ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Marchantia polymorpha chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001319	AT	13	2286	2311	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466676
2	NC_001319	TA	42	3578	3658	81	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_001319	AT	6	4767	4777	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466678
4	NC_001319	AT	12	5313	5337	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_001319	AT	27	5380	5433	54	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_001319	AT	6	12559	12572	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466681
7	NC_001319	AT	6	15990	16000	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_001319	AT	7	19177	19189	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466685
9	NC_001319	AT	7	22060	22072	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_001319	TA	6	22470	22480	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_001319	AT	34	22686	22750	65	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_001319	AT	6	22824	22834	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_001319	TA	7	22839	22851	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_001319	TC	6	22966	22977	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
15	NC_001319	TA	7	23349	23361	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_001319	AT	8	26664	26679	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_001319	TA	6	31043	31054	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466696
18	NC_001319	AT	6	33202	33212	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466696
19	NC_001319	AT	8	36347	36362	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_001319	TA	12	38166	38191	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_001319	AG	6	41407	41417	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_001319	TA	7	41971	41984	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_001319	TA	17	41987	42019	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_001319	TA	6	49243	49253	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_001319	TA	7	50398	50410	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_001319	AT	6	52895	52905	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_001319	AT	7	53692	53705	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_001319	TA	19	56032	56069	38	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_001319	AT	19	56073	56109	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_001319	TA	9	63805	63822	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_001319	AT	6	63986	63998	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_001319	AT	6	63997	64007	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_001319	TA	7	64048	64061	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_001319	AT	11	64677	64700	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_001319	TA	7	64853	64866	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_001319	TA	9	64972	64988	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_001319	TG	6	66192	66203	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_001319	AT	8	66523	66537	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_001319	TA	8	67473	67488	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11466727
40	NC_001319	AT	6	68203	68214	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466727
41	NC_001319	AT	6	78395	78406	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466742
42	NC_001319	TA	6	95419	95429	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_001319	AT	6	96475	96485	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_001319	AT	8	98203	98218	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_001319	AT	8	98579	98594	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_001319	AT	6	101393	101403	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466757
47	NC_001319	AT	6	106294	106304	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466761
48	NC_001319	AT	6	110063	110074	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Marchantia polymorpha chloroplast