ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Chloroplast Motifs - Perfect ATT Repeats

S.No	Sequence ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	Sequence Name
1	NC_012224	ATT	10	4616	4645	30	Jatropha curcas chloroplast
2	NC_015645	ATT	6	55896	55913	18	Schizomeris leibleinii chloroplast
3	NC_008334	ATT	6	1743	1760	18	Citrus sinensis chloroplast
4	NC_020364	ATT	5	128350	128364	15	Pseudophoenix vinifera plastid
5	NC_021433	ATT	5	44494	44508	15	Cymbidium mannii voucher KUN:YJB100602 chloroplast
6	NC_021437	ATT	5	128491	128505	15	Cunninghamia lanceolata chloroplast
7	NC_001603	ATT	5	68902	68916	15	Euglena gracilis chloroplast
8	NC_002186	ATT	5	96845	96859	15	Mesostigma viride chloroplast
9	NC_004543	ATT	5	15962	15976	15	Anthoceros formosae chloroplast
10	NC_006137	ATT	5	99538	99552	15	Gracilaria tenuistipitata var. liui chloroplast
11	NC_007942	ATT	5	28630	28644	15	Glycine max chloroplast
12	NC_008372	ATT	5	34849	34863	15	Stigeoclonium helveticum chloroplast
13	NC_009265	ATT	5	79822	79836	15	Aethionema cordifolium chloroplast
14	NC_009267	ATT	5	50293	50307	15	Olimarabidopsis pumila chloroplast
15	NC_011031	ATT	5	145198	145212	15	Oedogonium cardiacum chloroplast
16	NC_011600	ATT	5	68840	68854	15	Vaucheria litorea chloroplast
17	NC_011600	ATT	5	100873	100887	15	Vaucheria litorea chloroplast
18	NC_012052	ATT	5	104255	104269	15	Syntrichia ruralis chloroplast
19	NC_014062	ATT	5	65238	65252	15	Anomochloa marantoidea chloroplast
20	NC_011087	ATT	4	332756	332767	12	Paulinella chromatophora chromatophore
21	NC_011087	ATT	4	919459	919470	12	Paulinella chromatophora chromatophore
22	NC_011087	ATT	4	929709	929720	12	Paulinella chromatophora chromatophore
23	NC_014570	ATT	4	119332	119343	12	Eucalyptus grandis chloroplast
24	NC_014674	ATT	4	134706	134717	12	Castanea mollissima chloroplast
25	NC_014676	ATT	4	38291	38302	12	Theobroma cacao chloroplast
26	NC_014676	ATT	4	63186	63197	12	Theobroma cacao chloroplast
27	NC_014808	ATT	4	122998	123009	12	Thalassiosira oceanica CCMP1005 chloroplast
28	NC_015083	ATT	4	113059	113070	12	Erodium carvifolium chloroplast
29	NC_015113	ATT	4	113486	113497	12	Anthriscus cerefolium chloroplast
30	NC_015139	ATT	4	45759	45770	12	Brassica rapa subsp. pekinensis chloroplast
31	NC_015308	ATT	4	10907	10918	12	Hevea brasiliensis chloroplast
32	NC_015308	ATT	4	76867	76878	12	Hevea brasiliensis chloroplast
33	NC_015402	ATT	4	63777	63788	12	Ptilidium pulcherrimum chloroplast
34	NC_015543	ATT	4	45561	45572	12	Jacobaea vulgaris chloroplast
35	NC_015605	ATT	4	36521	36532	12	Nelumbo lutea chloroplast
36	NC_015610	ATT	4	36489	36500	12	Nelumbo nucifera chloroplast
37	NC_015645	ATT	4	103407	103418	12	Schizomeris leibleinii chloroplast
38	NC_015831	ATT	4	53021	53032	12	Ferrocalamus rimosivaginus plastid
39	NC_015891	ATT	4	123916	123927	12	Spirodela polyrhiza chloroplast
40	NC_016471	ATT	4	12353	12364	12	Neottia nidus-avis plastid
41	NC_016708	ATT	4	75326	75337	12	Millettia pinnata chloroplast
42	NC_016708	ATT	4	112422	112433	12	Millettia pinnata chloroplast
43	NC_016727	ATT	4	7924	7935	12	Silene vulgaris chloroplast
44	NC_016727	ATT	4	29241	29252	12	Silene vulgaris chloroplast
45	NC_016727	ATT	4	44784	44795	12	Silene vulgaris chloroplast
46	NC_016727	ATT	4	44799	44810	12	Silene vulgaris chloroplast
47	NC_016728	ATT	4	59407	59418	12	Silene noctiflora chloroplast
48	NC_016732	ATT	4	38630	38641	12	Dunaliella salina chloroplast
49	NC_016732	ATT	4	266361	266372	12	Dunaliella salina chloroplast
50	NC_016734	ATT	4	45702	45713	12	Brassica napus chloroplast
51	NC_016734	ATT	4	81107	81118	12	Brassica napus chloroplast
52	NC_016735	ATT	4	22703	22714	12	Fucus vesiculosus chloroplast
53	NC_016735	ATT	4	51115	51126	12	Fucus vesiculosus chloroplast
54	NC_016735	ATT	4	99616	99627	12	Fucus vesiculosus chloroplast
55	NC_016735	ATT	4	107062	107073	12	Fucus vesiculosus chloroplast
56	NC_017754	ATT	4	30648	30659	12	Eutreptiella gymnastica plastid
57	NC_017928	ATT	4	4186	4197	12	Plasmodium falciparum HB3 apicoplast
58	NC_017928	ATT	4	14516	14527	12	Plasmodium falciparum HB3 apicoplast
59	NC_017928	ATT	4	15686	15697	12	Plasmodium falciparum HB3 apicoplast
60	NC_017928	ATT	4	17700	17711	12	Plasmodium falciparum HB3 apicoplast
61	NC_018523	ATT	4	17425	17436	12	Saccharina japonica chloroplast
62	NC_018523	ATT	4	127116	127127	12	Saccharina japonica chloroplast
63	NC_018541	ATT	4	52993	53004	12	Elodea canadensis chloroplast
64	NC_018541	ATT	4	116480	116491	12	Elodea canadensis chloroplast
65	NC_020092	ATT	4	60815	60826	12	Chrysanthemum x morifolium chloroplast
66	NC_020098	ATT	4	81855	81866	12	Tectona grandis chloroplast
67	NC_020152	ATT	4	135019	135030	12	Quercus rubra plastid
68	NC_020320	ATT	4	60840	60851	12	Chrysanthemum indicum voucher HeN001 chloroplast
69	NC_020362	ATT	4	23754	23765	12	Heliconia collinsiana plastid
70	NC_020362	ATT	4	56546	56557	12	Heliconia collinsiana plastid
71	NC_020438	ATT	4	128778	128789	12	Gonium pectorale chloroplast
72	NC_020607	ATT	4	60812	60823	12	Artemisia frigida chloroplast
73	NC_020795	ATT	4	15634	15645	12	Chondrus crispus plastid complete genome
74	NC_020795	ATT	4	74006	74017	12	Chondrus crispus plastid complete genome
75	NC_021189	ATT	4	121705	121716	12	Pyropia haitanensis voucher PH-38 chloroplast
76	NC_021429	ATT	4	44611	44622	12	Cymbidium aloifolium voucher KUN:YJB100604 chloroplast
77	NC_021430	ATT	4	44660	44671	12	Cymbidium sinense voucher KUN:YJB100605 chloroplast
78	NC_021431	ATT	4	44758	44769	12	Cymbidium tortisepalum voucher KUN:HJL091027 chloroplast
79	NC_021432	ATT	4	44188	44199	12	Cymbidium tracyanum voucher KUN:YJB100606 chloroplast
80	NC_021455	ATT	4	66286	66297	12	Prinsepia utilis plastid
81	NC_022099	ATT	4	80543	80554	12	Medicago truncatula cultivar Jemalong 2HA plastid
82	NC_022100	ATT	4	80343	80354	12	Medicago truncatula cultivar Borung plastid
83	NC_000925	ATT	4	143685	143696	12	Porphyra purpurea chloroplast
84	NC_001603	ATT	4	15637	15648	12	Euglena gracilis chloroplast
85	NC_001603	ATT	4	30611	30622	12	Euglena gracilis chloroplast
86	NC_001603	ATT	4	43770	43781	12	Euglena gracilis chloroplast
87	NC_001603	ATT	4	81846	81857	12	Euglena gracilis chloroplast
88	NC_001675	ATT	4	86628	86639	12	Cyanophora paradoxa cyanelle
89	NC_001675	ATT	4	87514	87525	12	Cyanophora paradoxa cyanelle
90	NC_001675	ATT	4	102524	102535	12	Cyanophora paradoxa cyanelle
91	NC_001675	ATT	4	121777	121788	12	Cyanophora paradoxa cyanelle
92	NC_001713	ATT	4	36055	36066	12	Odontella sinensis chloroplast
93	NC_002186	ATT	4	104401	104412	12	Mesostigma viride chloroplast
94	NC_002652	ATT	4	17860	17871	12	Euglena longa plastid
95	NC_003119	ATT	4	80543	80554	12	Medicago truncatula chloroplast
96	NC_004543	ATT	4	83738	83749	12	Anthoceros formosae chloroplast
97	NC_004823	ATT	4	23961	23972	12	Eimeria tenella strain Penn State apicoplast
98	NC_005086	ATT	4	15616	15627	12	Amborella trichopoda chloroplast
99	NC_005086	ATT	4	15644	15655	12	Amborella trichopoda chloroplast
100	NC_005087	ATT	4	29293	29304	12	Physcomitrella patens subsp. patens chloroplast
101	NC_005087	ATT	4	109694	109705	12	Physcomitrella patens subsp. patens chloroplast
102	NC_006137	ATT	4	150754	150765	12	Gracilaria tenuistipitata var. liui chloroplast
103	NC_007288	ATT	4	69951	69962	12	Emiliania huxleyi chloroplast
104	NC_007407	ATT	4	13923	13934	12	Acorus calamus plastid
105	NC_007578	ATT	4	9844	9855	12	Lactuca sativa chloroplast
106	NC_007932	ATT	4	120795	120806	12	Porphyra yezoensis chloroplast
107	NC_007942	ATT	4	14613	14624	12	Glycine max chloroplast
108	NC_008097	ATT	4	38402	38413	12	Chara vulgaris chloroplast
109	NC_008097	ATT	4	123143	123154	12	Chara vulgaris chloroplast
110	NC_008097	ATT	4	166134	166145	12	Chara vulgaris chloroplast
111	NC_008114	ATT	4	90343	90354	12	Pseudendoclonium akinetum chloroplast
112	NC_008115	ATT	4	119488	119499	12	Eucalyptus globulus subsp. globulus chloroplast
113	NC_008334	ATT	4	10785	10796	12	Citrus sinensis chloroplast
114	NC_008334	ATT	4	54513	54524	12	Citrus sinensis chloroplast
115	NC_008334	ATT	4	54791	54802	12	Citrus sinensis chloroplast
116	NC_008336	ATT	4	32313	32324	12	Nandina domestica chloroplast
117	NC_008408	ATT	4	28304	28315	12	Bigelowiella natans plastid
118	NC_008588	ATT	4	75904	75915	12	Phaeodactylum tricornutum chloroplast
119	NC_008589	ATT	4	77647	77658	12	Thalassiosira pseudonana chloroplast
120	NC_008788	ATT	4	35169	35180	12	Nuphar advena chloroplast
121	NC_009266	ATT	4	79894	79905	12	Aethionema grandiflorum chloroplast
122	NC_009268	ATT	4	13804	13815	12	Arabis hirsuta chloroplast
123	NC_009272	ATT	4	13013	13024	12	Draba nemorosa chloroplast
124	NC_009681	ATT	4	62716	62727	12	Leptosira terrestris chloroplast
125	NC_009681	ATT	4	116226	116237	12	Leptosira terrestris chloroplast
126	NC_009765	ATT	4	41835	41846	12	Cuscuta gronovii chloroplast
127	NC_010093	ATT	4	13599	13610	12	Acorus americanus chloroplast
128	NC_010109	ATT	4	88930	88941	12	Lemna minor chloroplast
129	NC_010323	ATT	4	34706	34717	12	Carica papaya chloroplast
130	NC_010359	ATT	4	25121	25132	12	Aneura mirabilis chloroplast
131	NC_010654	ATT	4	54113	54124	12	Welwitschia mirabilis chloroplast
132	NC_011600	ATT	4	33462	33473	12	Vaucheria litorea chloroplast
133	NC_011828	ATT	4	1821	1832	12	Trifolium subterraneum chloroplast
134	NC_011828	ATT	4	15020	15031	12	Trifolium subterraneum chloroplast
135	NC_011828	ATT	4	37852	37863	12	Trifolium subterraneum chloroplast
136	NC_012575	ATT	4	70217	70228	12	Micromonas sp. RCC299 chloroplast
137	NC_013498	ATT	4	63206	63217	12	Ectocarpus siliculosus chloroplast
138	NC_013498	ATT	4	63303	63314	12	Ectocarpus siliculosus chloroplast
139	NC_014057	ATT	4	4364	4375	12	Pisum sativum chloroplast

ChloroMitoSSRDB 2.0 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Chloroplast Motifs - Perfect ATT Repeats