ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Guillardia theta chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_000926	ATTG	3	1899	1911	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11467609
2	NC_000926	GGC	4	2733	2744	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	11467609
3	NC_000926	GAT	4	3129	3140	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467609
4	NC_000926	AAAT	3	4775	4786	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467610
5	NC_000926	TTGA	3	5070	5082	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11467610
6	NC_000926	TATAT	4	5509	5529	21	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_000926	CTG	4	6910	6921	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467613
8	NC_000926	TTTAAT	3	8432	8450	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
9	NC_000926	ATT	4	8795	8805	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467616
10	NC_000926	AACA	3	9070	9081	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11467616
11	NC_000926	ATT	4	10079	10089	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_000926	TAAA	3	10132	10143	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_000926	AAC	5	10409	10423	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	11467618
14	NC_000926	TCAT	3	12301	12311	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11467620
15	NC_000926	TAA	4	13034	13044	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467623
16	NC_000926	GCT	4	13700	13711	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	126165886
17	NC_000926	TAA	4	14529	14541	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	126165886
18	NC_000926	ATA	4	15787	15798	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467626
19	NC_000926	TCA	4	16900	16911	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11467627
20	NC_000926	AGCG	3	19196	19206	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_000926	TTAA	3	22115	22126	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467628
22	NC_000926	TAAT	4	22347	22363	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11467628
23	NC_000926	TAA	4	22933	22944	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467630
24	NC_000926	TAA	4	23518	23530	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11467631
25	NC_000926	ATTG	3	23742	23752	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11467631
26	NC_000926	AAC	4	24388	24399	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000926	TTTA	3	25579	25590	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467635
28	NC_000926	TAA	4	27386	27396	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467636
29	NC_000926	ATA	4	27414	27425	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_000926	TTAA	3	27848	27859	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467637
31	NC_000926	ATT	4	27951	27961	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467637
32	NC_000926	TGAAAA	3	28156	28173	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_000926	TTTA	3	29087	29098	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467638
34	NC_000926	TA	6	30005	30015	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467640
35	NC_000926	TCA	4	30563	30574	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11467640
36	NC_000926	ATA	4	30592	30603	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467640
37	NC_000926	TAA	4	31731	31741	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467640
38	NC_000926	TTTA	3	31946	31957	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467640
39	NC_000926	GTTCT	3	32514	32527	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	11467640
40	NC_000926	TA	7	32928	32940	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_000926	AATTT	4	33644	33663	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	11467644
42	NC_000926	CAAT	3	35431	35441	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11467646
43	NC_000926	TTA	4	35457	35468	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467646
44	NC_000926	TCT	4	36029	36039	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11467647
45	NC_000926	TTAT	3	36934	36945	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_000926	AAAC	3	43396	43407	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11467650
47	NC_000926	TTAACA	3	43953	43970	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
48	NC_000926	AT	8	44215	44229	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_000926	AAATAA	3	44248	44265	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_000926	ACA	4	44365	44376	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11467651
51	NC_000926	TTAA	4	45908	45923	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11467652
52	NC_000926	TA	6	46100	46111	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_000926	ATAA	4	46127	46142	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_000926	TGC	7	46986	47006	21	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11467653
55	NC_000926	TAA	4	47818	47828	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_000926	TTAT	5	48302	48320	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
57	NC_000926	AAT	4	48335	48346	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_000926	TAAA	3	49235	49245	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467655
59	NC_000926	GTT	4	49817	49827	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11467656
60	NC_000926	TACA	3	50515	50525	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11467657
61	NC_000926	T	14	50540	50553	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_000926	ATA	4	51932	51943	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467658
63	NC_000926	TAA	4	52620	52630	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_000926	ATAA	3	52700	52712	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_000926	CAA	4	52793	52803	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	11467660
66	NC_000926	AATC	3	53090	53101	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_000926	T	19	53892	53910	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_000926	AAAG	3	53937	53947	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_000926	ATA	4	54249	54259	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467663
70	NC_000926	ATAA	3	54401	54412	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467663
71	NC_000926	A	12	55072	55083	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	11467664
72	NC_000926	AATT	4	55213	55229	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11467664
73	NC_000926	AT	6	55329	55339	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467665
74	NC_000926	ATAA	3	56107	56118	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467668
75	NC_000926	AT	6	56192	56202	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467668
76	NC_000926	ATTG	3	56416	56428	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11467670
77	NC_000926	TTTCT	3	57537	57550	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	11467672
78	NC_000926	ATA	4	58114	58125	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_000926	CTT	4	58207	58217	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11467674
80	NC_000926	TTTTAT	3	59830	59847	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	0 %	11467677
81	NC_000926	AAT	4	60079	60090	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467677
82	NC_000926	AGTT	3	61353	61364	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	11467678
83	NC_000926	AATA	3	62920	62931	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467679
84	NC_000926	ACC	4	63968	63979	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11467680
85	NC_000926	AAC	4	64682	64693	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11467680
86	NC_000926	TAAT	3	66282	66292	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467683
87	NC_000926	AATC	3	66504	66515	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11467683
88	NC_000926	TA	6	66550	66560	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467683
89	NC_000926	TTTC	3	68997	69007	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11467687
90	NC_000926	ATT	4	70158	70169	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467688
91	NC_000926	ATTT	3	71104	71115	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467688
92	NC_000926	GTT	4	71470	71480	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11467688
93	NC_000926	ATT	4	72133	72144	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467688
94	NC_000926	AAT	4	72609	72619	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467688
95	NC_000926	TACT	3	72901	72912	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11467688
96	NC_000926	ATT	4	73272	73284	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11467689
97	NC_000926	TTC	4	73439	73451	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11467689
98	NC_000926	TCA	5	73452	73469	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	11467689
99	NC_000926	TTTA	3	73953	73965	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11467689
100	NC_000926	TAA	4	78126	78136	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11467690
101	NC_000926	TAA	4	78524	78535	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_000926	ATT	4	78749	78760	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467691
103	NC_000926	TAAA	3	79190	79201	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11467692
104	NC_000926	TTAT	3	80159	80170	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11467694
105	NC_000926	TTTG	3	81581	81592	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11467694
106	NC_000926	GTC	4	81658	81668	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11467694
107	NC_000926	TA	7	82067	82079	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11467695
108	NC_000926	TAT	4	84462	84472	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11467698
109	NC_000926	CTAGTT	3	85195	85211	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	11467698
110	NC_000926	TTTCTT	3	86850	86867	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	11467701
111	NC_000926	AATT	3	87982	87994	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_000926	TATT	3	88456	88466	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467705
113	NC_000926	TA	6	88772	88783	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467706
114	NC_000926	CTAT	3	89019	89029	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
115	NC_000926	AAAT	3	90949	90961	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11467710
116	NC_000926	TTA	4	91403	91414	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_000926	TAA	4	93228	93239	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467712
118	NC_000926	AGC	4	94717	94728	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467713
119	NC_000926	ACT	4	97705	97716	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11467716
120	NC_000926	T	15	98840	98854	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
121	NC_000926	TAA	4	99938	99949	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467718
122	NC_000926	AAGT	3	100385	100395	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11467719
123	NC_000926	AAATT	3	100518	100531	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	11467719
124	NC_000926	TGG	4	101235	101246	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	11467720
125	NC_000926	AATA	3	102767	102778	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_000926	TAATTC	3	104157	104175	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	11467728
127	NC_000926	ATAA	3	104198	104208	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467728
128	NC_000926	TTAATT	3	104938	104955	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11467729
129	NC_000926	TAT	4	105791	105802	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467731
130	NC_000926	TAT	4	106428	106439	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11467733
131	NC_000926	AAGT	3	108182	108192	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11467735
132	NC_000926	GAAT	3	108594	108605	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11467736
133	NC_000926	ACGT	3	109321	109331	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11467738
134	NC_000926	AT	7	110820	110832	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11467740
135	NC_000926	TA	6	111042	111052	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11467741
136	NC_000926	TGA	4	112703	112714	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467744
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141	NC_000926	ATATA	3	114291	114305	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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146	NC_000926	AAAT	3	118137	118147	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467752
147	NC_000926	TATT	3	119777	119789	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
148	NC_000926	TAA	4	121226	121237	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467754

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Guillardia theta chloroplast