ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ceratitis capitata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_000857	AT	6	172	182	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_000857	ATT	4	746	757	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835877
3	NC_000857	AATT	3	963	974	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	5835877
4	NC_000857	AATT	3	1222	1232	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	5835877
5	NC_000857	ATT	4	1850	1861	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835878
6	NC_000857	AGT	4	1863	1873	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	5835878
7	NC_000857	GGA	4	2190	2200	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	5835878
8	NC_000857	TTAA	3	3051	3062	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	5835878
9	NC_000857	ATT	4	3787	3797	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	5835879
10	NC_000857	TTAAT	3	4366	4380	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	5835881
11	NC_000857	TCT	4	4638	4650	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	5835881
12	NC_000857	TTCT	3	4928	4939	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	5835882
13	NC_000857	TAT	4	5213	5223	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	5835882
14	NC_000857	TTTA	3	5294	5304	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	5835882
15	NC_000857	CTT	4	5443	5453	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	5835882
16	NC_000857	TAG	4	5652	5662	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_000857	TAT	4	5953	5964	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835883
18	NC_000857	TTA	4	7322	7333	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42415670
19	NC_000857	AAC	4	7432	7443	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	42415670
20	NC_000857	TGAA	3	7515	7525	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	42415670
21	NC_000857	AAG	4	7571	7582	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42415670
22	NC_000857	TAA	4	7865	7877	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42415670
23	NC_000857	TAAATT	3	8249	8266	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	5835885
24	NC_000857	AAAT	3	8292	8303	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	5835885
25	NC_000857	TAAA	3	8358	8369	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	5835885
26	NC_000857	AAAAG	3	8434	8447	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	5835885
27	NC_000857	AATT	3	8836	8848	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	5835885
28	NC_000857	AAAT	3	9166	9176	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	5835885
29	NC_000857	AAAAT	3	9255	9268	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	5835885
30	NC_000857	AAAT	3	9514	9524	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	5835885
31	NC_000857	A	12	9757	9768	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	5835886
32	NC_000857	TTAA	3	10311	10321	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	5835887
33	NC_000857	AATT	3	10484	10496	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	5835887
34	NC_000857	TAT	5	11248	11262	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	5835888
35	NC_000857	TAA	4	11779	11791	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	170675698
36	NC_000857	TAAA	3	11945	11957	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	170675698
37	NC_000857	ATA	4	12191	12202	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	170675698
38	NC_000857	TAAAA	3	12377	12390	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	170675698
39	NC_000857	TTAA	3	14068	14080	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_000857	A	14	14088	14101	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_000857	AAATAA	4	14978	15001	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_000857	T	15	15185	15199	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_000857	TAT	4	15262	15273	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_000857	ATT	4	15289	15299	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_000857	TAAA	3	15300	15310	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_000857	TA	6	15355	15366	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_000857	T	28	15375	15402	28	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_000857	TATAA	4	15440	15459	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
49	NC_000857	TA	6	15493	15503	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_000857	TA	8	15572	15587	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_000857	TAAT	4	15586	15601	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_000857	ATTTTT	4	15869	15892	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000857	A	27	15912	15938	27	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ceratitis capitata mitochondrion