Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Arabidopsis thaliana mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_001284AGA4313931491166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
2NC_001284CAT4372037311233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
3NC_001284GAA5850785211566.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
4NC_001284TGC41508515096120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
5NC_001284GAA415841158521266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
6NC_001284ATT420567205781233.33 %66.67 %0 %0 %8 %13449295
7NC_001284ACT422566225761133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %13449295
8NC_001284CTC52498324997150 %33.33 %0 %66.67 %6 %13449295
9NC_001284TTC42679226804130 %66.67 %0 %33.33 %7 %13449295
10NC_001284GTC42690926920120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %13449295
11NC_001284ATA427069270811366.67 %33.33 %0 %0 %7 %13449295
12NC_001284GCG42826428274110 %0 %66.67 %33.33 %9 %13449295
13NC_001284TAT431257312671133.33 %66.67 %0 %0 %9 %13449295
14NC_001284ATA431273312841266.67 %33.33 %0 %0 %8 %13449295
15NC_001284CTT43306133071110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449295
16NC_001284AGA433894339051266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13449295
17NC_001284TTA435968359801333.33 %66.67 %0 %0 %7 %13449295
18NC_001284AGC538811388251533.33 %0 %33.33 %33.33 %6 %13449295
19NC_001284TTC43905339065130 %66.67 %0 %33.33 %7 %13449295
20NC_001284TTC43996639978130 %66.67 %0 %33.33 %7 %13449295
21NC_001284TTC54277142785150 %66.67 %0 %33.33 %6 %13449295
22NC_001284AGA444048440591266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13449295
23NC_001284TGA445735457451133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %13449295
24NC_001284TCC44674946760120 %33.33 %0 %66.67 %8 %13449295
25NC_001284GTC45215152162120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %13449295
26NC_001284AAG453643536531166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13449295
27NC_001284AGC454007540181233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %13449295
28NC_001284CAA455118551291266.67 %0 %0 %33.33 %8 %13449295
29NC_001284AGG557722577361533.33 %0 %66.67 %0 %6 %13449295
30NC_001284TCT46083460845120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13449295
31NC_001284TTC46132761338120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13449295
32NC_001284GAA461755617661266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13449295
33NC_001284ATA462135621451166.67 %33.33 %0 %0 %9 %13449295
34NC_001284GAA462732627431266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13449295
35NC_001284AGA463164631751266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13449295
36NC_001284TGT46346863479120 %66.67 %33.33 %0 %8 %13449295
37NC_001284ACA463661636711166.67 %0 %0 %33.33 %9 %13449295
38NC_001284TTC46767567686120 %66.67 %0 %33.33 %0 %13449295
39NC_001284TCG47033970349110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %13449295
40NC_001284AAG471352713621166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13449295
41NC_001284AGA471442714521166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13449295
42NC_001284AGA678845788631966.67 %0 %33.33 %0 %10 %13449295
43NC_001284TTC48219282202110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
44NC_001284CTA487992880031233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %13449314
45NC_001284TCT49060490614110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
46NC_001284CTT49406094072130 %66.67 %0 %33.33 %7 %13449314
47NC_001284CTT49421994230120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13449314
48NC_001284CCA41023001023111233.33 %0 %0 %66.67 %8 %13449314
49NC_001284AGA41037561037661166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13449314
50NC_001284GAA41041971042071166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13449314
51NC_001284TAG41046961047061133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %13449314
52NC_001284AGA41052321052421166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13449314
53NC_001284GAA41060971061071166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13449314
54NC_001284CTA41076661076771233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %13449314
55NC_001284ATA41094131094231166.67 %33.33 %0 %0 %9 %13449314
56NC_001284TAA41109351109461266.67 %33.33 %0 %0 %8 %13449314
57NC_001284TTC5115015115029150 %66.67 %0 %33.33 %6 %13449314
58NC_001284TTC4115304115314110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
59NC_001284CTA51161571161701433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %13449314
60NC_001284GAA41181791181891166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13449314
61NC_001284CTT4118200118211120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13449314
62NC_001284TCA41191421191531233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %13449314
63NC_001284TCT4119400119410110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
64NC_001284CTT4121143121154120 %66.67 %0 %33.33 %0 %13449314
65NC_001284TCT4121312121324130 %66.67 %0 %33.33 %7 %13449314
66NC_001284AAG41214481214601366.67 %0 %33.33 %0 %7 %13449314
67NC_001284AAT41219511219611166.67 %33.33 %0 %0 %9 %13449314
68NC_001284CTT4127171127182120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13449314
69NC_001284ATA41272591272701266.67 %33.33 %0 %0 %8 %13449314
70NC_001284TCT4129632129643120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13449314
71NC_001284TGG4130956130966110 %33.33 %66.67 %0 %9 %13449314
72NC_001284CTT4130993131004120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13449314
73NC_001284ATC41325441325551233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %13449314
74NC_001284ACA41333441333551266.67 %0 %0 %33.33 %8 %13449314
75NC_001284TCC4144750144762130 %33.33 %0 %66.67 %7 %13449314
76NC_001284ATG41476101476211233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %13449314
77NC_001284TTC4149682149692110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
78NC_001284TCT4153059153069110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
79NC_001284TTC4153206153218130 %66.67 %0 %33.33 %7 %13449314
80NC_001284AAG41539731539841266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13449314
81NC_001284ATA41545381545501366.67 %33.33 %0 %0 %7 %13449314
82NC_001284AGG51546951547091533.33 %0 %66.67 %0 %6 %13449314
83NC_001284TCT4155240155250110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
84NC_001284CTT4157871157882120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13449314
85NC_001284CAA41579451579561266.67 %0 %0 %33.33 %8 %13449314
86NC_001284TTC4160040160052130 %66.67 %0 %33.33 %7 %13449314
87NC_001284GTA41605831605931133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %13449314
88NC_001284CTC4160880160890110 %33.33 %0 %66.67 %9 %13449314
89NC_001284ATG41610361610461133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %13449314
90NC_001284CGT4162236162248130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %13449314
91NC_001284GCC4162665162675110 %0 %33.33 %66.67 %9 %13449314
92NC_001284AGT41630541630651233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %13449314
93NC_001284CTT4164473164484120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13449314
94NC_001284TTG4164848164859120 %66.67 %33.33 %0 %8 %13449314
95NC_001284CGT4166898166908110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %13449314
96NC_001284CAG41684761684871233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %13449314
97NC_001284TGT4171396171407120 %66.67 %33.33 %0 %8 %13449314
98NC_001284TCT4172869172882140 %66.67 %0 %33.33 %7 %13449314
99NC_001284AGA41766791766901266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13449314
100NC_001284TTC4177079177089110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
101NC_001284TGA41799001799101133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %13449314
102NC_001284TCC4180914180925120 %33.33 %0 %66.67 %8 %13449314
103NC_001284CAT41890611890711133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %13449314
104NC_001284ATC41907511907611133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %13449314
105NC_001284GGA41914601914711233.33 %0 %66.67 %0 %8 %13449314
106NC_001284GCA41976401976511233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %13449314
107NC_001284GCT4203902203912110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %13449314
108NC_001284CTT4206928206939120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13449314
109NC_001284TTC4208208208218110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
110NC_001284TCC4211627211637110 %33.33 %0 %66.67 %9 %13449314
111NC_001284ACT42119302119421333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %13449314
112NC_001284AGG42140952141051133.33 %0 %66.67 %0 %9 %13449314
113NC_001284AGC42147872147971133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %13449314
114NC_001284TTC4215845215856120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13449314
115NC_001284TCC4220229220240120 %33.33 %0 %66.67 %8 %13449314
116NC_001284GAA42230832230931166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13449314
117NC_001284GAA42274792274891166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13449314
118NC_001284ATA42327872327971166.67 %33.33 %0 %0 %9 %13449314
119NC_001284AAG42344212344311166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13449314
120NC_001284AAG42378262378371266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13449314
121NC_001284AGA42477392477511366.67 %0 %33.33 %0 %7 %13449314
122NC_001284CGT4248089248100120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %13449314
123NC_001284ACC42572542572661333.33 %0 %0 %66.67 %7 %13449314
124NC_001284ACT42576192576301233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %13449314
125NC_001284TAG42601072601171133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %13449314
126NC_001284TCT4264521264532120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13449314
127NC_001284GAA42755432755531166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13449314
128NC_001284GGT4282686282696110 %33.33 %66.67 %0 %9 %13449314
129NC_001284CCT4288660288672130 %33.33 %0 %66.67 %7 %13449314
130NC_001284CAA42907202907321366.67 %0 %0 %33.33 %7 %13449314
131NC_001284TTC4291538291548110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
132NC_001284TTC4291948291958110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
133NC_001284TAG52935572935701433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %13449314
134NC_001284GAA52946982947121566.67 %0 %33.33 %0 %6 %13449314
135NC_001284GGA42948252948361233.33 %0 %66.67 %0 %8 %13449314
136NC_001284CAA43002773002871166.67 %0 %0 %33.33 %9 %13449314
137NC_001284CTT4308395308405110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
138NC_001284GCT4309692309703120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %13449314
139NC_001284AAG43097873097981266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13449314
140NC_001284ATA53118663118791466.67 %33.33 %0 %0 %7 %13449314
141NC_001284ATA43127863127961166.67 %33.33 %0 %0 %9 %13449314
142NC_001284GAA43139113139221266.67 %0 %33.33 %0 %0 %13449314
143NC_001284CTT4322407322417110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13449314
144NC_001284GAA43241293241401266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13449314
145NC_001284GTA53288453288581433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %13449314
146NC_001284AGA43301573301681266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13449314
147NC_001284CGC4331182331194130 %0 %33.33 %66.67 %7 %13449314
148NC_001284CTT4333934333944110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
149NC_001284CTT4337129337141130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
150NC_001284ATA43381963382061166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
151NC_001284AGA43387853387971366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
152NC_001284GCT4341085341096120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
153NC_001284ATT43419733419841233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
154NC_001284GAA43420323420421166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
155NC_001284GCA43461753461851133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
156NC_001284TTC4346610346620110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
157NC_001284GCG5347172347185140 %0 %66.67 %33.33 %7 %13449403
158NC_001284CTA43510443510551233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %13449404
159NC_001284ATT43517603517711233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
160NC_001284GCA43530523530631233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
161NC_001284GCA43536783536891233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
162NC_001284CGT4361910361921120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
163NC_001284GTT4362281362291110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
164NC_001284CAT43642333642451333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
165NC_001284CAC43663573663671133.33 %0 %0 %66.67 %9 %13449407