ChloroMitoSSRDB 2.0 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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Chloroplast Motifs - Imperfect TTAAT Repeats

S.NoSequence IDMotifIterationsStartEndTract LengthSequence Name
1NC_014697TTAAT59710973425Prunus persica chloroplast
2NC_002652TTAAT5103771039923 Euglena longa plastid
3NC_014675TTAAT4919869200621Isoetes flaccida chloroplast
4NC_015204TTAAT4546055462319Gossypium thurberi chloroplast
5NC_016670TTAAT4547325475019Gossypium darwinii chloroplast
6NC_016690TTAAT4547545477219Gossypium tomentosum chloroplast
7NC_016692TTAAT4546295464719Gossypium herbaceum subsp. africanum chloroplast
8NC_016711TTAAT4546595467719Gossypium mustelinum chloroplast
9NC_016712TTAAT4545655458319Gossypium arboreum chloroplast
10NC_016733TTAAT4665026652120Pedinomonas minor chloroplast
11NC_018109TTAAT4538705388819Gossypium incanum chloroplast
12NC_018110TTAAT4540475406519Gossypium somalense chloroplast
13NC_018111TTAAT4539745399219Gossypium capitis-viridis chloroplast
14NC_018112TTAAT4540715408919Gossypium areysianum chloroplast
15NC_018113TTAAT4542515426919Gossypium robinsonii chloroplast
16NC_020364TTAAT4466434666220Pseudophoenix vinifera plastid
17NC_005086TTAAT4157281574720 Amborella trichopoda chloroplast
18NC_007944TTAAT4546385465619 Gossypium hirsutum chloroplast
19NC_008116TTAAT414254414256320 Staurastrum punctulatum chloroplast
20NC_008359TTAAT4837338375119 Morus indica chloroplast
21NC_008641TTAAT4546975471519 Gossypium barbadense chloroplast
22NC_011600TTAAT4402664028419 Vaucheria litorea chloroplast
23NC_012224TTAAT4357803579819 Jatropha curcas chloroplast
24NC_014674TTAAT35447546115Castanea mollissima chloroplast
25NC_015645TTAAT315976815978114Schizomeris leibleinii chloroplast
26NC_016703TTAAT3696476966115Phaeocystis antarctica strain CCMP1374 plastid
27NC_016732TTAAT317047417048815Dunaliella salina chloroplast
28NC_020152TTAAT35444545815Quercus rubra plastid
29NC_021189TTAAT312015812017215Pyropia haitanensis voucher PH-38 chloroplast
30NC_021449TTAAT311028711030115Utricularia gibba chloroplast
31NC_021618TTAAT32030204314Grateloupia taiwanensis plastid
32NC_001568TTAAT3604796049214 Epifagus virginiana chloroplast
33NC_001840TTAAT3971619717616 Cyanidium caldarium chloroplast
34NC_005087TTAAT310861310862614 Physcomitrella patens subsp. patens chloroplast
35NC_006137TTAAT316361216362615 Gracilaria tenuistipitata var. liui chloroplast
36NC_009272TTAAT3353633537715 Draba nemorosa chloroplast
37NC_009601TTAAT3263382635114 Dioscorea elephantipes chloroplast
38NC_011032TTAAT35853586614 Brachypodium distachyon chloroplast
39NC_011600TTAAT3496604967314 Vaucheria litorea chloroplast
40NC_012224TTAAT3646776469115 Jatropha curcas chloroplast