ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Tetrahymena pyriformis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_000862	CAG	4	1463	1473	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_000862	CT	6	1677	1687	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_000862	ATTT	3	2076	2088	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_000862	ATA	4	2260	2271	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_000862	TAAAA	3	2948	2961	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_000862	AAAAT	3	3110	3125	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	11466253
7	NC_000862	T	14	3420	3433	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11466254
8	NC_000862	TTA	4	3734	3745	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466254
9	NC_000862	A	13	3990	4002	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466254
10	NC_000862	ATAA	3	4758	4769	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000862	ATTT	3	5046	5056	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466255
12	NC_000862	TTTA	3	5212	5222	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466255
13	NC_000862	T	22	5269	5290	22	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	11466255
14	NC_000862	TAAA	3	5377	5388	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466255
15	NC_000862	TAT	4	5580	5590	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466255
16	NC_000862	TGTTT	3	5690	5703	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	11466255
17	NC_000862	TAAT	3	5869	5880	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466255
18	NC_000862	T	13	6049	6061	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11466255
19	NC_000862	AAAT	3	6077	6088	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466255
20	NC_000862	TTTA	3	6089	6100	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466255
21	NC_000862	TTTTA	3	6232	6245	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11466255
22	NC_000862	T	16	6292	6307	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11466256
23	NC_000862	T	15	6329	6343	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11466256
24	NC_000862	T	16	6492	6507	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	11466256
25	NC_000862	TAT	4	6965	6976	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466256
26	NC_000862	TAAA	3	7428	7438	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466257
27	NC_000862	GATTTT	4	7587	7610	24	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	0 %	11466258
28	NC_000862	T	22	7775	7796	22	0 %	100 %	0 %	0 %	9 %	11466258
29	NC_000862	TTTTA	3	8143	8156	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11466259
30	NC_000862	TATTTA	3	8466	8483	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11466259
31	NC_000862	TAT	4	8553	8564	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466259
32	NC_000862	TAAA	3	8730	8740	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466260
33	NC_000862	TTA	6	8804	8822	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	11466260
34	NC_000862	TTGT	3	8999	9009	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11466260
35	NC_000862	T	12	9107	9118	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11466260
36	NC_000862	TAT	4	10138	10149	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466263
37	NC_000862	AT	6	10643	10653	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466263
38	NC_000862	GA	6	11105	11115	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11466264
39	NC_000862	TAT	4	11432	11442	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466264
40	NC_000862	AAT	4	11585	11596	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466264
41	NC_000862	ATA	4	12140	12151	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466265
42	NC_000862	TTTA	3	12373	12384	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	11466266
43	NC_000862	ATT	4	12395	12406	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466266
44	NC_000862	A	13	12586	12598	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466266
45	NC_000862	AAT	4	12700	12711	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466266
46	NC_000862	TTTTAA	3	12901	12919	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11466267
47	NC_000862	TAAA	3	13830	13841	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_000862	T	17	14178	14194	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	11466268
49	NC_000862	CATTT	3	14524	14538	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
50	NC_000862	ATA	4	14704	14714	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466269
51	NC_000862	ATTA	4	14726	14741	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	11466269
52	NC_000862	TAAC	3	15038	15048	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11466270
53	NC_000862	ATTTT	3	15836	15849	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11466271
54	NC_000862	TA	6	16008	16018	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466272
55	NC_000862	TAAA	3	16343	16354	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466272
56	NC_000862	ATT	4	16461	16472	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466272
57	NC_000862	ATA	5	16675	16689	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11466272
58	NC_000862	TAA	4	16832	16843	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466272
59	NC_000862	TTAT	3	16853	16864	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466272
60	NC_000862	TTGTT	3	16870	16883	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	11466272
61	NC_000862	AACT	3	16968	16978	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11466272
62	NC_000862	A	12	16989	17000	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11466272
63	NC_000862	ATT	4	17170	17181	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466273
64	NC_000862	TTTATA	3	17672	17690	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	11466274
65	NC_000862	T	12	17965	17976	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11466275
66	NC_000862	TATT	4	18165	18179	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_000862	TAT	4	18319	18330	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466276
68	NC_000862	TAT	5	18394	18408	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466276
69	NC_000862	TTG	4	18499	18511	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	11466276
70	NC_000862	AT	6	18585	18595	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466276
71	NC_000862	AT	6	18942	18955	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466276
72	NC_000862	ATT	4	19064	19075	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466276
73	NC_000862	AATT	3	19327	19338	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466276
74	NC_000862	TAAATT	3	19412	19429	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	11466276
75	NC_000862	ATT	4	19500	19512	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466276
76	NC_000862	TGTT	3	19624	19634	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11466276
77	NC_000862	AT	9	19648	19665	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11466276
78	NC_000862	TTATTT	3	20197	20214	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	11466277
79	NC_000862	TAAA	3	20626	20636	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466278
80	NC_000862	AATTT	3	20752	20766	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	11466278
81	NC_000862	TGTT	3	20811	20822	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11466278
82	NC_000862	AATA	3	20954	20964	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466279
83	NC_000862	TA	6	21081	21091	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466279
84	NC_000862	ATA	5	21147	21161	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466279
85	NC_000862	TA	6	21426	21436	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466280
86	NC_000862	T	13	21678	21690	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11466281
87	NC_000862	CTTCAT	3	22622	22639	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	11466282
88	NC_000862	TAAA	3	22835	22846	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466282
89	NC_000862	AAAATA	3	23354	23372	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	11466282
90	NC_000862	AAATAT	3	23630	23648	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11466282
91	NC_000862	TA	6	23873	23885	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466282
92	NC_000862	TAAA	3	24150	24160	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466282
93	NC_000862	TG	6	24615	24626	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	11466282
94	NC_000862	AT	7	24646	24660	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11466282
95	NC_000862	TATT	3	24731	24741	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466282
96	NC_000862	ATTT	3	24816	24827	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466282
97	NC_000862	TTAT	3	25174	25184	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466282
98	NC_000862	TATT	3	25345	25356	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	11466282
99	NC_000862	TTTTAT	3	25455	25472	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	11466282
100	NC_000862	TA	13	25485	25508	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466282
101	NC_000862	TAT	4	25511	25523	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466282
102	NC_000862	AT	9	25534	25550	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11466282
103	NC_000862	TA	11	25566	25588	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466282
104	NC_000862	TA	7	25593	25606	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466282
105	NC_000862	TA	9	25611	25628	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11466282
106	NC_000862	TAA	4	25664	25676	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466282
107	NC_000862	T	12	26113	26124	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11466282
108	NC_000862	AT	6	26240	26250	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466282
109	NC_000862	ATT	4	26377	26388	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11466282
110	NC_000862	ATT	4	26436	26448	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466282
111	NC_000862	AATA	3	26691	26702	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_000862	TAT	4	26729	26740	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_000862	TTAA	3	26756	26768	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_000862	AGA	5	27112	27125	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11466283
115	NC_000862	ATTT	3	27820	27830	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466283
116	NC_000862	TTTTA	3	27831	27845	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11466283
117	NC_000862	TTTA	6	28087	28110	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466283
118	NC_000862	TTAAT	3	28402	28416	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	11466284
119	NC_000862	TA	6	28560	28570	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466284
120	NC_000862	TA	6	28615	28626	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466284
121	NC_000862	AAC	4	28779	28790	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11466284
122	NC_000862	TTA	4	28917	28927	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466284
123	NC_000862	TA	6	29039	29050	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466284
124	NC_000862	AT	6	29353	29364	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466284
125	NC_000862	T	13	29421	29433	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11466284
126	NC_000862	TTTA	3	29961	29971	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466284
127	NC_000862	TA	6	29992	30004	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466284
128	NC_000862	TTA	4	30377	30388	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466284
129	NC_000862	TTA	4	30402	30412	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466284
130	NC_000862	AAAC	3	31426	31437	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11466285
131	NC_000862	TAA	4	31583	31594	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466285
132	NC_000862	TAA	4	31620	31631	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466285
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183	NC_000862	AG	6	45635	45645	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Tetrahymena pyriformis mitochondrion