Chloroplast Motifs - Perfect (ATAG) Repeats
S.No | Sequence ID | SSR | SSR Type | Tract Length | Start | End | Sequence Name |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_022136 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 58876 | 58887 | Lygodium japonicum chloroplast |
2 | NC_022136 | (ATAG)4 | p4 | 16 | 129432 | 129447 | Lygodium japonicum chloroplast |
3 | NC_021102 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 112071 | 112082 | Pachycladon cheesemanii chloroplast |
4 | NC_021091 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 71329 | 71340 | Vigna angularis chloroplast DNA |
5 | NC_020361 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 124953 | 124964 | Podocarpus totara chloroplast |
6 | NC_020019 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 149063 | 149074 | Camellia sinensis chloroplast |
7 | NC_018565 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 112454 | 112465 | Pachycladon enysii chloroplast |
8 | NC_016734 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 111092 | 111103 | Brassica napus chloroplast |
9 | NC_016064 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 73970 | 73981 | Pseudotsuga sinensis var. wilsoniana chloroplast |
10 | NC_016058 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 41883 | 41894 | Larix decidua chloroplast |
11 | NC_015899 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 74378 | 74389 | Wolffia australiana chloroplast |
12 | NC_015139 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 111520 | 111531 | Brassica rapa subsp. pekinensis chloroplast |
13 | NC_014575 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 21619 | 21630 | Cedrus deodara chloroplast |
14 | NC_014570 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 6609 | 6620 | Eucalyptus grandis chloroplast |
15 | NC_014570 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 117501 | 117512 | Eucalyptus grandis chloroplast |
16 | NC_011954 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 88960 | 88971 | Ephedra equisetina chloroplast |
17 | NC_010654 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 98163 | 98174 | Welwitschia mirabilis chloroplast |
18 | NC_009808 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 121619 | 121630 | Ipomoea purpurea chloroplast |
19 | NC_009618 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 129806 | 129817 | Cycas taitungensis chloroplast |
20 | NC_009618 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 38031 | 38042 | Cycas taitungensis chloroplast |
21 | NC_009598 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 5927 | 5938 | Chloranthus spicatus chloroplast |
22 | NC_009275 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 112800 | 112811 | Nasturtium officinale chloroplast |
23 | NC_009275 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 50905 | 50916 | Nasturtium officinale chloroplast |
24 | NC_009274 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 110721 | 110732 | Lobularia maritima chloroplast |
25 | NC_009273 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 112421 | 112432 | Lepidium virginicum chloroplast |
26 | NC_009272 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 110844 | 110855 | Draba nemorosa chloroplast |
27 | NC_009271 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 112642 | 112653 | Crucihimalaya wallichii chloroplast |
28 | NC_009270 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 112220 | 112231 | Capsella bursa-pastoris chloroplast |
29 | NC_009269 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 111963 | 111974 | Barbarea verna chloroplast |
30 | NC_009268 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 111262 | 111273 | Arabis hirsuta chloroplast |
31 | NC_009267 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 112397 | 112408 | Olimarabidopsis pumila chloroplast |
32 | NC_009266 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 111993 | 112004 | Aethionema grandiflorum chloroplast |
33 | NC_009265 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 111933 | 111944 | Aethionema cordifolium chloroplast |
34 | NC_008407 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 157912 | 157923 | Jasminum nudiflorum chloroplast |
35 | NC_008235 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 13279 | 13290 | Populus alba chloroplast |
36 | NC_008115 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 117649 | 117660 | Eucalyptus globulus subsp. globulus chloroplast |
37 | NC_008115 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 6665 | 6676 | Eucalyptus globulus subsp. globulus chloroplast |
38 | NC_007957 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 39012 | 39023 | Vitis vinifera chloroplast |
39 | NC_000932 | (ATAG)3 | p4 | 12 | 112460 | 112471 | Arabidopsis thaliana chloroplast |