ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Arabidopsis thaliana chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_000932	TAT	9	207	232	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_000932	ATA	5	4690	4703	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_000932	ATA	4	4714	4726	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_000932	AAT	4	4932	4943	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_000932	TTC	4	6507	6517	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_000932	TAT	4	8048	8060	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_000932	ATT	4	12254	12265	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	7525019
8	NC_000932	AAT	4	12978	12989	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000932	GTT	4	23057	23068	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	7525024
10	NC_000932	TCA	4	25411	25421	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	7525025
11	NC_000932	TTA	4	27222	27233	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_000932	TAT	5	28824	28838	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_000932	TAA	5	31543	31558	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_000932	ATG	4	38749	38759	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	7525032
15	NC_000932	GCA	4	40647	40658	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	7525033
16	NC_000932	ATG	4	40973	40983	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	7525033
17	NC_000932	GAA	4	44132	44143	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	157011953
18	NC_000932	TAG	4	44230	44240	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	157011953
19	NC_000932	AAT	4	44446	44457	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	157011953
20	NC_000932	AAT	6	46580	46598	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_000932	ATA	5	50595	50608	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_000932	TTA	4	51250	51261	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_000932	TTG	4	54902	54912	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_000932	TCT	4	78185	78195	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	7525080
25	NC_000932	ATC	4	81831	81841	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	7525080
26	NC_000932	GAT	4	84857	84867	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	7525080
27	NC_000932	AGA	4	90013	90023	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	7525080
28	NC_000932	AAT	4	95365	95375	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	7525080
29	NC_000932	TTC	4	99175	99186	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	7525057
30	NC_000932	ATT	4	111085	111097	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	7525057
31	NC_000932	TCT	4	111188	111198	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	7525057
32	NC_000932	AAG	4	111790	111801	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	7525057
33	NC_000932	ACA	4	115078	115088	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	7525057
34	NC_000932	ATT	4	119039	119050	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	7525057
35	NC_000932	TAT	6	119156	119172	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	7525057
36	NC_000932	AGA	4	125265	125275	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	7525057
37	NC_000932	TTC	4	127004	127015	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	7525057
38	NC_000932	TCT	4	127534	127544	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	7525057
39	NC_000932	GAA	4	139463	139474	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	7525057
40	NC_000932	TGT	4	148933	148943	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	7525097
41	NC_000932	AGA	4	149092	149103	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	7525097
42	NC_000932	ATC	4	153782	153792	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	7525099

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Arabidopsis thaliana chloroplast