ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cyanidioschyzon merolae mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_000887	TTA	4	9	19	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	8954360
2	NC_000887	ATT	4	1646	1656	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	8954362
3	NC_000887	TTA	4	1985	1995	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	8954362
4	NC_000887	TTG	4	5087	5098	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	8954365
5	NC_000887	ATT	4	5178	5188	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	8954366
6	NC_000887	ATT	4	5679	5691	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_000887	TTA	4	5719	5729	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	8954367
8	NC_000887	TAT	4	7453	7464	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	13375533
9	NC_000887	ATT	4	7902	7912	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	13375533
10	NC_000887	ATA	4	9092	9102	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	8954370
11	NC_000887	AAT	5	9357	9371	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	8954370
12	NC_000887	TAA	5	9457	9470	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	8954370
13	NC_000887	AAT	4	9887	9898	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8954370
14	NC_000887	AAT	4	10907	10918	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	8954371
15	NC_000887	ATA	5	13465	13479	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	8954373
16	NC_000887	ATC	4	13915	13926	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	8954373
17	NC_000887	ATA	4	14015	14026	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8954373
18	NC_000887	AAT	4	15855	15866	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8954375
19	NC_000887	ATT	4	16030	16041	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	8954375
20	NC_000887	TAA	4	16716	16727	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8954377
21	NC_000887	ATA	5	16951	16966	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	8954377
22	NC_000887	AAT	4	17274	17285	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8954377
23	NC_000887	ATT	4	17543	17553	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	8954377
24	NC_000887	ATA	6	17989	18006	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	8954377
25	NC_000887	TAT	7	19234	19254	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	8954378
26	NC_000887	ATT	4	19593	19603	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	8954379
27	NC_000887	AAT	4	20088	20099	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8954381
28	NC_000887	ATT	4	20919	20930	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	8954383
29	NC_000887	ATA	4	21270	21281	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8954383
30	NC_000887	ATA	4	22768	22779	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8954386
31	NC_000887	ATA	4	24180	24192	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	8954387
32	NC_000887	TAA	4	26468	26479	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8954391
33	NC_000887	TTA	4	27908	27918	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_000887	TAA	4	28250	28260	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_000887	TTA	4	28538	28549	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	8954392
36	NC_000887	GAT	4	32170	32181	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cyanidioschyzon merolae mitochondrion