ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Barnettozyma californica strain CBS 252 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022159	ATT	5	911	925	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320663
2	NC_022159	ATA	4	928	939	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320663
3	NC_022159	TAA	12	1038	1072	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	53320663
4	NC_022159	ATA	4	1296	1308	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_022159	TAA	4	1444	1455	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_022159	ATA	4	1599	1610	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_022159	CGG	4	2578	2588	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_022159	TTA	4	2685	2697	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_022159	TAA	4	3326	3337	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320663
10	NC_022159	TAA	4	3506	3517	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
11	NC_022159	ATA	4	4062	4073	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
12	NC_022159	ATT	4	4248	4258	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320661
13	NC_022159	TAT	4	4519	4531	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320661
14	NC_022159	ATA	4	4765	4776	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
15	NC_022159	TAT	4	5111	5122	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320661
16	NC_022159	ATT	4	5144	5154	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320661
17	NC_022159	TAT	4	5314	5325	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320661
18	NC_022159	ATT	4	5602	5614	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_022159	AAT	4	5628	5639	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_022159	TAT	4	5848	5858	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_022159	GCC	4	5864	5874	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
22	NC_022159	ATA	4	7091	7101	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_022159	ATT	4	7244	7255	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_022159	TTA	4	8381	8393	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_022159	AAT	4	9290	9300	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_022159	ATT	4	9379	9391	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_022159	GCC	4	9486	9496	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
28	NC_022159	CGG	4	9496	9507	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_022159	CGG	4	10246	10257	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_022159	TAA	4	10272	10283	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_022159	ATA	4	11946	11957	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
32	NC_022159	CGG	4	12415	12426	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	53320661
33	NC_022159	TAA	4	12853	12863	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320661
34	NC_022159	TAT	4	13197	13208	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320661
35	NC_022159	TAA	4	13418	13429	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
36	NC_022159	TAA	4	13467	13478	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
37	NC_022159	TAA	4	13499	13510	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
38	NC_022159	ATA	4	13769	13781	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320661
39	NC_022159	TAA	4	14318	14329	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
40	NC_022159	TTA	4	14382	14396	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320661
41	NC_022159	TAT	4	14592	14603	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320661
42	NC_022159	ATT	4	15166	15177	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320661
43	NC_022159	ATA	4	15178	15188	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320661
44	NC_022159	AAT	4	15302	15314	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320661
45	NC_022159	ATT	4	15400	15411	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	53320661
46	NC_022159	TAA	4	15414	15424	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320661
47	NC_022159	TTA	4	15814	15825	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320661
48	NC_022159	ATA	4	16026	16036	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_022159	ATA	4	16218	16230	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320661
50	NC_022159	ATA	4	16247	16258	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
51	NC_022159	TAA	5	16306	16319	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320661
52	NC_022159	ATT	4	16341	16352	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320661
53	NC_022159	TAT	5	16563	16577	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320661
54	NC_022159	AAT	4	16714	16725	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
55	NC_022159	TAA	4	16807	16818	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
56	NC_022159	TAT	5	17058	17072	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320661
57	NC_022159	TAT	4	17080	17090	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320661
58	NC_022159	TAA	4	17209	17220	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
59	NC_022159	ATA	4	17352	17363	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
60	NC_022159	ATT	4	17441	17452	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320661
61	NC_022159	TAA	5	17518	17532	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320661
62	NC_022159	TAA	4	17610	17622	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320661
63	NC_022159	ATA	11	17669	17702	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
64	NC_022159	AAT	4	17857	17868	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320663
65	NC_022159	TAA	5	17925	17939	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320663
66	NC_022159	TAA	4	17946	17958	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320663
67	NC_022159	ATA	5	17964	17978	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320663
68	NC_022159	TAT	4	18147	18157	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320663
69	NC_022159	TAA	5	18250	18264	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320663
70	NC_022159	ATA	4	18625	18635	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_022159	TAA	8	19294	19318	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320662
72	NC_022159	ATT	4	19361	19372	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320662
73	NC_022159	TAT	4	19378	19390	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320662
74	NC_022159	ATA	4	19414	19425	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320662
75	NC_022159	TTA	4	19509	19520	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320662
76	NC_022159	TAA	9	19549	19576	28	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320662
77	NC_022159	TAA	5	19594	19608	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320662
78	NC_022159	TTA	4	19736	19748	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320662
79	NC_022159	ATA	4	19989	20000	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320662
80	NC_022159	ATT	4	20024	20036	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320662
81	NC_022159	ATT	4	20594	20605	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	53320662
82	NC_022159	ATA	5	20712	20726	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_022159	AAT	4	20830	20840	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_022159	TAA	4	20853	20865	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_022159	TTA	4	21115	21125	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320663
86	NC_022159	TAA	4	21144	21156	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_022159	ATA	4	21419	21429	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320662
88	NC_022159	TAA	6	21474	21490	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	53320662
89	NC_022159	AAT	4	21493	21503	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320662
90	NC_022159	ATA	4	21527	21537	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320662
91	NC_022159	TAA	4	21597	21608	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53320662
92	NC_022159	AAT	4	21673	21684	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320662
93	NC_022159	ATT	4	21758	21768	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320662
94	NC_022159	TAA	4	21768	21779	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320662
95	NC_022159	ATA	7	21783	21805	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320662
96	NC_022159	ATA	7	21869	21889	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320662
97	NC_022159	TAA	4	22056	22067	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320662
98	NC_022159	TAA	7	22133	22154	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320662
99	NC_022159	ATA	5	22166	22180	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320662
100	NC_022159	TAA	4	22955	22966	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_022159	GCC	4	23686	23696	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
102	NC_022159	TAA	4	23715	23725	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_022159	ATA	4	23788	23803	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_022159	TAA	4	24000	24011	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_022159	CTG	4	24598	24609	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53320663
106	NC_022159	ATA	4	26036	26048	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_022159	TAT	5	27243	27257	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_022159	TAA	7	27258	27278	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_022159	AAT	4	27647	27659	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_022159	TAA	4	27765	27775	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_022159	TAT	7	27776	27795	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
112	NC_022159	ATA	8	27878	27901	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_022159	GCC	4	28124	28134	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
114	NC_022159	ATT	5	28761	28774	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_022159	ATT	7	29223	29244	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_022159	TAA	4	29567	29578	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_022159	TAA	4	29862	29874	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_022159	TAA	4	29985	29995	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_022159	ATT	4	30014	30024	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_022159	ATT	4	30551	30561	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_022159	ATA	4	30600	30611	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_022159	ATA	4	31378	31388	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320661
123	NC_022159	ATA	4	31402	31412	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320661
124	NC_022159	TAT	5	31659	31672	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320661
125	NC_022159	TAA	4	31721	31731	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320661
126	NC_022159	AAT	9	31923	31948	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320661
127	NC_022159	ATA	8	32129	32151	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
128	NC_022159	ATA	4	32314	32325	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
129	NC_022159	AAT	4	32399	32410	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320661
130	NC_022159	TAT	4	32443	32454	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320661
131	NC_022159	TAA	4	33239	33250	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53320661
132	NC_022159	TAA	4	33475	33487	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320661
133	NC_022159	ATA	5	33736	33750	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320661
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145	NC_022159	ATA	4	36652	36666	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320661
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155	NC_022159	TTA	5	41975	41989	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
156	NC_022159	TAA	4	42062	42072	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
157	NC_022159	TTA	5	42073	42087	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
158	NC_022159	ATA	4	42404	42415	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
159	NC_022159	ATA	4	42624	42635	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320662
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162	NC_022159	ATA	4	44102	44112	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
163	NC_022159	TAA	4	45204	45215	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
164	NC_022159	ATA	4	45540	45551	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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186	NC_022159	TAA	4	47897	47909	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
187	NC_022159	GCC	4	48207	48217	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
188	NC_022159	ATA	5	48365	48379	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Barnettozyma californica strain CBS 252 mitochondrion