ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Porphyra purpurea chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_000925	GAA	4	1021	1032	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11465653
2	NC_000925	CTA	4	1783	1793	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11465654
3	NC_000925	ATGA	3	2124	2136	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	11465654
4	NC_000925	CAA	4	2837	2848	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11465655
5	NC_000925	TCT	4	3853	3863	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11465655
6	NC_000925	TCT	4	4077	4087	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11465656
7	NC_000925	ATA	4	5304	5314	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11465658
8	NC_000925	TCTT	3	5334	5346	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	11465658
9	NC_000925	TA	6	5568	5578	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_000925	TAT	4	5726	5736	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_000925	TGA	4	6689	6700	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11465661
12	NC_000925	AATT	3	6741	6752	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11465661
13	NC_000925	AAGC	3	6817	6828	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	11465661
14	NC_000925	CTT	4	7609	7620	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11465662
15	NC_000925	AATT	3	8038	8049	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11465662
16	NC_000925	GTT	4	8388	8398	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11465662
17	NC_000925	TA	7	8606	8619	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_000925	TATT	3	8639	8649	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_000925	TAAA	3	8707	8717	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_000925	AGG	4	9621	9633	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	11465664
21	NC_000925	CTAGA	3	10057	10070	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
22	NC_000925	AGTA	3	10844	10856	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_000925	TAT	4	11327	11337	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_000925	CTCAA	3	12035	12050	16	40 %	20 %	0 %	40 %	6 %	11465667
25	NC_000925	ATTT	3	12950	12961	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11465668
26	NC_000925	TTAA	3	13737	13749	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11465669
27	NC_000925	TAAT	3	16217	16229	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_000925	ATA	4	16506	16516	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11465674
29	NC_000925	GTA	4	17748	17759	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11465676
30	NC_000925	ATA	4	18765	18776	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11465677
31	NC_000925	AGA	4	19271	19282	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11465677
32	NC_000925	CTG	7	20434	20454	21	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	4 %	11465678
33	NC_000925	ATTT	3	21052	21063	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_000925	AT	6	21136	21146	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_000925	AAAT	3	21962	21972	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11465680
36	NC_000925	ATA	4	24681	24692	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11465684
37	NC_000925	AT	6	27425	27435	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11465687
38	NC_000925	TAT	7	27455	27475	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_000925	CTG	5	30148	30162	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	11465692
40	NC_000925	CTAA	3	32438	32448	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11465694
41	NC_000925	CTA	4	32616	32627	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_000925	AAT	4	35377	35387	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11465699
43	NC_000925	ATT	4	36129	36140	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465700
44	NC_000925	TAA	4	37382	37393	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11465700
45	NC_000925	ATT	4	37637	37648	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465700
46	NC_000925	ATC	4	37773	37785	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	11465701
47	NC_000925	ATAA	3	38247	38258	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11465702
48	NC_000925	TTTA	3	38407	38417	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11465703
49	NC_000925	CAAT	3	38587	38598	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11465703
50	NC_000925	AT	6	38717	38728	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11465703
51	NC_000925	AGA	4	39400	39411	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11465704
52	NC_000925	CTT	4	46075	46086	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11465711
53	NC_000925	TAAT	3	47833	47844	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_000925	TTAT	3	47905	47915	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11465714
55	NC_000925	TTCT	3	48186	48196	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11465714
56	NC_000925	TCAA	3	48441	48452	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11465714
57	NC_000925	TCT	4	48977	48988	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11465715
58	NC_000925	TAT	5	49405	49419	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_000925	TCTA	3	49514	49524	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11465716
60	NC_000925	TAC	4	51553	51564	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11465716
61	NC_000925	TCT	4	57023	57034	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11465718
62	NC_000925	ATTT	3	58207	58217	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11465718
63	NC_000925	TTTA	3	58543	58553	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11465718
64	NC_000925	TGCC	3	58802	58813	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
65	NC_000925	TAT	4	58840	58852	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_000925	AT	6	60222	60232	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_000925	ATA	4	61765	61776	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11465723
68	NC_000925	CTT	4	62055	62066	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11465723
69	NC_000925	ATC	5	62448	62465	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	11465723
70	NC_000925	ATCT	3	62991	63002	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
71	NC_000925	TAT	4	63006	63017	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_000925	ATA	4	63660	63671	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_000925	AGC	4	66090	66101	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11465727
74	NC_000925	GAAA	3	66688	66699	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11465728
75	NC_000925	AATGCT	3	68582	68599	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	11465729
76	NC_000925	TTCT	3	68890	68901	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11465729
77	NC_000925	TGC	4	69521	69531	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11465729
78	NC_000925	ATT	4	69611	69621	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11465729
79	NC_000925	ATT	4	70671	70682	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465730
80	NC_000925	TAAAA	3	71670	71683	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11465731
81	NC_000925	TGTA	3	72064	72074	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11465732
82	NC_000925	CTT	4	73293	73304	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11465733
83	NC_000925	AACT	3	74059	74069	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11465733
84	NC_000925	TA	7	74159	74171	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_000925	CAT	4	74457	74468	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11465734
86	NC_000925	TGC	4	74986	74998	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	11465734
87	NC_000925	TAT	4	75824	75835	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_000925	ATA	4	76637	76648	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11465737
89	NC_000925	ATAA	3	79134	79145	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_000925	AT	6	79201	79211	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_000925	CTA	4	81770	81780	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11465744
92	NC_000925	TA	6	82143	82153	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_000925	TA	6	82158	82168	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_000925	TAA	4	83308	83318	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11465747
95	NC_000925	TTTA	3	83764	83774	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11465747
96	NC_000925	AAT	4	84244	84255	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11465747
97	NC_000925	TAAA	3	85230	85241	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	11465748
98	NC_000925	TAT	4	88697	88707	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11465751
99	NC_000925	CT	6	89772	89782	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11465751
100	NC_000925	CTT	4	91123	91134	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11465753
101	NC_000925	ATAA	3	93835	93846	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_000925	GCCT	3	95550	95560	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	11465760
103	NC_000925	ATTT	3	95843	95854	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11465760
104	NC_000925	ATT	4	97125	97136	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465763
105	NC_000925	ATA	4	97305	97316	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11465763
106	NC_000925	TTC	4	97472	97483	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11465763
107	NC_000925	ACCAAC	3	98216	98233	18	50 %	0 %	0 %	50 %	5 %	11465764
108	NC_000925	TAGT	4	98402	98417	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_000925	ATTG	3	98591	98601	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11465765
110	NC_000925	TTA	4	99025	99037	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11465766
111	NC_000925	AATAT	3	99354	99368	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	11465767
112	NC_000925	TGTC	3	99397	99408	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	11465767
113	NC_000925	TTAA	3	100006	100018	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11465768
114	NC_000925	ATT	4	100400	100411	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465769
115	NC_000925	CTA	4	101274	101284	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11465771
116	NC_000925	TAT	4	102755	102766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465775
117	NC_000925	CGC	4	103555	103566	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11465777
118	NC_000925	TTTC	3	103755	103766	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11465777
119	NC_000925	TAT	4	104039	104049	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11465777
120	NC_000925	TAAA	3	108079	108089	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11465781
121	NC_000925	CTA	4	108457	108468	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11465782
122	NC_000925	TAT	4	108770	108782	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_000925	TCT	4	108903	108914	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11465783
124	NC_000925	AAAT	3	109015	109025	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_000925	TTCA	3	110304	110314	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
126	NC_000925	TCT	4	112148	112158	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11465788
127	NC_000925	ATA	4	113385	113396	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_000925	TTAA	3	113412	113422	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_000925	TTA	4	113557	113568	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465791
130	NC_000925	ATT	4	113817	113828	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465792
131	NC_000925	AG	6	114063	114073	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_000925	TAAA	3	114326	114337	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000925	AGA	4	115532	115543	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11465793
134	NC_000925	GA	6	116468	116478	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_000925	ATT	4	117293	117305	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11465794
136	NC_000925	TCA	4	118024	118034	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11465795
137	NC_000925	TAAA	6	118102	118123	22	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_000925	ATTT	3	118749	118760	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11465796
139	NC_000925	TCAA	3	118851	118861	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11465796
140	NC_000925	ATT	4	118869	118881	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11465796
141	NC_000925	TTA	4	119645	119656	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465796
142	NC_000925	TAT	5	120352	120365	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_000925	TAAA	3	120419	120429	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11465797
144	NC_000925	AGC	4	122068	122079	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11465798
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147	NC_000925	TCTT	3	125718	125729	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11465800
148	NC_000925	TC	6	126131	126142	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
149	NC_000925	AGTT	3	127317	127327	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
150	NC_000925	CTC	4	128046	128057	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	11465803
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152	NC_000925	TTCC	3	130275	130286	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11465807
153	NC_000925	CTTT	3	131098	131108	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11465808
154	NC_000925	ATA	4	131257	131268	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11465808
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158	NC_000925	TAT	4	135648	135660	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11465812
159	NC_000925	ACTA	3	136822	136833	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
160	NC_000925	TTA	4	137743	137754	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465814
161	NC_000925	TTAA	3	140738	140749	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11465815
162	NC_000925	GAAA	3	141025	141036	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11465815
163	NC_000925	TAAAA	3	141774	141788	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	11465816
164	NC_000925	ATT	5	143685	143698	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11465820
165	NC_000925	TTAA	3	143993	144004	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11465821
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167	NC_000925	AAAGA	3	145036	145050	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	126165877
168	NC_000925	TTTAC	3	146552	146566	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
169	NC_000925	AAT	4	146997	147008	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11465824
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171	NC_000925	ATTT	3	147481	147491	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
172	NC_000925	GATTAA	3	152655	152671	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	11465825
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174	NC_000925	TTGA	3	153244	153256	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11465826
175	NC_000925	AT	6	153549	153560	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11465826
176	NC_000925	TTA	4	153781	153791	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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188	NC_000925	TTCCTA	3	163699	163716	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	11465839
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191	NC_000925	TATT	3	165768	165778	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11465841
192	NC_000925	AATT	3	168508	168518	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11465841
193	NC_000925	AAAT	3	169497	169507	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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196	NC_000925	AAAG	3	169833	169843	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11465842
197	NC_000925	TA	7	170012	170025	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
198	NC_000925	TAGA	3	170453	170463	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11465843
199	NC_000925	TAAC	3	170849	170859	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11465844
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201	NC_000925	ATTA	3	172717	172727	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11465845
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209	NC_000925	ATTT	3	179512	179522	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
210	NC_000925	TAAT	3	180463	180473	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
211	NC_000925	TAA	4	181252	181264	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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214	NC_000925	ATAAA	4	183435	183454	20	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	11465859
215	NC_000925	AATTT	3	184211	184225	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
216	NC_000925	TAT	4	184304	184315	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
217	NC_000925	TA	6	184426	184436	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
218	NC_000925	ATA	4	185731	185741	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
219	NC_000925	TAT	4	185749	185759	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Porphyra purpurea chloroplast