ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces cerevisiae S288c mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001224	TATAA	3	294	307	14	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_001224	AATAT	3	1034	1048	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_001224	TAATA	3	1959	1973	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_001224	TCATT	3	2347	2361	15	20 %	60 %	20 %	6 %	Non-Coding
5	NC_001224	TAATA	5	2682	2706	25	60 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_001224	TAATA	6	2719	2747	29	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_001224	ATATT	6	3764	3793	30	40 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_001224	TTATT	3	3813	3826	14	20 %	80 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_001224	TTTTA	3	4966	4979	14	20 %	80 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_001224	TATTT	3	6970	6984	15	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001224	ATATA	5	8338	8362	25	60 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_001224	AATAT	3	8388	8402	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_001224	TAATA	5	9534	9558	25	60 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_001224	AATTA	5	10098	10122	25	60 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_001224	TAATA	5	10177	10200	24	60 %	40 %	0 %	4 %	Non-Coding
16	NC_001224	ATATA	5	10493	10517	25	60 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_001224	CCTAT	4	11704	11723	20	20 %	40 %	40 %	10 %	Non-Coding
18	NC_001224	CATAT	4	11724	11743	20	40 %	40 %	20 %	5 %	Non-Coding
19	NC_001224	TATAT	4	11744	11763	20	40 %	60 %	0 %	10 %	Non-Coding
20	NC_001224	TAAAT	6	13724	13753	30	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_001224	AAAAT	5	23818	23841	24	80 %	20 %	0 %	8 %	6226519
22	NC_001224	AAATT	3	25097	25110	14	60 %	40 %	0 %	7 %	6226519
23	NC_001224	AATTT	4	27975	27994	20	40 %	60 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_001224	TAAAA	3	29734	29747	14	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_001224	TTATA	3	30054	30068	15	40 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_001224	ATATA	3	31771	31785	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_001224	AAATA	4	32728	32747	20	80 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_001224	ATATA	6	32907	32937	31	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_001224	TATTT	6	33390	33418	29	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_001224	TAATA	9	33491	33534	44	60 %	40 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_001224	TATAA	3	34345	34359	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_001224	TTTTA	17	35187	35270	84	20 %	80 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_001224	ATATT	3	36107	36121	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001224	ATATA	3	43927	43942	16	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_001224	TTTTA	3	45902	45916	15	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_001224	ATAAA	4	46999	47018	20	80 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_001224	AATAT	3	47607	47621	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_001224	AATAT	3	50262	50276	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001224	AAAAT	3	50666	50679	14	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_001224	ATATA	3	51632	51645	14	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_001224	TAATT	3	51666	51680	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001224	ATTAT	7	51833	51866	34	40 %	60 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_001224	AATTA	5	52126	52154	29	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_001224	AATTA	4	53070	53089	20	60 %	40 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_001224	ATAAA	4	53090	53109	20	80 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_001224	AATTA	7	53153	53186	34	60 %	40 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_001224	TATAT	18	54344	54428	85	40 %	60 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_001224	TTTTA	3	55475	55489	15	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_001224	ATATA	5	55893	55917	25	60 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_001224	ATTTT	3	56029	56042	14	20 %	80 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_001224	AATTA	6	56092	56122	31	60 %	40 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_001224	ATTAA	3	56124	56138	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001224	AATAT	5	56176	56200	25	60 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_001224	ATTAT	4	56719	56739	21	40 %	60 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_001224	ATATA	3	57539	57553	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001224	ATTAT	3	57938	57952	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001224	AAAAT	3	61009	61023	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6226538
58	NC_001224	TATAT	4	62698	62716	19	40 %	60 %	0 %	10 %	Non-Coding
59	NC_001224	TATAT	5	62923	62947	25	40 %	60 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_001224	ATATT	3	62979	62993	15	40 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_001224	TTATA	5	63137	63161	25	40 %	60 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_001224	AATAA	3	65004	65018	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001224	TATAT	5	66457	66480	24	40 %	60 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_001224	ATTTT	5	66550	66574	25	20 %	80 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_001224	TTATA	5	67599	67623	25	40 %	60 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_001224	ATTAT	5	68866	68890	25	40 %	60 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_001224	ATATT	9	68894	68938	45	40 %	60 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_001224	ATATT	6	69355	69384	30	40 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_001224	TTTTA	3	69807	69820	14	20 %	80 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_001224	TATAA	3	70034	70048	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001224	TATAT	7	71612	71644	33	40 %	60 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_001224	ATATT	3	71878	71897	20	40 %	60 %	0 %	5 %	Non-Coding
73	NC_001224	TATAT	5	71964	71988	25	40 %	60 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_001224	AAATA	4	73091	73110	20	80 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
75	NC_001224	TAAAA	3	76646	76660	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001224	TATAA	9	76711	76755	45	60 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_001224	AATAT	3	78790	78803	14	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_001224	ATATA	5	80380	80403	24	60 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_001224	AATTA	10	81472	81520	49	60 %	40 %	0 %	4 %	Non-Coding
80	NC_001224	ATATA	3	82629	82642	14	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_001224	ATATA	5	83594	83618	25	60 %	40 %	0 %	4 %	Non-Coding
82	NC_001224	TTATA	3	83738	83752	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001224	AATAT	5	84880	84904	25	60 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_001224	TATAA	4	85001	85019	19	60 %	40 %	0 %	10 %	Non-Coding
85	NC_001224	AATAT	3	85257	85270	14	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces cerevisiae S288c mitochondrion