ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Barnettozyma californica strain CBS 252 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_022159(AAAT)4p4466116Design Primer
2NC_022159(A)10cattggttaatgaaacacctaatggatataattt(TAA)9c994106471Design Primer
3NC_022159(A)10p11218122710Design Primer
4NC_022159(TTATA)3p51853186715Design Primer
5NC_022159(AATT)3p42842285312Design Primer
6NC_022159(ATAA)3p43035304612Design Primer
7NC_022159(TTA)4p35313532412Design Primer
8NC_022159(A)10p16852686110Design Primer
9NC_022159(ATAA)3p47339735012Design Primer
10NC_022159(A)11p17635764511Design Primer
11NC_022159(ATTA)3p48639865012Design Primer
12NC_022159(C)10p19940994910Design Primer
13NC_022159(AATA)3(A)11*c*112931131422Design Primer
14NC_022159(AT)6p2119831199412Design Primer
15NC_022159(A)11p1124541246411Design Primer
16NC_022159(AATA)3tatttttaaaattaatgg(A)12c132181325942Design Primer
17NC_022159(AT)6p2139411395212Design Primer
18NC_022159(TTA)4p3143851439612Design Primer
19NC_022159(ATT)4p3154001541112Design Primer
20NC_022159(T)10p1155601556910Design Primer
21NC_022159(TTAT)3p4157991581012Design Primer
22NC_022159(AATT)3p4160411605212Design Primer
23NC_022159(ATA)4taaatg(AT)7c163051633632Design Primer
24NC_022159(TAT)4p3165631657412Design Primer
25NC_022159(TAT)4p3170611707212Design Primer
26NC_022159(AAT)4p3173511736212Design Primer
27NC_022159(TAA)4p3175211753212Design Primer
28NC_022159(AAT)8p3176721769524Design Primer
29NC_022159(TAA)4p3179281793912Design Primer
30NC_022159(TATT)3p4186751868612Design Primer
31NC_022159(TA)6ataatat(TA)6c188121884231Design Primer
32NC_022159(G)19actaatgaaatagtataaaatataaaaataaatacaaatcaaaaaaaatgattaaaacaatatcaatattaatgataattaatacaataatat(TAA)4c1918819311124Design Primer
33NC_022159(TAA)7tatgtttatatatgttatat(TAA)4c195531960553Design Primer
34NC_022159(TA)8p2197931980816Design Primer
35NC_022159(ATT)4p3205942060512Design Primer
36NC_022159(AATA)3p4211482115912Design Primer
37NC_022159(ATAA)3p4213552136612Design Primer
38NC_022159(ATA)4p3214732148412Design Primer
39NC_022159(TAA)4p3215972160812Design Primer
40NC_022159(AAT)7ttatattatacatctattattaatgatttaaataatatattaggtagttactcatttaataaat(ATA)5c2178421883100Design Primer
41NC_022159(TAA)5p3221372215115Design Primer
42NC_022159(TTACTA)3p6226432266018Design Primer
43NC_022159(TA)7p2229242293714Design Primer
44NC_022159(ATTT)3p4234142342512Design Primer
45NC_022159(A)12p1240492406012Design Primer
46NC_022159(AATA)3p4262322624312Design Primer
47NC_022159(AATT)3p4265972660812Design Primer
48NC_022159(TAT)4ttttaat(TAA)5c272432727634Design Primer
49NC_022159(AT)6p2276702768112Design Primer
50NC_022159(AAT)5p3278792789315Design Primer
51NC_022159(C)10ttc(G)11acgggtccccttcagaggtaatatattaggagatgtttatattataccatcaatgaaatataaattaaattttaatgc(AAAT)3attcatttttattatttatttttaatataatactttaataatgacatagtctgaacaatatataaa(AT)6tat(TA)6c2821228418207Design Primer
52NC_022159(AATT)3p4287412875212Design Primer
53NC_022159(AATA)3p4288762888712Design Primer
54NC_022159(ATT)4p3292232923412Design Primer
55NC_022159(A)10p1298732988210Design Primer
56NC_022159(ATTA)4ataaataataataaaaattaagattaatatttattaaataataaatattaaaaatattaaataatgaattt(AATA)3c305803067899Design Primer
57NC_022159(AT)6p2309503096112Design Primer
58NC_022159(TAT)4p3316593167012Design Primer
59NC_022159(AAT)7p3319263194621Design Primer
60NC_022159(ATA)4p3321333214412Design Primer
61NC_022159(TTA)4p3324423245312Design Primer
62NC_022159(TA)10p2326943271320Design Primer
63NC_022159(TAA)4p3332393325012Design Primer
64NC_022159(TTA)4p3338703388112Design Primer
65NC_022159(TTA)4p3341103412112Design Primer
66NC_022159(AAT)7p3347063472621Design Primer
67NC_022159(TA)6p2357373574812Design Primer
68NC_022159(AAT)4aaaataatatcaaataataaattattattaaattcatcatta(AAT)4c365973666266Design Primer
69NC_022159(A)12p1380243803512Design Primer
70NC_022159(TA)9p2390043902118Design Primer
71NC_022159(AATA)3(TAT)4*c*392393926022Design Primer
72NC_022159(ATA)4p3397003971112Design Primer
73NC_022159(A)10p1403804038910Design Primer
74NC_022159(A)10p1405884059710Design Primer
75NC_022159(TAA)4p3413834139412Design Primer
76NC_022159(TTTA)3p4415554156612Design Primer
77NC_022159(TTAA)3p4419114192212Design Primer
78NC_022159(TATTTA)3p6427564277318Design Primer
79NC_022159(TTAA)3p4434494346012Design Primer
80NC_022159(TTAT)3p4441904420112Design Primer
81NC_022159(ATTT)3attaaataaatagggaggacgggttccctttagaag(ATAA)3c453854544460Design Primer
82NC_022159(ATA)4tattatcattaacatttccttctaaaagtatacctttaatatttttaataatatattatttatacaataatacagctaatatgt(ATA)4tat(ATA)5tattaata(AAT)5c4596546113149Design Primer
83NC_022159(TAT)4p3462504626112Design Primer
84NC_022159(ATTA)3tattaataaatattattataatttataaatattatatttataataatattattatatatat(TA)6c464064649085Design Primer
85NC_022159(TAA)4p3467364674712Design Primer
86NC_022159(ATA)4p3469784698912Design Primer
87NC_022159(TAA)4p3473134732412Design Primer
88NC_022159(TAT)4p3477364774712Design Primer
89NC_022159(TAAT)3(TTAA)3c484014842424Design Primer