ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Vitis vinifera mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_012119(AACA)3p440041112Design Primer
2NC_012119(ATA)4p32505251612Design Primer
3NC_012119(TA)8a(AT)6c107081073629Design Primer
4NC_012119(A)10p1138391384810Design Primer
5NC_012119(GGGA)3p4164561646712Design Primer
6NC_012119(TTCA)3p4219602197112Design Primer
7NC_012119(ACTAG)3p5228332284715Design Primer
8NC_012119(C)11p1257332574311Design Primer
9NC_012119(A)10(AC)6*c*260902611021Design Primer
10NC_012119(AT)12p2265822660524Design Primer
11NC_012119(T)14p1276512766414Design Primer
12NC_012119(AGT)4p3279722798312Design Primer
13NC_012119(T)10p1305113052010Design Primer
14NC_012119(T)14p1330883310114Design Primer
15NC_012119(T)12p1392033921412Design Primer
16NC_012119(A)11p1410024101211Design Primer
17NC_012119(TTA)5p3454844549815Design Primer
18NC_012119(ATGA)3p4468314684212Design Primer
19NC_012119(TCGG)3p4479004791112Design Primer
20NC_012119(A)10p1483674837610Design Primer
21NC_012119(G)10p1502845029310Design Primer
22NC_012119(GCTA)3p4507585076912Design Primer
23NC_012119(A)10p1532635327210Design Primer
24NC_012119(ACA)4p3563895640012Design Primer
25NC_012119(A)10p1612556126410Design Primer
26NC_012119(AGTG)3p4636266363712Design Primer
27NC_012119(T)11p1645936460311Design Primer
28NC_012119(A)10p1648066481510Design Primer
29NC_012119(A)12p1667886679912Design Primer
30NC_012119(T)10p1669456695410Design Primer
31NC_012119(TTCC)3p4685166852712Design Primer
32NC_012119(T)10p1801158012410Design Primer
33NC_012119(AG)6p2912429125312Design Primer
34NC_012119(T)10p1957939580210Design Primer
35NC_012119(A)13p1973179732913Design Primer
36NC_012119(GAAA)3p4997129972312Design Primer
37NC_012119(ATGAC)3p510301810303215Design Primer
38NC_012119(T)10p110426910427810Design Primer
39NC_012119(TATC)3p410897310898412Design Primer
40NC_012119(AGAA)3p411079411080512Design Primer
41NC_012119(TTCT)3p411447811448912Design Primer
42NC_012119(CTT)4p312433512434612Design Primer
43NC_012119(TTTATT)3taaggcagtaaagc(ATT)4c12778012782344Design Primer
44NC_012119(CTG)4p313805913807012Design Primer
45NC_012119(TCTT)3p413948413949512Design Primer
46NC_012119(AGAA)3p414025514026612Design Primer
47NC_012119(TGGA)3p414563114564212Design Primer
48NC_012119(T)10ctagagattctactgacttaagggacat(A)10c14649314654048Design Primer
49NC_012119(A)10p114777214778110Design Primer
50NC_012119(T)11p114804514805511Design Primer
51NC_012119(ATCA)3p415165115166212Design Primer
52NC_012119(AGA)4p315468715469812Design Primer
53NC_012119(TCTA)3p415726615727712Design Primer
54NC_012119(CTAT)3tatcagtctttctttgagcttaaccttctcacgacttactatctctaaccctacttcaagagcctagctttcttactgctgcctttagcc(TA)8c159371159488118Design Primer
55NC_012119(GAAG)3p416939116940212Design Primer
56NC_012119(GAA)4p317100817101912Design Primer
57NC_012119(GAAA)3p417123717124812Design Primer
58NC_012119(AAATA)3p517202417203815Design Primer
59NC_012119(CAAC)3p417386217387312Design Primer
60NC_012119(T)10p117429817430710Design Primer
61NC_012119(A)13p117466117467313Design Primer
62NC_012119(TA)6p217730617731712Design Primer
63NC_012119(AAT)4p318179018180112Design Primer
64NC_012119(TTAT)3p418421818422912Design Primer
65NC_012119(G)10p118453518454410Design Primer
66NC_012119(CGGC)3p418885118886212Design Primer
67NC_012119(CATT)3p420543420544512Design Primer
68NC_012119(GGCG)3p420826320827412Design Primer
69NC_012119(GAA)4gattataagtcaaggggaagacagcacaaagtaatccgacctggcagt(GAA)4c22413722420872Design Primer
70NC_012119(A)10p122813322814210Design Primer
71NC_012119(AGGGG)3p522848022849415Design Primer
72NC_012119(TAT)5p323155223156615Design Primer
73NC_012119(T)10atttgaatttaacccatcagtaatataataatattagaatt(ATA)4c23656823663063Design Primer
74NC_012119(T)11p123780523781511Design Primer
75NC_012119(AT)6p223842523843612Design Primer
76NC_012119(A)10p124069324070210Design Primer
77NC_012119(TTTTC)3p524254824256215Design Primer
78NC_012119(CTTG)3p424403424404512Design Primer
79NC_012119(TTAA)6p424465424467724Design Primer
80NC_012119(G)12p124537324538412Design Primer
81NC_012119(AAGA)3p424568124569212Design Primer
82NC_012119(AAAG)3p424774124775212Design Primer
83NC_012119(AG)6p224822224823312Design Primer
84NC_012119(A)10p125685025685910Design Primer
85NC_012119(TTAT)4p425958825960316Design Primer
86NC_012119(T)11p126613026614011Design Primer
87NC_012119(T)10p126911926912810Design Primer
88NC_012119(T)11p127177027178011Design Primer
89NC_012119(AAG)4p327848227849312Design Primer
90NC_012119(CG)7p228450828452114Design Primer
91NC_012119(AATC)3p428557228558312Design Primer
92NC_012119(CTTA)3p429182929184012Design Primer
93NC_012119(TTA)4p329473429474512Design Primer
94NC_012119(TTA)5p329887129888515Design Primer
95NC_012119(GTTT)3p431199431200512Design Primer
96NC_012119(CAT)4p331797931799012Design Primer
97NC_012119(ACTC)3p432065132066212Design Primer
98NC_012119(A)10p132626032626910Design Primer
99NC_012119(A)11p132815732816711Design Primer
100NC_012119(TA)6aatatataataatatatata(ATT)4atattatataattataaggcgggaaaatatgttattgttatgctgagcactggcaggcaaaatgaagta(AAT)4c332483332607125Design Primer
101NC_012119(T)11p133394933395911Design Primer
102NC_012119(T)11p133611133612111Design Primer
103NC_012119(C)13p133826033827213Design Primer
104NC_012119(TTAG)3p434040934042012Design Primer
105NC_012119(AAAT)3p434650234651312Design Primer
106NC_012119(TCCA)3p434680534681612Design Primer
107NC_012119(AT)8p234693434694916Design Primer
108NC_012119(GCCC)3p435394535395612Design Primer
109NC_012119(AT)11aaatatattat(TA)6ataa(T)11c35454535460460Design Primer
110NC_012119(GGAA)3p435554835555912Design Primer
111NC_012119(TA)8tctt(TA)7c35637435640734Design Primer
112NC_012119(A)10p135784735785610Design Primer
113NC_012119(AT)6p236000436001512Design Primer
114NC_012119(A)10p136051536052410Design Primer
115NC_012119(A)10p136563936564810Design Primer
116NC_012119(AATG)3tgaatttggattctatataagctatgctgcgtatcgcacgcttgttatattagatatatataatattag(AT)6ttata(AT)8c368869368982114Design Primer
117NC_012119(ATTC)3p436950536951612Design Primer
118NC_012119(TAA)6p337008937010618Design Primer
119NC_012119(TTTC)3p438359038360112Design Primer
120NC_012119(CCATCA)3p638960438962118Design Primer
121NC_012119(ATTG)3p439408539409612Design Primer
122NC_012119(T)12p140020340021412Design Primer
123NC_012119(CTA)4p340755140756212Design Primer
124NC_012119(ACTA)3p441368841369912Design Primer
125NC_012119(A)16p141682341683816Design Primer
126NC_012119(A)10p142157042157910Design Primer
127NC_012119(T)11p142502242503211Design Primer
128NC_012119(T)13p142622342623513Design Primer
129NC_012119(T)11p142681142682111Design Primer
130NC_012119(CATT)3p442831542832612Design Primer
131NC_012119(A)11p142975742976711Design Primer
132NC_012119(GTAT)3p443049443050512Design Primer
133NC_012119(T)11p143150443151411Design Primer
134NC_012119(T)12p143344343345412Design Primer
135NC_012119(T)14p143641743643014Design Primer
136NC_012119(T)12p144216544217612Design Primer
137NC_012119(T)10p144502744503610Design Primer
138NC_012119(TCTCT)3p544979444980815Design Primer
139NC_012119(AAGA)3p445028445029512Design Primer
140NC_012119(TA)6p245059845060912Design Primer
141NC_012119(GCT)4p346187146188212Design Primer
142NC_012119(T)14p147440947442214Design Primer
143NC_012119(T)10p147519147520010Design Primer
144NC_012119(A)10p147674247675110Design Primer
145NC_012119(TAT)4p347773147774212Design Primer
146NC_012119(A)13p147821847823013Design Primer
147NC_012119(A)10p147904347905210Design Primer
148NC_012119(TA)6aacttcgtgtaagccggggaaaaccagaaccatttgaatcactgcactacttgatgaaaatggttctcacaaacgccaaacgtattcaattca(T)11acttaactcaagaggag(A)11c480407480550144Design Primer
149NC_012119(A)11taaaaatatattattttcgagaacgggtttttgtcggt(A)10c48205648211459Design Primer
150NC_012119(TCCA)3p448762148763212Design Primer
151NC_012119(A)11p148834348835311Design Primer
152NC_012119(A)11p149279649280611Design Primer
153NC_012119(CTT)4p349436749437812Design Primer
154NC_012119(T)10p149815549816410Design Primer
155NC_012119(ATG)4p349977849978912Design Primer
156NC_012119(TTACT)3p550234850236215Design Primer
157NC_012119(ATAC)3p451324951326012Design Primer
158NC_012119(T)10p151668951669810Design Primer
159NC_012119(TTC)4p352589452590512Design Primer
160NC_012119(T)13p152673752674913Design Primer
161NC_012119(AT)7g(A)11c52755652758126Design Primer
162NC_012119(A)12p152904152905212Design Primer
163NC_012119(A)10p152935752936610Design Primer
164NC_012119(T)10p153451253452110Design Primer
165NC_012119(TGAC)3p453720553721612Design Primer
166NC_012119(GATG)4p453813853815316Design Primer
167NC_012119(TTCA)3p453942053943112Design Primer
168NC_012119(A)13p154494654495813Design Primer
169NC_012119(GCAA)3p454753054754112Design Primer
170NC_012119(GCAAA)3p554835254836615Design Primer
171NC_012119(AGG)4p354910754911812Design Primer
172NC_012119(T)12p155526755527812Design Primer
173NC_012119(TTCA)3p456204156205212Design Primer
174NC_012119(TAAG)3p456246656247712Design Primer
175NC_012119(AGGC)3p456376856377912Design Primer
176NC_012119(T)10p156755056755910Design Primer
177NC_012119(GCG)4p356885856886912Design Primer
178NC_012119(A)10p157458957459810Design Primer
179NC_012119(CTTT)3p457680857681912Design Primer
180NC_012119(A)10p158470058470910Design Primer
181NC_012119(T)11p158593758594711Design Primer
182NC_012119(GCTA)3p458688858689912Design Primer
183NC_012119(TTCTCT)3p658721558723218Design Primer
184NC_012119(ATTG)5p458845858847720Design Primer
185NC_012119(T)10p158860258861110Design Primer
186NC_012119(TA)11tttta(AT)8c59087759091943Design Primer
187NC_012119(CTTT)3p459581259582312Design Primer
188NC_012119(T)11p159675259676211Design Primer
189NC_012119(AAGA)3p460448760449812Design Primer
190NC_012119(AT)6p260596460597512Design Primer
191NC_012119(AT)10ttttatattaccggttggctggtttttatgcaaaaaagacaaaacgggattggatttccactcat(AAGG)3c60960860970497Design Primer
192NC_012119(TA)10ttattattaatatatcaaaatatataaatatatatattaataaatatatttattaatatatataaagatatatattaat(TA)8c611122611236115Design Primer
193NC_012119(T)10p161227361228210Design Primer
194NC_012119(T)10p161322961323810Design Primer
195NC_012119(A)10p161569961570810Design Primer
196NC_012119(TGTC)3p461618961620012Design Primer
197NC_012119(TTCT)3p461668961670012Design Primer
198NC_012119(A)10p162302462303310Design Primer
199NC_012119(A)10p162322962323810Design Primer
200NC_012119(TA)6aatatattttttgctatcatctacgcatataccttgtttcttggttaggtctctgccttagtgggattctatctac(T)11c62654062663899Design Primer
201NC_012119(ACCGT)3p562819262820615Design Primer
202NC_012119(ATAA)3(AT)8c62997963000628Design Primer
203NC_012119(T)10p163040163041010Design Primer
204NC_012119(AATA)3p463456763457812Design Primer
205NC_012119(CTTT)3p463500263501312Design Primer
206NC_012119(AAG)4p363856463857512Design Primer
207NC_012119(TAAA)22p464109164117888Design Primer
208NC_012119(TTTC)3p464221664222712Design Primer
209NC_012119(GAAT)3p465029165030212Design Primer
210NC_012119(AAGA)3p465376565377612Design Primer
211NC_012119(A)10p166143666144510Design Primer
212NC_012119(CTT)4p366166766167812Design Primer
213NC_012119(T)12p166622066623112Design Primer
214NC_012119(AGA)4p366643066644112Design Primer
215NC_012119(A)15p166830266831615Design Primer
216NC_012119(A)15p167022867024215Design Primer
217NC_012119(A)10p167263467264310Design Primer
218NC_012119(A)10p167322667323510Design Primer
219NC_012119(T)10p167483767484610Design Primer
220NC_012119(T)13p167740467741613Design Primer
221NC_012119(CTT)4p367847667848712Design Primer
222NC_012119(AT)7p268295268296514Design Primer
223NC_012119(AGGA)3p468358468359512Design Primer
224NC_012119(AGAA)3p469421069422112Design Primer
225NC_012119(GAGC)3p469457969459012Design Primer
226NC_012119(TGCT)3p469548569549612Design Primer
227NC_012119(GGCC)3cgtagatctaaaaggatccatccataggcctgaccggatatcgtttgtccacgaacaaaac(A)10c69717869726083Design Primer
228NC_012119(T)11p169737269738211Design Primer
229NC_012119(CAG)4p370307170308212Design Primer
230NC_012119(GAAA)3p470399370400412Design Primer
231NC_012119(TA)8p271121271122716Design Primer
232NC_012119(TAG)4p371192471193512Design Primer
233NC_012119(CTTT)3attccagg(CTTT)4c73633573637036Design Primer
234NC_012119(A)10p174185574186410Design Primer
235NC_012119(TTCT)3ggaagctgaatgagcttcgcggcaaggaggccgtcgagaatgtcatcgagcttgtcgtcgggaataa(AAAC)3c74458274467291Design Primer
236NC_012119(AAAG)3p474650774651812Design Primer
237NC_012119(T)14p174900874902114Design Primer
238NC_012119(T)12p174957874958912Design Primer
239NC_012119(A)11p175000875001811Design Primer
240NC_012119(T)10p175039975040810Design Primer
241NC_012119(T)12p175229075230112Design Primer
242NC_012119(A)10p175323775324610Design Primer
243NC_012119(CCAG)3p475385375386412Design Primer
244NC_012119(TGT)4p375825775826812Design Primer
245NC_012119(C)11p176114976115911Design Primer
246NC_012119(CTTT)3p476148176149212Design Primer
247NC_012119(TCT)4p377152777153812Design Primer