ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Marchantia polymorpha chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001319	TAT	4	881	893	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466675
2	NC_001319	TAA	7	2507	2527	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466676
3	NC_001319	TTA	4	3399	3409	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466676
4	NC_001319	TTA	4	4199	4210	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_001319	ACA	8	4557	4580	24	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11466678
6	NC_001319	TAA	4	5815	5827	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_001319	TTA	4	10478	10489	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466680
8	NC_001319	TAT	4	13267	13277	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466681
9	NC_001319	TTA	4	16548	16559	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466682
10	NC_001319	AGA	4	17153	17164	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11466683
11	NC_001319	CTG	4	18030	18041	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466684
12	NC_001319	AAT	4	18437	18447	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_001319	TTG	4	20321	20332	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11466686
14	NC_001319	ATA	7	23323	23343	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_001319	TGC	5	28820	28834	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	11466695
16	NC_001319	AAG	4	29089	29100	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11466695
17	NC_001319	AAT	4	30731	30742	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466696
18	NC_001319	TAA	4	31114	31125	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466696
19	NC_001319	TAA	4	33748	33758	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466696
20	NC_001319	AAT	4	34445	34455	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466696
21	NC_001319	ATT	4	38147	38161	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_001319	TAT	4	39123	39134	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466698
23	NC_001319	TGC	4	41210	41221	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466699
24	NC_001319	GTA	4	43337	43349	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	11466702
25	NC_001319	TAT	4	43416	43428	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466702
26	NC_001319	TCA	4	44817	44827	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11466702
27	NC_001319	GCA	4	45997	46008	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466703
28	NC_001319	ATG	4	46323	46333	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11466703
29	NC_001319	TTA	4	49028	49039	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_001319	TAT	4	49667	49679	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466704
31	NC_001319	TAA	5	50760	50773	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_001319	ATT	5	52940	52954	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_001319	CTT	4	54044	54055	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466708
34	NC_001319	AGC	4	55439	55450	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466709
35	NC_001319	TAA	4	55912	55923	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_001319	TAT	5	59083	59098	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_001319	TTA	4	59428	59439	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_001319	AAG	4	60917	60928	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11466714
39	NC_001319	TAT	5	61545	61559	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_001319	GTT	4	63649	63660	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11466720
41	NC_001319	TTA	4	64131	64142	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_001319	TTA	4	64627	64639	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_001319	TTA	4	65213	65223	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_001319	TTG	4	65422	65433	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11466724
45	NC_001319	ATG	4	66017	66027	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11466726
46	NC_001319	CTT	4	67303	67314	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466727
47	NC_001319	TCT	4	68591	68602	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466727
48	NC_001319	CAA	4	70527	70538	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11466728
49	NC_001319	AAT	4	76502	76512	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466740
50	NC_001319	TCT	4	78073	78085	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11466742
51	NC_001319	TTA	4	79004	79015	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466744
52	NC_001319	ACG	4	79149	79160	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466745
53	NC_001319	TAT	4	79863	79874	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466745
54	NC_001319	TTC	4	88724	88734	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_001319	TAA	4	89781	89792	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_001319	ATA	4	93043	93054	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466747
57	NC_001319	AAT	4	96902	96913	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466752
58	NC_001319	ATT	4	96912	96922	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466752
59	NC_001319	ATT	4	97525	97535	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466752
60	NC_001319	TAA	4	97889	97899	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466752
61	NC_001319	CAG	4	98846	98856	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11466754
62	NC_001319	TAA	4	99356	99367	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466755
63	NC_001319	AAT	4	103782	103792	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_001319	ATA	4	104765	104776	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466760
65	NC_001319	ATA	4	107886	107897	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466761
66	NC_001319	TAA	4	110538	110549	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466762
67	NC_001319	AGA	4	113387	113398	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Marchantia polymorpha chloroplast