Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Zea luxurians mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_008333(ATG)4p31986199712Design Primer
2NC_008333(CAAG)3p47395740612Design Primer
3NC_008333(A)10p1117561176510Design Primer
4NC_008333(AATG)3p4125481255912Design Primer
5NC_008333(AAAG)3p4138941390512Design Primer
6NC_008333(CTGA)3p4162301624112Design Primer
7NC_008333(TAATA)3p5200512006515Design Primer
8NC_008333(AAAGT)3p5207002071415Design Primer
9NC_008333(TCAAA)3p5278562787015Design Primer
10NC_008333(GAATGG)3p6318583187518Design Primer
11NC_008333(TAAG)3p4334233343412Design Primer
12NC_008333(TCTT)3p4353193533012Design Primer
13NC_008333(TATT)3p4355253553612Design Primer
14NC_008333(TAAGT)3p5384913850515Design Primer
15NC_008333(GTTTA)3p5425774259115Design Primer
16NC_008333(GACT)3p4459134592412Design Primer
17NC_008333(T)10p1469454695410Design Primer
18NC_008333(TTAGT)4p5544665448520Design Primer
19NC_008333(AAT)4ataaagatataatata(TAT)5c547725481443Design Primer
20NC_008333(A)10p1562515626010Design Primer
21NC_008333(TATAG)3p5573515736515Design Primer
22NC_008333(TATTA)3p5581695818315Design Primer
23NC_008333(AACAA)3p5635706358415Design Primer
24NC_008333(ACTTC)3p5644396445315Design Primer
25NC_008333(GGAT)3p4651556516612Design Primer
26NC_008333(ACTAC)3p5732177323115Design Primer
27NC_008333(AAAG)3p4754177542812Design Primer
28NC_008333(TCTTT)3gggtgtagtcggacattccactttgttaag(TTCTT)3c815968165560Design Primer
29NC_008333(T)10agttcgcactgctctttctctctaaattgcatcaaagaaaat(AG)6c824138247664Design Primer
30NC_008333(GAGC)3p4851788518912Design Primer
31NC_008333(TTAAG)3p5921379215115Design Primer
32NC_008333(TTCTA)3p5939219393515Design Primer
33NC_008333(TTCTAT)3p6954969551318Design Primer
34NC_008333(TAATA)3p5976649767815Design Primer
35NC_008333(C)10p1978549786310Design Primer
36NC_008333(AGTAT)3p5993299934315Design Primer
37NC_008333(AAAG)3p4997819979212Design Primer
38NC_008333(TCTTAT)4p610010910013224Design Primer
39NC_008333(ATCTT)4p510160610162520Design Primer
40NC_008333(ATC)4p311180011181112Design Primer
41NC_008333(AGGCAG)3p611597811599518Design Primer
42NC_008333(AAG)4p311876911878012Design Primer
43NC_008333(TCATA)3p511933311934715Design Primer
44NC_008333(GTC)4p312017812018912Design Primer
45NC_008333(CT)6p212070512071612Design Primer
46NC_008333(T)10p112906712907610Design Primer
47NC_008333(GTATA)4p513011913013820Design Primer
48NC_008333(ACCCA)4p513052213054120Design Primer
49NC_008333(ACTAT)5p513221813224225Design Primer
50NC_008333(A)14p113507413508714Design Primer
51NC_008333(T)14p114298214299514Design Primer
52NC_008333(T)12p114522414523512Design Primer
53NC_008333(GAAAT)3p514674714676115Design Primer
54NC_008333(CTAC)4p414727214728716Design Primer
55NC_008333(TTATG)3p514744314745715Design Primer
56NC_008333(CTCA)3p414995514996612Design Primer
57NC_008333(AAAG)3p415398215399312Design Primer
58NC_008333(TTGAA)3p515464815466215Design Primer
59NC_008333(ATAGA)3p515578915580315Design Primer
60NC_008333(GAAAG)3p516400516401915Design Primer
61NC_008333(CTAT)3p416672816673912Design Primer
62NC_008333(GAATT)3p516812616814015Design Primer
63NC_008333(TAGTAC)4p616868416870724Design Primer
64NC_008333(ACTC)3p417703617704712Design Primer
65NC_008333(CCATTT)3cc(ATAGTA)4c17980817985144Design Primer
66NC_008333(AGTACT)5p618149018151930Design Primer
67NC_008333(GCAA)3p418342118343212Design Primer
68NC_008333(TCTT)3p418632818633912Design Primer
69NC_008333(TAAAG)4p518662318664220Design Primer
70NC_008333(ATCTAT)4p618833118835424Design Primer
71NC_008333(TCTAAG)3p618921618923318Design Primer
72NC_008333(T)10p119273819274710Design Primer
73NC_008333(AAGA)3p419571619572712Design Primer
74NC_008333(ATAAG)3p519780819782215Design Primer
75NC_008333(AGATAA)3p619954719956418Design Primer
76NC_008333(ATA)4p320551920553012Design Primer
77NC_008333(ATATA)5p520666020668425Design Primer
78NC_008333(ATCT)3p421097321098412Design Primer
79NC_008333(TGAA)3p421268821269912Design Primer
80NC_008333(CTATA)3p521310221311615Design Primer
81NC_008333(T)11p121543521544511Design Primer
82NC_008333(GAA)4p321872121873212Design Primer
83NC_008333(TCAAA)5p521943721946125Design Primer
84NC_008333(CAGATA)3p622396822398518Design Primer
85NC_008333(T)11p122631222632211Design Primer
86NC_008333(GTA)4p323000723001812Design Primer
87NC_008333(GGGCC)3p523443023444415Design Primer
88NC_008333(ATAA)3p423613423614512Design Primer
89NC_008333(GCAA)3tcagcatttcgtt(CACTTA)3c23809323813543Design Primer
90NC_008333(ATCCT)4p523841123843020Design Primer
91NC_008333(T)10p124039124040010Design Primer
92NC_008333(T)10cgtctatacaagaaaagaaggatttgtgtttagcaagacagagaatttaataagt(A)13c24733424741178Design Primer
93NC_008333(TAGA)4p425073925075416Design Primer
94NC_008333(CTGT)3p425191625192712Design Primer
95NC_008333(TATAC)5p525409525411925Design Primer
96NC_008333(TAAAG)7p525463425466835Design Primer
97NC_008333(TGAG)3tccactgtttacgttacaactagcagtagcgtgtcaattctagtcagaaaaaaagctttccattgattcatgata(GTGCC)3c258277258378102Design Primer
98NC_008333(A)10p126280026280910Design Primer
99NC_008333(TAAG)3p427413127414212Design Primer
100NC_008333(TTGC)3p427806427807512Design Primer
101NC_008333(AAG)4p328367328368412Design Primer
102NC_008333(TGT)4p328578528579612Design Primer
103NC_008333(TTTC)3p428692928694012Design Primer
104NC_008333(TTTGA)3p529169629171015Design Primer
105NC_008333(AAAG)3p429517329518412Design Primer
106NC_008333(ACCTT)3p529926729928115Design Primer
107NC_008333(TGGAT)4(GATT)3*c*30370230373029Design Primer
108NC_008333(TAAA)3p430651930653012Design Primer
109NC_008333(AGT)4p330718030719112Design Primer
110NC_008333(AGA)4p331417931419012Design Primer
111NC_008333(CAGT)3p431627431628512Design Primer
112NC_008333(CTGT)3p431710631711712Design Primer
113NC_008333(TTAGT)3p531758031759415Design Primer
114NC_008333(CTCTA)4ct(AAATG)4c32052432056542Design Primer
115NC_008333(ATTTC)3p532128332129715Design Primer
116NC_008333(GGGC)3p432623832624912Design Primer
117NC_008333(TTACT)4p532989632991520Design Primer
118NC_008333(ACCA)3p433042833043912Design Primer
119NC_008333(AAGGAA)3p633062133063818Design Primer
120NC_008333(TTTC)3p433209533210612Design Primer
121NC_008333(GGT)4p333223433224512Design Primer
122NC_008333(ATATC)3atatatagtaaagcaacaataatgaaacgtgtgcgt(TATAG)3c33384633391166Design Primer
123NC_008333(TTATA)3p533422933424315Design Primer
124NC_008333(TTA)4p333500433501512Design Primer
125NC_008333(ACCCTA)4p633520033522324Design Primer
126NC_008333(AGAGA)3p534386934388315Design Primer
127NC_008333(ATAGT)6p534972134975030Design Primer
128NC_008333(GTTTA)3p535046135047515Design Primer
129NC_008333(ATAGT)8agcggccgaggacttgcatctatttcaactcaactagacgtgaatacggtctttctccacggcaacaac(GAG)4c352456352576121Design Primer
130NC_008333(A)10p135758935759810Design Primer
131NC_008333(TCTAC)5p535988535990925Design Primer
132NC_008333(CTTTAT)3p636062136063818Design Primer
133NC_008333(TACTA)4p536329036330920Design Primer
134NC_008333(TATAGA)7p636359436363542Design Primer
135NC_008333(TAC)4p336466636467712Design Primer
136NC_008333(TAGC)3p436511736512812Design Primer
137NC_008333(TAGTA)5p536756136758525Design Primer
138NC_008333(GAA)4p337089837090912Design Primer
139NC_008333(TACATA)3p637198637200318Design Primer
140NC_008333(CTTTT)3p537282137283515Design Primer
141NC_008333(AGTAA)3p537357237358615Design Primer
142NC_008333(CTACG)3p537708837710215Design Primer
143NC_008333(GCCT)3p437843237844312Design Primer
144NC_008333(ATTCC)3p538041738043115Design Primer
145NC_008333(ATACT)3p538352538353915Design Primer
146NC_008333(TAGCTT)3p638658138659818Design Primer
147NC_008333(TATAC)3p538778938780315Design Primer
148NC_008333(ACT)4p339102639103712Design Primer
149NC_008333(TA)6p239380739381812Design Primer
150NC_008333(GTAAA)7p539621439624835Design Primer
151NC_008333(TTCTGG)3p639657439659118Design Primer
152NC_008333(AGAA)3p439779639780712Design Primer
153NC_008333(AGA)4p339943739944812Design Primer
154NC_008333(CTA)6p340196940198618Design Primer
155NC_008333(AAAG)3p441104641105712Design Primer
156NC_008333(GA)6p241298741299812Design Primer
157NC_008333(A)10p141320641321510Design Primer
158NC_008333(CTTG)3p441467241468312Design Primer
159NC_008333(TTACTT)3p641560741562418Design Primer
160NC_008333(TTTAC)3p541589741591115Design Primer
161NC_008333(CTAAC)3p542299742301115Design Primer
162NC_008333(TATGGT)3p642753742755418Design Primer
163NC_008333(A)10p142953242954110Design Primer
164NC_008333(AGCC)3p443184843185912Design Primer
165NC_008333(AAGA)3p443483243484312Design Primer
166NC_008333(ATGGAA)3p643609143610818Design Primer
167NC_008333(ATACA)3p543635243636615Design Primer
168NC_008333(TACTA)3p543656343657715Design Primer
169NC_008333(A)10p143746243747110Design Primer
170NC_008333(CT)6p244025344026412Design Primer
171NC_008333(CCTAT)9p544061044065445Design Primer
172NC_008333(AGGA)3p444224344225412Design Primer
173NC_008333(CATC)3p446259246260312Design Primer
174NC_008333(TGTAT)4p546432946434820Design Primer
175NC_008333(TTAGAT)3p646508846510518Design Primer
176NC_008333(ATAGT)3p546554746556115Design Primer
177NC_008333(CTTAG)3p546685546686915Design Primer
178NC_008333(ATGAGT)3p646932646934318Design Primer
179NC_008333(ATGAA)3p547243947245315Design Primer
180NC_008333(GAGC)3p447387647388712Design Primer
181NC_008333(ATTACT)3atacgaattttctgaggagcaacatgagacttgattttcctatagtctggc(TACTA)6c47647647657499Design Primer
182NC_008333(TAG)4p347675247676312Design Primer
183NC_008333(CGAGAG)3p647909847911518Design Primer
184NC_008333(CCTTAT)3p648121748123418Design Primer
185NC_008333(AACA)3p448723848724912Design Primer
186NC_008333(AAGA)3p448970048971112Design Primer
187NC_008333(AAGC)3p449381949383012Design Primer
188NC_008333(GAA)6p349482049483718Design Primer
189NC_008333(TCGT)3p450130250131312Design Primer
190NC_008333(A)10p150551450552310Design Primer
191NC_008333(C)12p150734150735212Design Primer
192NC_008333(GCTA)3p450875950877012Design Primer
193NC_008333(TTGTA)3p550993650995015Design Primer
194NC_008333(ATAGT)7p551543551546935Design Primer
195NC_008333(AATACG)3p651569051570718Design Primer
196NC_008333(ACTTG)3p551776351777715Design Primer
197NC_008333(TAAGA)4p552194752196620Design Primer
198NC_008333(ATAAGA)4p652344152346424Design Primer
199NC_008333(CTTT)3p452378152379212Design Primer
200NC_008333(ACTAT)3p552422752424115Design Primer
201NC_008333(G)10p152571052571910Design Primer
202NC_008333(ATATT)3p552589452590815Design Primer
203NC_008333(ATAGAA)3p652806052807718Design Primer
204NC_008333(AATAG)3p552963652965015Design Primer
205NC_008333(GTA)4p353594053595112Design Primer