ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Tetrahymena pyriformis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_000862	CAG	4	1463	1473	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_000862	ATA	4	2260	2271	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_000862	TTA	4	3734	3745	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466254
4	NC_000862	TAT	4	5580	5590	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466255
5	NC_000862	TAT	4	6965	6976	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466256
6	NC_000862	TAT	4	8553	8564	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466259
7	NC_000862	TTA	6	8804	8822	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	11466260
8	NC_000862	TAT	4	10138	10149	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466263
9	NC_000862	TAT	4	11432	11442	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466264
10	NC_000862	AAT	4	11585	11596	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466264
11	NC_000862	ATA	4	12140	12151	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466265
12	NC_000862	ATT	4	12395	12406	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466266
13	NC_000862	AAT	4	12700	12711	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466266
14	NC_000862	ATA	4	14704	14714	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466269
15	NC_000862	ATT	4	16461	16472	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466272
16	NC_000862	ATA	5	16675	16689	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11466272
17	NC_000862	TAA	4	16832	16843	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466272
18	NC_000862	ATT	4	17170	17181	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466273
19	NC_000862	TAT	4	18319	18330	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466276
20	NC_000862	TAT	5	18394	18408	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466276
21	NC_000862	TTG	4	18499	18511	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	11466276
22	NC_000862	ATT	4	19064	19075	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466276
23	NC_000862	ATT	4	19500	19512	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466276
24	NC_000862	ATA	5	21147	21161	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466279
25	NC_000862	TAT	4	25511	25523	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466282
26	NC_000862	TAA	4	25664	25676	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466282
27	NC_000862	ATT	4	26377	26388	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11466282
28	NC_000862	ATT	4	26436	26448	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466282
29	NC_000862	TAT	4	26729	26740	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_000862	AGA	5	27112	27125	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11466283
31	NC_000862	AAC	4	28779	28790	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11466284
32	NC_000862	TTA	4	28917	28927	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466284
33	NC_000862	TTA	4	30377	30388	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466284
34	NC_000862	TTA	4	30402	30412	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466284
35	NC_000862	TAA	4	31583	31594	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466285
36	NC_000862	TAA	4	31620	31631	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466285
37	NC_000862	ATC	4	32168	32178	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11466285
38	NC_000862	AAT	4	33022	33033	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_000862	ATT	4	33984	33994	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_000862	ATT	4	34295	34305	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466286
41	NC_000862	ATT	4	34499	34509	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466287
42	NC_000862	TAA	4	36599	36609	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466288
43	NC_000862	TAT	4	36982	36993	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11466288
44	NC_000862	TGA	4	37064	37075	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11466288
45	NC_000862	ATA	4	37263	37275	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466288
46	NC_000862	ATT	4	37475	37485	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466288
47	NC_000862	TTA	4	37690	37702	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466289
48	NC_000862	AAT	5	37745	37759	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466289
49	NC_000862	TGT	4	38228	38239	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11466290
50	NC_000862	TAT	4	39391	39402	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466290
51	NC_000862	TAT	4	39537	39548	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466290
52	NC_000862	GTA	4	40215	40225	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11466291
53	NC_000862	TAT	5	41158	41171	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466292
54	NC_000862	TAT	4	41242	41253	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466292
55	NC_000862	TAT	4	41418	41428	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466292
56	NC_000862	TTA	5	41433	41447	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466292
57	NC_000862	ATT	4	42916	42927	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466295
58	NC_000862	ATA	5	43992	44006	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466296
59	NC_000862	ATA	5	44398	44411	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466296
60	NC_000862	TAT	4	45051	45062	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_000862	TTA	7	47200	47220	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Tetrahymena pyriformis mitochondrion