ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Butomus umbellatus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021399CATT3824882591225 %50 %0 %25 %0 %51178259
2NC_021399AAAG314582145921175 %0 %25 %0 %9 %51178262
3NC_021399TTGT31535115361110 %75 %25 %0 %9 %51178262
4NC_021399AAGC317060170701150 %0 %25 %25 %9 %51178262
5NC_021399TCAT423801238161625 %50 %0 %25 %6 %51178262
6NC_021399AAGG323951239611150 %0 %50 %0 %9 %51178262
7NC_021399GATC325858258681125 %25 %25 %25 %9 %51178262
8NC_021399CGGT32860328614120 %25 %50 %25 %8 %51178262
9NC_021399TGAG335141351511125 %25 %50 %0 %9 %51178262
10NC_021399GAAA336612366231275 %0 %25 %0 %8 %51178262
11NC_021399CTGA344780447911225 %25 %25 %25 %0 %51178262
12NC_021399TCGA346947469571125 %25 %25 %25 %9 %51178262
13NC_021399TTGG35069150701110 %50 %50 %0 %9 %51178262
14NC_021399CCTT35402054030110 %50 %0 %50 %9 %51178259
15NC_021399AGGG358823588341225 %0 %75 %0 %8 %51178259
16NC_021399GGAC362003620141225 %0 %50 %25 %8 %51178259
17NC_021399GGAA366036660471250 %0 %50 %0 %8 %51178259
18NC_021399GCCC36713467145120 %0 %25 %75 %8 %51178259
19NC_021399ACCC367299673101225 %0 %0 %75 %8 %51178259
20NC_021399GAAA367582675931275 %0 %25 %0 %8 %51178259
21NC_021399GTCC36854468554110 %25 %25 %50 %9 %51178259
22NC_021399GAAG371728717401350 %0 %50 %0 %7 %51178259
23NC_021399TTCT37191471925120 %75 %0 %25 %8 %51178259
24NC_021399CAAG372689727001250 %0 %25 %25 %0 %51178259
25NC_021399CCAA372936729481350 %0 %0 %50 %7 %51178259
26NC_021399TCAG374439744491125 %25 %25 %25 %9 %51178259
27NC_021399GGGA475025750391525 %0 %75 %0 %6 %51178259
28NC_021399GCTT37505575065110 %50 %25 %25 %9 %51178259
29NC_021399GTTT37839178401110 %75 %25 %0 %9 %51178259
30NC_021399ACCT479342793561525 %25 %0 %50 %6 %51178259
31NC_021399GCAA384138841491250 %0 %25 %25 %8 %51178259
32NC_021399CAGG384445844561225 %0 %50 %25 %0 %51178259
33NC_021399CTCC39053290543120 %25 %0 %75 %8 %51178262
34NC_021399GAGC390764907751225 %0 %50 %25 %0 %51178262
35NC_021399AGGA391326913361150 %0 %50 %0 %9 %51178262
36NC_021399CCTT39304393053110 %50 %0 %50 %9 %51178262
37NC_021399GATT395914959251225 %50 %25 %0 %8 %51178262
38NC_021399CCTT39650496515120 %50 %0 %50 %8 %51178262
39NC_021399AGGA399209992191150 %0 %50 %0 %9 %51178262
40NC_021399TCGG4101143101158160 %25 %50 %25 %6 %51178262
41NC_021399GTAG31019501019601125 %25 %50 %0 %9 %51178262
42NC_021399AACT31026991027091150 %25 %0 %25 %9 %51178262
43NC_021399TTCT4104298104313160 %75 %0 %25 %6 %51178262
44NC_021399AAAG31067191067301275 %0 %25 %0 %8 %51178262
45NC_021399AAGG31089391089501250 %0 %50 %0 %8 %51178262
46NC_021399AGAC31095551095651150 %0 %25 %25 %9 %51178262
47NC_021399TTGG3110965110976120 %50 %50 %0 %8 %51178262
48NC_021399TTTG3115445115457130 %75 %25 %0 %7 %51178262
49NC_021399TCAG31196711196821225 %25 %25 %25 %8 %51178262
50NC_021399CTTC3121516121526110 %50 %0 %50 %9 %51178262
51NC_021399AATG31230861230971250 %25 %25 %0 %8 %51178262
52NC_021399CCTC3126697126708120 %25 %0 %75 %8 %51178262
53NC_021399AAGA31273121273221175 %0 %25 %0 %9 %51178262
54NC_021399CTTT3128214128224110 %75 %0 %25 %9 %51178262
55NC_021399CTAG31284351284451125 %25 %25 %25 %9 %51178262
56NC_021399TGAC31292661292771225 %25 %25 %25 %8 %51178262
57NC_021399ACCC31398111398211125 %0 %0 %75 %9 %51178262
58NC_021399CTTT3140146140156110 %75 %0 %25 %9 %51178262
59NC_021399TAGA31430051430151150 %25 %25 %0 %9 %51178262
60NC_021399AGTC31441041441151225 %25 %25 %25 %8 %51178262
61NC_021399ATCA31472041472141150 %25 %0 %25 %9 %51178262
62NC_021399AATC31485581485691250 %25 %0 %25 %8 %51178262
63NC_021399AATC31528941529051250 %25 %0 %25 %8 %51178262
64NC_021399CCTA31545421545521125 %25 %0 %50 %9 %51178262
65NC_021399AGCA31554521554621150 %0 %25 %25 %9 %51178262
66NC_021399GTTT3155480155491120 %75 %25 %0 %8 %51178262
67NC_021399GTCT3158008158019120 %50 %25 %25 %8 %51178262
68NC_021399ATAG31602471602571150 %25 %25 %0 %9 %51178262
69NC_021399GGAG31602931603041225 %0 %75 %0 %8 %51178262
70NC_021399CTCC3161675161690160 %25 %0 %75 %6 %51178262
71NC_021399CTGA31638751638851125 %25 %25 %25 %9 %51178262
72NC_021399GGAA31660241660341150 %0 %50 %0 %9 %51178262
73NC_021399TTGG3167684167695120 %50 %50 %0 %8 %51178262
74NC_021399AATG31684531684631150 %25 %25 %0 %9 %51178262
75NC_021399AAGC31685101685201150 %0 %25 %25 %9 %51178262
76NC_021399AATC31767561767671250 %25 %0 %25 %8 %51178262
77NC_021399ACCT31814221814331225 %25 %0 %50 %8 %51178262
78NC_021399TTCA31826381826491225 %50 %0 %25 %0 %51178262
79NC_021399CAGT31851051851161225 %25 %25 %25 %8 %51178262
80NC_021399TTCC3187678187688110 %50 %0 %50 %9 %51178262
81NC_021399GGAA31907571907681250 %0 %50 %0 %8 %51178262
82NC_021399TTCC3190904190914110 %50 %0 %50 %9 %51178262
83NC_021399CACT31915121915241325 %25 %0 %50 %7 %51178262
84NC_021399GGGA31925401925501125 %0 %75 %0 %9 %51178262
85NC_021399CCTT3195116195128130 %50 %0 %50 %7 %51178262
86NC_021399GGTG3197162197173120 %25 %75 %0 %8 %51178262
87NC_021399TCAA31986611986711150 %25 %0 %25 %9 %51178262
88NC_021399CTGA31993641993741125 %25 %25 %25 %9 %51178262
89NC_021399TCCC4201731201747170 %25 %0 %75 %5 %51178262
90NC_021399TCCC3202045202056120 %25 %0 %75 %8 %51178262
91NC_021399TTCC3202108202119120 %50 %0 %50 %8 %51178262
92NC_021399TTCT3203359203369110 %75 %0 %25 %9 %51178262
93NC_021399CTTC4203598203613160 %50 %0 %50 %6 %51178262
94NC_021399ACTG32055132055241225 %25 %25 %25 %8 %51178262
95NC_021399AGCG32064032064131125 %0 %50 %25 %9 %51178262
96NC_021399TGGA32064612064711125 %25 %50 %0 %9 %51178262
97NC_021399TCCA32104752104861225 %25 %0 %50 %8 %51178262
98NC_021399CATT42147652147801625 %50 %0 %25 %6 %51178262
99NC_021399CTAG32169672169781225 %25 %25 %25 %8 %51178262
100NC_021399CTTT3222034222045120 %75 %0 %25 %8 %51178262
101NC_021399GACT32277772277881225 %25 %25 %25 %0 %51178262
102NC_021399CTTT3227860227870110 %75 %0 %25 %9 %51178262
103NC_021399TGGT3229270229281120 %50 %50 %0 %8 %51178262
104NC_021399TTCT3232271232282120 %75 %0 %25 %8 %51178262
105NC_021399CCAG32333922334021125 %0 %25 %50 %9 %51178262
106NC_021399AAAG32392502392601175 %0 %25 %0 %9 %51178262
107NC_021399TTCC3239929239939110 %50 %0 %50 %9 %51178262
108NC_021399TTGC3240103240113110 %50 %25 %25 %9 %51178262
109NC_021399GAAA32423862423971275 %0 %25 %0 %0 %51178262
110NC_021399AAAG32430442430551275 %0 %25 %0 %8 %51178262
111NC_021399AGGG32434102434211225 %0 %75 %0 %8 %51178262
112NC_021399ACAG42441412441561650 %0 %25 %25 %6 %51178262
113NC_021399ACAG32464262464371250 %0 %25 %25 %8 %51178262
114NC_021399GCTA32470572470671125 %25 %25 %25 %9 %51178262
115NC_021399AAGG32474652474761250 %0 %50 %0 %0 %51178262
116NC_021399TTTC3251369251380120 %75 %0 %25 %8 %51178262
117NC_021399CTAT32577862577971225 %50 %0 %25 %0 %51178262
118NC_021399CTCC3260064260075120 %25 %0 %75 %0 %51178262
119NC_021399GAAT32606542606641150 %25 %25 %0 %9 %51178262
120NC_021399CCTT3263453263464120 %50 %0 %50 %8 %51178262
121NC_021399GCCT4267451267466160 %25 %25 %50 %6 %51178262
122NC_021399CACC32687242687341125 %0 %0 %75 %9 %51178262
123NC_021399TCGA32708872708981225 %25 %25 %25 %8 %51178262
124NC_021399CCCG3272678272689120 %0 %25 %75 %8 %51178262
125NC_021399CAAG32733172733281250 %0 %25 %25 %8 %51178262
126NC_021399TAGC32775352775451125 %25 %25 %25 %9 %51178262
127NC_021399GTAG32776202776311225 %25 %50 %0 %8 %51178262
128NC_021399TTCT3278065278076120 %75 %0 %25 %8 %51178262
129NC_021399CGAA32785882785991250 %0 %25 %25 %8 %51178262
130NC_021399CTCA32816122816231225 %25 %0 %50 %8 %51178262
131NC_021399AACT32820502820611250 %25 %0 %25 %8 %51178262
132NC_021399GGGA32833052833151125 %0 %75 %0 %9 %51178262
133NC_021399GCAG32863672863781225 %0 %50 %25 %8 %51178262
134NC_021399GGTT3288102288113120 %50 %50 %0 %8 %51178262
135NC_021399CCAT32895532895631125 %25 %0 %50 %9 %51178262
136NC_021399TTCT3292083292094120 %75 %0 %25 %8 %51178262
137NC_021399TCAC42936302936441525 %25 %0 %50 %6 %51178262
138NC_021399AGGG32962642962751225 %0 %75 %0 %8 %51178262
139NC_021399GGAC32994442994551225 %0 %50 %25 %8 %51178262
140NC_021399AGCG33051213051311125 %0 %50 %25 %9 %51178262
141NC_021399CTTT3305892305903120 %75 %0 %25 %8 %51178262
142NC_021399ATCT33069953070061225 %50 %0 %25 %8 %51178262
143NC_021399GAAT43073033073181650 %25 %25 %0 %6 %51178262
144NC_021399AACT33148213148321250 %25 %0 %25 %0 %51178262
145NC_021399GATA33180873180971150 %25 %25 %0 %9 %51178262
146NC_021399TAGC33181983182091225 %25 %25 %25 %8 %51178262
147NC_021399CTTG3318419318429110 %50 %25 %25 %9 %51178262
148NC_021399GGCA33186563186661125 %0 %50 %25 %9 %51178262
149NC_021399AAGG33192493192601250 %0 %50 %0 %8 %51178262
150NC_021399CGGT3320115320126120 %25 %50 %25 %8 %51178262
151NC_021399GGGT3321917321927110 %25 %75 %0 %9 %51178262
152NC_021399AGAA33271523271631275 %0 %25 %0 %8 %51178262
153NC_021399CAAT33279393279491150 %25 %0 %25 %9 %51178262
154NC_021399GTTC3328081328091110 %50 %25 %25 %9 %51178262
155NC_021399AAAC33320233320331175 %0 %0 %25 %9 %51178262
156NC_021399TAAA33371043371151275 %25 %0 %0 %8 %51178262
157NC_021399TGAC33393853393951125 %25 %25 %25 %9 %51178262
158NC_021399AGCA33404553404661250 %0 %25 %25 %8 %51178262
159NC_021399TTCC3340610340621120 %50 %0 %50 %8 %51178262
160NC_021399CCTT3340916340927120 %50 %0 %50 %8 %51178262
161NC_021399TCTA33419783419891225 %50 %0 %25 %8 %51178262
162NC_021399CAGA33458203458311250 %0 %25 %25 %0 %51178262
163NC_021399GCGG3346573346585130 %0 %75 %25 %7 %51178262
164NC_021399TGTT3351074351084110 %75 %25 %0 %9 %51178262
165NC_021399TTTG3351445351456120 %75 %25 %0 %8 %51178262
166NC_021399GACT33519603519711225 %25 %25 %25 %8 %51178262
167NC_021399GGAA33542583542681150 %0 %50 %0 %9 %51178262
168NC_021399GGTC3354752354762110 %25 %50 %25 %9 %51178262
169NC_021399TCCC3359711359722120 %25 %0 %75 %8 %51178262
170NC_021399GGAC33614623614721125 %0 %50 %25 %9 %51178262
171NC_021399GGGT3362706362717120 %25 %75 %0 %8 %51178262
172NC_021399GGGC3362871362882120 %0 %75 %25 %8 %51178262
173NC_021399CAAA33631783631901375 %0 %0 %25 %7 %51178262
174NC_021399TTCC3363969363980120 %50 %0 %50 %8 %51178262
175NC_021399GTCC3364114364126130 %25 %25 %50 %7 %51178262
176NC_021399CTTT3364785364795110 %75 %0 %25 %9 %51178262
177NC_021399GATT33676553676661225 %50 %25 %0 %8 %51178262
178NC_021399ATCC33702983703091225 %25 %0 %50 %8 %51178262
179NC_021399TCTA33706853706961225 %50 %0 %25 %8 %51178262
180NC_021399AAGG33761553761661250 %0 %50 %0 %8 %51178262
181NC_021399AAAG33775083775191275 %0 %25 %0 %8 %51178262
182NC_021399TTCC3378882378893120 %50 %0 %50 %8 %51178262
183NC_021399GCTA33804953805061225 %25 %25 %25 %8 %51178262
184NC_021399GCAC33812613812711125 %0 %25 %50 %9 %51178262
185NC_021399CAAG33813463813571250 %0 %25 %25 %0 %51178262
186NC_021399GTGA33842553842651125 %25 %50 %0 %9 %51178262
187NC_021399ATTC33844793844901225 %50 %0 %25 %8 %51178262
188NC_021399GTCT3387294387305120 %50 %25 %25 %8 %51178262
189NC_021399CATT33876663876771225 %50 %0 %25 %0 %51178262
190NC_021399TGGA33879483879581125 %25 %50 %0 %9 %51178262
191NC_021399AGAT33894883894981150 %25 %25 %0 %9 %51178262
192NC_021399CTTG3389889389900120 %50 %25 %25 %8 %51178262
193NC_021399CTGG3391588391599120 %25 %50 %25 %8 %51178262
194NC_021399AAGG33917993918091150 %0 %50 %0 %9 %51178262
195NC_021399AAGG33937423937531250 %0 %50 %0 %8 %51178262
196NC_021399AGGG33938753938861225 %0 %75 %0 %8 %51178262
197NC_021399GAAT33951003951111250 %25 %25 %0 %8 %51178262
198NC_021399CATC33977143977251225 %25 %0 %50 %8 %51178262
199NC_021399ATCC33978063978171225 %25 %0 %50 %8 %51178262
200NC_021399ATCG33980013980111125 %25 %25 %25 %9 %51178262
201NC_021399GCTT3398019398030120 %50 %25 %25 %8 %51178262
202NC_021399AGCT33981253981361225 %25 %25 %25 %8 %51178262
203NC_021399AATG34002134002231150 %25 %25 %0 %9 %51178262
204NC_021399ATCC34028834028931125 %25 %0 %50 %9 %51178262
205NC_021399TGCT3402995403006120 %50 %25 %25 %8 %51178262
206NC_021399ATTC34077504077611225 %50 %0 %25 %0 %51178262
207NC_021399GCAA34083074083171150 %0 %25 %25 %9 %51178262
208NC_021399ATAA34088134088241275 %25 %0 %0 %8 %51178262
209NC_021399TATC34089984090091225 %50 %0 %25 %8 %51178262
210NC_021399ATAC34090754090861250 %25 %0 %25 %8 %51178262
211NC_021399ATGG34111454111561225 %25 %50 %0 %8 %51178262
212NC_021399GGTG3414222414232110 %25 %75 %0 %9 %51178262
213NC_021399CCTT3416057416068120 %50 %0 %50 %8 %51178262
214NC_021399CTTT3418420418430110 %75 %0 %25 %9 %51178262
215NC_021399CGAA34212064212161150 %0 %25 %25 %9 %51178262
216NC_021399GAAA34212404212501175 %0 %25 %0 %9 %51178262
217NC_021399TTGA34231604231701125 %50 %25 %0 %9 %51178262
218NC_021399AGAA34249004249121375 %0 %25 %0 %7 %51178262
219NC_021399AAGG34249884249981150 %0 %50 %0 %9 %51178262
220NC_021399CTTT4429751429766160 %75 %0 %25 %6 %51178262
221NC_021399CCCT3431433431443110 %25 %0 %75 %9 %Non-Coding
222NC_021399TTCG3435130435141120 %50 %25 %25 %0 %Non-Coding
223NC_021399CAAG34362974363071150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
224NC_021399GGTT3438460438471120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
225NC_021399AATC34385184385281150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
226NC_021399TTTC3440712440722110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
227NC_021399AAGG34418534418651350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
228NC_021399CTTC3443768443779120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding