ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces cerevisiae S288c mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001224	AAAT	5	177	195	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
2	NC_001224	TTAA	8	251	282	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_001224	ATAA	4	1703	1718	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_001224	AATA	4	1746	1761	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_001224	TTAA	3	2168	2178	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_001224	ATTT	6	2821	2844	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_001224	TATT	8	3225	3255	31	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_001224	TTAT	3	3598	3609	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_001224	TAGA	6	3631	3652	22	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_001224	ATTT	3	3663	3673	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_001224	TTAA	3	3751	3763	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_001224	TTAT	3	4350	4361	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_001224	TAAT	6	4498	4520	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_001224	ATTT	3	5052	5063	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_001224	TATT	3	5325	5336	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_001224	ATTT	6	5421	5444	24	25 %	75 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
17	NC_001224	ATTT	3	5590	5601	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_001224	ATTT	3	5862	5872	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_001224	ATTT	4	6417	6436	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_001224	AAAT	3	7463	7473	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_001224	ATAA	5	8470	8488	19	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_001224	ATAA	3	8877	8888	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001224	AATA	6	9343	9365	23	75 %	25 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
24	NC_001224	TATT	4	9465	9480	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_001224	TTAA	8	9585	9616	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_001224	TTAA	3	9750	9760	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_001224	TAAA	3	10461	10472	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001224	ATAA	7	12038	12066	29	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_001224	TTTA	3	12109	12119	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_001224	TAAT	4	12163	12178	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001224	AATT	4	12222	12237	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_001224	ATTA	3	13635	13645	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_001224	ATTG	3	14953	14964	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	6226519
34	NC_001224	TTTA	3	15048	15059	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	6226519
35	NC_001224	AAAG	3	17173	17184	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	6226519
36	NC_001224	ATAA	4	19989	20004	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	6226519
37	NC_001224	AAAT	3	21926	21937	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	6226519
38	NC_001224	ATTA	8	23156	23186	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	6226519
39	NC_001224	ATTT	3	23187	23197	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	6226519
40	NC_001224	TCAA	3	24988	24998	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	6226519
41	NC_001224	TAAT	3	25289	25300	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	6226519
42	NC_001224	ATTT	3	26710	26721	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_001224	TTAA	3	26724	26734	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_001224	ATTA	3	27404	27416	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_001224	TTAT	6	28262	28285	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_001224	TTTA	3	28403	28414	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_001224	TTAA	3	28491	28502	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	6226527
48	NC_001224	ATTT	3	28567	28578	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	6226527
49	NC_001224	TATT	3	29378	29389	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001224	TTAA	3	29623	29633	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_001224	ATAA	3	30402	30413	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001224	TTTA	4	31328	31343	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_001224	ATAA	5	31432	31452	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_001224	TATT	3	31629	31640	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001224	ATAA	4	32554	32568	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_001224	AATA	9	32813	32848	36	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_001224	TAAA	3	33902	33914	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_001224	TAAT	17	34640	34703	64	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_001224	AATA	3	34978	34990	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_001224	AATT	3	35503	35513	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_001224	TATT	13	36041	36094	54	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_001224	ATAA	4	36521	36535	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_001224	TTAA	6	37547	37574	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	6226529
64	NC_001224	GAAA	3	38016	38026	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	6226529
65	NC_001224	ATAA	3	39070	39081	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	6226529
66	NC_001224	TAAA	3	41440	41450	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	6226529
67	NC_001224	TTTA	3	41451	41462	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	6226529
68	NC_001224	ATTA	4	42742	42757	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	6226529
69	NC_001224	ATAA	3	43869	43880	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_001224	ATCT	3	43906	43917	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001224	TAAT	3	44648	44659	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001224	TATT	3	44686	44697	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001224	ATTT	3	44866	44876	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_001224	ATTT	5	45920	45943	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_001224	ATAA	5	46969	46987	19	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
76	NC_001224	ATAA	6	47155	47178	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_001224	ATCT	5	47629	47648	20	25 %	50 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
78	NC_001224	TTTA	3	47765	47777	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_001224	AATT	7	47890	47915	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_001224	AATA	3	48010	48021	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_001224	ATAA	6	48335	48358	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_001224	TAAT	6	48359	48381	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_001224	TATT	3	48564	48575	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_001224	TAAA	3	49160	49172	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	6226534
85	NC_001224	TTAA	3	49934	49945	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	6226534
86	NC_001224	ATAA	7	50166	50193	28	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_001224	ATTA	4	50324	50339	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_001224	ATTT	3	51205	51220	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_001224	TTAT	6	51710	51733	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_001224	AATT	3	51765	51775	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_001224	TTTA	6	51905	51928	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_001224	AATA	4	51953	51967	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_001224	ATAA	4	52510	52525	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_001224	TTAT	3	52931	52942	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_001224	ATTA	8	53375	53406	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_001224	TATT	4	54460	54474	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_001224	AATT	3	54748	54760	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_001224	TTTA	4	55155	55169	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_001224	ATTT	3	55239	55250	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001224	TAAA	3	55365	55376	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001224	TTAT	3	55860	55872	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_001224	ATAA	4	56329	56343	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_001224	AAAT	3	56963	56973	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_001224	ATAA	3	57380	57391	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001224	ATTA	4	57786	57801	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_001224	TAAT	3	59373	59385	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_001224	ATTA	5	59461	59481	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_001224	ATAA	4	60321	60336	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_001224	AAGT	3	60644	60655	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_001224	AATT	4	60767	60782	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_001224	TAAA	3	61374	61384	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	6226538
112	NC_001224	AATT	3	62295	62305	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_001224	ATAA	7	62605	62630	26	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_001224	ATTT	8	63035	63066	32	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_001224	AATT	3	63978	63989	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_001224	TTAA	5	64900	64923	24	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
117	NC_001224	ATTT	8	65205	65236	32	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_001224	ATTA	4	66339	66354	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_001224	TAAA	4	66741	66755	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_001224	TTAA	5	66919	66938	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
121	NC_001224	AATA	3	67775	67786	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001224	ATAA	3	67912	67923	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001224	ATAA	6	68567	68588	22	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_001224	ATTT	3	68730	68740	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_001224	TATT	5	69024	69043	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
126	NC_001224	AATT	7	69127	69154	28	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
127	NC_001224	TATT	6	69155	69178	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_001224	ATTT	6	69401	69424	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_001224	TTAA	5	69581	69599	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
130	NC_001224	ATAA	3	69785	69796	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_001224	TTAA	3	70054	70065	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_001224	AATA	6	71066	71089	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_001224	TATT	7	71324	71351	28	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_001224	TTTA	3	71390	71401	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001224	ATTA	3	71940	71951	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_001224	TATT	5	72278	72297	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
137	NC_001224	TAAT	4	72319	72333	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
138	NC_001224	ATAA	3	72667	72678	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_001224	ATTA	3	72855	72866	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_001224	AAAT	6	72925	72948	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_001224	ATAA	5	73052	73071	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
142	NC_001224	TAAA	3	74587	74599	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	6226541
143	NC_001224	TAAA	3	74676	74686	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	6226541
144	NC_001224	TACA	3	75534	75544	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	6226541
145	NC_001224	TAAA	3	76068	76079	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
146	NC_001224	TAAT	3	76104	76115	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_001224	ATAA	11	76929	76972	44	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
148	NC_001224	ATTA	4	77297	77312	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
149	NC_001224	ATTA	4	77516	77530	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
150	NC_001224	TTAT	5	77610	77629	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
151	NC_001224	TTTA	3	77661	77672	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
152	NC_001224	ATTT	3	78080	78090	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
153	NC_001224	AATT	3	78358	78369	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
154	NC_001224	TTAT	3	78953	78964	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
155	NC_001224	TATT	4	79160	79175	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
156	NC_001224	ATTA	3	81025	81036	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_001224	AAAT	5	81109	81128	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
158	NC_001224	AATT	3	81387	81397	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
159	NC_001224	AAAG	3	81827	81837	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
160	NC_001224	ATAA	3	82749	82759	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
161	NC_001224	TTAA	3	83245	83255	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
162	NC_001224	ATAA	4	83514	83529	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
163	NC_001224	TAAT	4	83811	83826	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
164	NC_001224	AAAT	3	83869	83881	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
165	NC_001224	TATT	3	84284	84295	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_001224	TAAT	8	84427	84458	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
167	NC_001224	AATT	4	85241	85256	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
168	NC_001224	ATAA	3	85323	85334	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
169	NC_001224	ATAA	3	85541	85552	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces cerevisiae S288c mitochondrion