ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Arabidopsis thaliana chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_000932	AT	6	3825	3836	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_000932	TA	8	7995	8010	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_000932	AT	8	8055	8069	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_000932	AT	8	8088	8103	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_000932	AT	14	8115	8140	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_000932	TA	12	8167	8190	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_000932	AT	6	8191	8203	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_000932	AT	6	8205	8215	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_000932	TA	6	9713	9723	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_000932	TA	6	12403	12413	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	7525019
11	NC_000932	AT	6	13715	13725	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_000932	TC	6	28140	28151	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	7525026
13	NC_000932	AT	11	31308	31328	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_000932	AG	6	31899	31910	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_000932	AG	6	35312	35322	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_000932	AT	6	36318	36328	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_000932	AT	6	36331	36344	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_000932	AT	8	36346	36362	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_000932	TG	6	40684	40694	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	7525033
20	NC_000932	AT	6	45987	45998	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_000932	TA	8	46471	46488	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_000932	TA	6	57197	57207	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	7525042
23	NC_000932	AT	6	61726	61736	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	7525046
24	NC_000932	AT	11	63120	63140	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_000932	TA	6	63726	63736	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_000932	AT	6	66870	66880	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_000932	TA	6	66881	66891	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_000932	AT	6	71544	71554	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	7525080
29	NC_000932	TA	6	94519	94531	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	7525080
30	NC_000932	AT	6	94532	94544	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	7525080
31	NC_000932	TA	6	112698	112709	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	7525057
32	NC_000932	AT	6	119120	119130	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	7525057
33	NC_000932	TA	6	119204	119215	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	7525057
34	NC_000932	TA	6	123859	123869	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	7525057
35	NC_000932	TA	6	124360	124370	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	7525057
36	NC_000932	TC	6	135908	135919	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	7525057
37	NC_000932	AT	7	144105	144117	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_000932	AT	6	144120	144131	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Arabidopsis thaliana chloroplast