ChloroMitoSSRDB 2.0 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Motif Summary

Chloroplast Motifs - Imperfect ATATG Repeats

S.NoSequence IDMotifIterationsStartEndTract LengthSequence Name
1NC_000932ATATG3862038621715 Arabidopsis thaliana chloroplast
2NC_008454ATATG318431918433315 Pelargonium x hortorum chloroplast
3NC_008359ATATG3893128932615 Morus indica chloroplast
4NC_008336ATATG3874498746315 Nandina domestica chloroplast
5NC_008334ATATG3902689028215 Citrus sinensis chloroplast
6NC_008235ATATG3870298704315 Populus alba chloroplast
7NC_008115ATATG3909179093115 Eucalyptus globulus subsp. globulus chloroplast
8NC_007957ATATG3911049111815 Vitis vinifera chloroplast
9NC_007944ATATG3907369075015 Gossypium hirsutum chloroplast
10NC_007144ATATG3885558856915 Cucumis sativus chloroplast
11NC_002693ATATG3913689138215 Oenothera elata subsp. hookeri plastid plastome I
12NC_002652ATATG3308203083314 Euglena longa plastid
13NC_002202ATATG3840928410615 Spinacia oleracea plastid
14NC_009265ATATG3854448545815 Aethionema cordifolium chloroplast
15NC_021455ATATG3871858719915Prinsepia utilis plastid
16NC_021102ATATG3855778559115Pachycladon cheesemanii chloroplast
17NC_021101ATATG3879108792415Francoa sonchifolia plastid
18NC_020363ATATG3617656177915Zingiber spectabile plastid
19NC_020362ATATG3648146482815Heliconia collinsiana plastid
20NC_009273ATATG3860628607615 Lepidium virginicum chloroplast
21NC_012224ATATG3935849359815 Jatropha curcas chloroplast
22NC_010433ATATG3913909140415 Manihot esculenta chloroplast
23NC_010362ATATG3897598977315 Oenothera parviflora chloroplast
24NC_010361ATATG3909909100415 Oenothera biennis chloroplast
25NC_010360ATATG3916179163115 Oenothera glazioviana chloroplast
26NC_010358ATATG3905399055315 Oenothera argillicola chloroplast
27NC_010323ATATG3908149082815 Carica papaya chloroplast
28NC_009275ATATG3863098632315 Nasturtium officinale chloroplast
29NC_009274ATATG3844218443515 Lobularia maritima chloroplast
30NC_008641ATATG3907669078015 Gossypium barbadense chloroplast
31NC_009272ATATG3845028451615 Draba nemorosa chloroplast
32NC_009271ATATG3861508616415 Crucihimalaya wallichii chloroplast
33NC_009270ATATG3857688578215 Capsella bursa-pastoris chloroplast
34NC_009269ATATG3854698548315 Barbarea verna chloroplast
35NC_009268ATATG3848508486415 Arabis hirsuta chloroplast
36NC_009267ATATG3859178593115 Olimarabidopsis pumila chloroplast
37NC_009266ATATG3855198553315 Aethionema grandiflorum chloroplast
38NC_019602ATATG3875068752015Fragaria virginiana chloroplast
39NC_009143ATATG3875418755515 Populus trichocarpa chloroplast
40NC_015083ATATG3851308514415Erodium carvifolium chloroplast
41NC_016668ATATG3906509066415Gossypium raimondii chloroplast
42NC_015996ATATG3898638987715Pyrus pyrifolia chloroplast
43NC_015983ATATG3882448825815Cucumis melo subsp. melo chloroplast
44NC_015308ATATG3912399125315Hevea brasiliensis chloroplast
45NC_015206ATATG3875268754015Fragaria vesca subsp. vesca chloroplast
46NC_015204ATATG3906819069515Gossypium thurberi chloroplast
47NC_016670ATATG3908259083915Gossypium darwinii chloroplast
48NC_014807ATATG3908449085815Corynocarpus laevigata chloroplast
49NC_014697ATATG3879968801015Prunus persica chloroplast
50NC_014676ATATG3913039131715Theobroma cacao chloroplast
51NC_014674ATATG3923689238215Castanea mollissima chloroplast
52NC_014570ATATG3907909080415Eucalyptus grandis chloroplast
53NC_018110ATATG3900969011015Gossypium somalense chloroplast
54NC_020019ATATG3886048861815Camellia sinensis chloroplast
55NC_019601ATATG3874878750115Fragaria chiloensis chloroplast
56NC_018767ATATG3875878760115Fragaria mandshurica plastid
57NC_018766ATATG3875838759715Fragaria vesca subsp. bracteata chloroplast
58NC_018565ATATG3859528596615Pachycladon enysii chloroplast
59NC_018113ATATG3904329044615Gossypium robinsonii chloroplast
60NC_018112ATATG3901289014215Gossypium areysianum chloroplast
61NC_018111ATATG3900109002415Gossypium capitis-viridis chloroplast
62NC_020152ATATG3924919250515Quercus rubra plastid
63NC_018109ATATG3898138982715Gossypium incanum chloroplast
64NC_017894ATATG3907349074815Gossypium gossypioides chloroplast
65NC_016921ATATG3870568707015Pentactina rupicola chloroplast
66NC_016736ATATG3923599237315Ricinus communis chloroplast
67NC_016727ATATG3836588367215Silene vulgaris chloroplast
68NC_016712ATATG3906459065915Gossypium arboreum chloroplast
69NC_016711ATATG3907429075615Gossypium mustelinum chloroplast
70NC_016692ATATG3907139072715Gossypium herbaceum subsp. africanum chloroplast
71NC_016690ATATG3908519086515Gossypium tomentosum chloroplast