	AT	7	15844	15857	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_001322	A	12	15962	15973	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_001322	A	24	15980	16003	24	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Drosophila yakuba mitochondrion