ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces cerevisiae S288c mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001224	ATAAAT	3	2399	2416	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_001224	TAATAT	3	6240	6257	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001224	GGTTTA	3	6790	6808	19	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_001224	ATATTA	4	8210	8233	24	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
5	NC_001224	AATATA	11	8279	8342	64	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_001224	ATAAAT	3	8369	8387	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
7	NC_001224	TTATAA	5	8483	8512	30	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_001224	TTTAAT	3	8782	8799	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_001224	TAATTA	3	10160	10176	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_001224	ATAAAA	4	10206	10228	23	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_001224	TATAAA	6	10287	10322	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_001224	TATTTA	3	10880	10903	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_001224	TTAATA	3	11102	11120	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
14	NC_001224	TTTTAT	4	11811	11833	23	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_001224	ATAAAA	3	22266	22289	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	0 %	6226519
16	NC_001224	ATTAAT	6	27145	27180	36	50 %	50 %	0 %	0 %	2 %	Non-Coding
17	NC_001224	TATTTT	3	28379	28396	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_001224	TTTATT	3	28793	28810	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	6226527
19	NC_001224	TATTTA	3	29448	29465	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_001224	ATTATA	3	30901	30918	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_001224	TACGGA	4	31237	31260	24	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
22	NC_001224	TAAAAA	10	31530	31589	60	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	1 %	Non-Coding
23	NC_001224	TATTTT	3	32171	32188	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_001224	ATTAAT	3	32856	32873	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_001224	AAAATA	4	33627	33652	26	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_001224	TAAATA	8	34053	34100	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_001224	ATAAAT	4	34140	34163	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_001224	ATAAAA	3	43705	43722	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001224	TTATAA	3	44327	44345	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
30	NC_001224	TAATAT	5	47436	47464	29	50 %	50 %	0 %	0 %	3 %	Non-Coding
31	NC_001224	ATATTT	8	48147	48193	47	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_001224	TTTATA	4	48540	48563	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_001224	ATATTA	4	48843	48866	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_001224	TAAAAA	3	48879	48897	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_001224	AATTTT	3	50818	50835	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_001224	TAACTA	9	51096	51154	59	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
37	NC_001224	TAATAT	4	51390	51413	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_001224	ATATTA	6	51979	52012	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_001224	TTTATA	3	52210	52227	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_001224	TATAAT	5	52687	52716	30	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_001224	TTATAT	4	52887	52909	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_001224	TATTTA	4	54174	54197	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_001224	ATTACA	3	54218	54235	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
44	NC_001224	ATATTA	8	54331	54374	44	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_001224	AGTATC	5	55270	55299	30	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	6 %	Non-Coding
46	NC_001224	TAAATA	3	55779	55797	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_001224	AATTAT	3	56074	56091	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
48	NC_001224	TATAAA	4	57339	57362	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
49	NC_001224	TTATAT	3	57753	57770	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001224	TATATT	3	57959	57977	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_001224	ATATTA	4	58757	58778	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_001224	ATTATA	4	62500	62523	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_001224	TAAGTA	13	63583	63659	77	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_001224	TTATAA	3	63778	63796	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
55	NC_001224	TATTTA	4	65622	65645	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_001224	ATATAA	4	69822	69844	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_001224	TTATAT	4	70704	70726	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_001224	ATTATA	4	71096	71119	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_001224	TATTTA	3	72156	72173	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_001224	ATATTA	3	76366	76383	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_001224	ATACGG	8	76807	76854	48	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	2 %	Non-Coding
62	NC_001224	AATATA	3	76896	76912	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_001224	TTAATA	3	76991	77009	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
64	NC_001224	AAATAT	4	77198	77221	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_001224	AAATAT	6	77714	77748	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_001224	TAATAT	4	80289	80310	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_001224	TAAAAA	4	80911	80934	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_001224	ATAAAT	3	82481	82497	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_001224	TAATAT	7	82943	82981	39	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_001224	TAAAAA	4	83277	83300	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_001224	ATTAAT	4	83768	83791	24	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001224	TATTTT	3	84012	84030	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
73	NC_001224	TATTTT	3	84798	84815	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_001224	ATTAAT	3	85512	85528	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces cerevisiae S288c mitochondrion