ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Compound Compound Repeats of Bombus ignitus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_010967(TA)12agtaatatgtctgaaaaaagatatattttgataaaatatatatgtatatattggtaattatactattactataaattta(AT)10c196318123Design Primer
2NC_010967(ATTTA)3atataaatttttcttaatctttaaatttgcaatttaaaatttttttttaaactatattaaatttatatt(TA)13c13791488110Design Primer
3NC_010967(TA)9ataataa(T)12ataatattaatttattcattaattataaatgattttgtagttatttaaattgaatatattaaatattaatatta(AT)20aaataaatatataaggattttttataaaatctatatttaagtcgaaattaaaagtaataactttacttct(TA)16c61416393253Design Primer
4NC_010967(AATA)3attaattataaatacgaaataaattaataaagcttctaactttaatttagatacttaactatcattatttctatttatttatatttaa(AT)15tatttaaaaataaaataatttccttaatattttcaatattatgctctactaataagctatttaaatctttcatttgaaat(TAAA)3tttttcaattatatatctattaaaatataattattttcaatttattta(TATT)4a(AT)25aattaattattaataaataaaattaatatt(AATA)3c65286906379Design Primer
5NC_010967(TAAATT)3ataaatctctccaaactgaataaaac(TAAA)3c8593864856Design Primer
6NC_010967(AATA)3aaattaaaattatcaaatctaaaatctttaatttct(A)13c9272933261Design Primer
7NC_010967(TA)11tgaatataattataaatttaaaatttacattatttattaatcactaattcaatcattatatttaatttaaacaaattaaaaattatttttttttttaaa(AT)7c1400714141135Design Primer
8NC_010967(TAA)4cttataattataatataaaaattaaattttataaaacatttatttattcatatac(AT)12c156031569391Design Primer
9NC_010967(TATT)3(TA)24c159321599160Design Primer
10NC_010967(TA)9ttaaaatttaaaattatttatattattatcattattataataattca(AAT)5c163391641880Design Primer