ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Nephroselmis olivacea chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_000927	CAAA	3	425	435	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11467756
2	NC_000927	AATC	3	708	719	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_000927	AAAT	3	897	907	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_000927	TGGA	3	2456	2467	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	11467758
5	NC_000927	TCA	4	3295	3306	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11467758
6	NC_000927	AAAT	3	3977	3988	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_000927	GCA	4	6938	6949	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467760
8	NC_000927	TAAA	3	7470	7480	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_000927	CAT	4	9932	9942	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_000927	AAC	4	10364	10375	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11467766
11	NC_000927	TATC	3	10846	10856	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11467766
12	NC_000927	TCGACT	3	10921	10938	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	11467766
13	NC_000927	TGT	4	15544	15554	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11467774
14	NC_000927	GACTT	3	16374	16388	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	11467776
15	NC_000927	CG	6	16607	16617	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	11467776
16	NC_000927	TA	6	17296	17306	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_000927	TCT	4	19260	19271	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11467779
18	NC_000927	AG	7	21586	21599	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11467782
19	NC_000927	GAA	4	23254	23265	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11467783
20	NC_000927	AAT	4	25235	25247	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11467785
21	NC_000927	AATG	3	26157	26167	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_000927	AGT	4	26880	26890	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_000927	TTG	4	30304	30315	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_000927	CGAAT	3	30775	30788	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	11467788
25	NC_000927	CAA	4	33045	33056	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11467788
26	NC_000927	GGCA	3	33077	33088	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	11467788
27	NC_000927	AAGA	3	34728	34738	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11467789
28	NC_000927	GAA	4	35574	35585	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11467789
29	NC_000927	ATG	4	36760	36771	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467789
30	NC_000927	GTGC	3	38167	38179	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	11467790
31	NC_000927	CAAG	3	39565	39575	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11467790
32	NC_000927	GAA	4	41078	41089	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11467790
33	NC_000927	CTTG	3	41488	41499	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	11467790
34	NC_000927	CAAG	3	41924	41934	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11467791
35	NC_000927	GTAA	3	43028	43039	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_000927	GAAA	3	43604	43615	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_000927	AAGA	3	44438	44448	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_000927	TCT	4	46813	46823	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	193735616
39	NC_000927	TTAC	3	47527	47537	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11467796
40	NC_000927	GAAA	3	50390	50402	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	11467800
41	NC_000927	TTGG	3	51311	51321	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	11467801
42	NC_000927	CT	6	54676	54686	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11467806
43	NC_000927	GATA	3	60765	60776	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_000927	CGGAT	3	62854	62868	15	20 %	20 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
45	NC_000927	TTCAA	3	65342	65355	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	11467821
46	NC_000927	TCGA	3	66645	66656	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	11467824
47	NC_000927	AAG	4	69063	69074	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11467825
48	NC_000927	GAA	4	69317	69327	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11467825
49	NC_000927	CAAG	3	70828	70840	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	11467826
50	NC_000927	CAGA	3	70913	70923	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11467826
51	NC_000927	TACC	3	73955	73966	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11467826
52	NC_000927	AAG	4	74135	74146	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11467826
53	NC_000927	AGA	5	74676	74689	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11467826
54	NC_000927	CTTT	3	74973	74983	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11467826
55	NC_000927	TGA	4	75360	75371	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467826
56	NC_000927	AGA	4	75381	75392	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11467826
57	NC_000927	CT	6	77307	77317	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11467826
58	NC_000927	TG	6	78064	78075	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	11467826
59	NC_000927	CAG	4	79792	79802	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11467826
60	NC_000927	TACG	3	83246	83256	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11467830
61	NC_000927	ACA	4	85945	85956	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11467832
62	NC_000927	AGC	4	87024	87035	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467832
63	NC_000927	AATT	3	91572	91583	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_000927	ATTT	3	91919	91929	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_000927	TTAA	4	92033	92047	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_000927	ATAG	4	95138	95152	15	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_000927	AT	6	96857	96868	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467837
68	NC_000927	GCAA	3	97282	97293	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
69	NC_000927	ACC	4	98909	98920	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
70	NC_000927	ATTC	3	98956	98966	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_000927	TCAT	3	101785	101795	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
72	NC_000927	GATT	3	101886	101897	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000927	TTGA	3	101927	101938	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_000927	GTGG	3	106459	106469	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	11467845
75	NC_000927	TAA	4	106621	106632	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_000927	TC	6	107594	107604	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11467847
77	NC_000927	TGA	4	109095	109105	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_000927	TG	6	109268	109279	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_000927	AAAC	3	109491	109502	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_000927	ACCA	3	110301	110312	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	11467851
81	NC_000927	AAG	4	110566	110577	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_000927	AATC	3	110784	110795	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_000927	ATC	4	111447	111457	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
84	NC_000927	TG	6	112528	112538	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_000927	ATT	4	112849	112860	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_000927	AATA	3	114152	114163	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_000927	TGT	4	116692	116703	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467856
88	NC_000927	TAAA	3	118439	118450	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_000927	GAG	4	119633	119644	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_000927	AGCG	3	121638	121648	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_000927	ATC	4	125198	125209	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11467859
92	NC_000927	ACAT	3	127842	127852	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11467861
93	NC_000927	ACC	4	127938	127948	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	11467861
94	NC_000927	ATTTGG	3	129188	129206	19	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	10 %	11467862
95	NC_000927	ATTT	3	135364	135374	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_000927	AAT	4	138343	138353	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_000927	CTT	4	139341	139353	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11467867
98	NC_000927	ACGC	3	142950	142960	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
99	NC_000927	ATT	4	145456	145466	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467870
100	NC_000927	TCT	4	147298	147310	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
101	NC_000927	TAT	4	147562	147572	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467873
102	NC_000927	TAG	4	151260	151271	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467878
103	NC_000927	GAG	4	152034	152045	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	11467878
104	NC_000927	GAA	4	152783	152793	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11467878
105	NC_000927	GAAA	4	153844	153859	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_000927	AAAT	3	157552	157562	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_000927	ATTT	3	157854	157864	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_000927	GAA	4	163494	163504	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11467882
109	NC_000927	CCAAAT	3	163720	163738	19	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	10 %	11467883
110	NC_000927	CCAT	3	163779	163791	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	11467883
111	NC_000927	ATGT	3	165074	165084	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11467884
112	NC_000927	ACGC	3	167060	167070	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	11467885
113	NC_000927	ATG	4	167718	167729	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467886
114	NC_000927	TCGGT	3	170749	170762	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
115	NC_000927	CTC	4	173285	173295	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
116	NC_000927	GTTT	3	174475	174486	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_000927	ACA	4	176226	176236	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	11467889
118	NC_000927	AATT	3	178758	178770	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_000927	TAA	4	180065	180076	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_000927	CA	6	180388	180398	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
121	NC_000927	GAT	4	181469	181479	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_000927	GATT	3	182131	182142	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_000927	CTT	4	182349	182360	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
124	NC_000927	TGGT	3	182614	182625	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	11467894
125	NC_000927	GTTT	3	183424	183435	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_000927	AC	6	183646	183657	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
127	NC_000927	TCA	4	183821	183831	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
128	NC_000927	ATT	4	186293	186304	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_000927	AACGA	3	186326	186339	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	11467900
130	NC_000927	GAA	4	187236	187247	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_000927	ATCA	3	191030	191041	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000927	CAAC	3	193922	193934	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
133	NC_000927	GAAT	3	193960	193970	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_000927	ATTG	3	195632	195643	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_000927	AT	6	196058	196069	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467908
136	NC_000927	CTAT	4	197774	197788	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
137	NC_000927	ATGT	3	198862	198872	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11467909
138	NC_000927	ATT	4	200411	200422	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Nephroselmis olivacea chloroplast