ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Butomus umbellatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021399	C	14	9	22	14	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_021399	TCT	4	1271	1282	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021399	CATT	3	8248	8259	12	25 %	50 %	0 %	25 %	51178259
4	NC_021399	TCAT	3	23801	23812	12	25 %	50 %	0 %	25 %	51178262
5	NC_021399	TGAT	3	23813	23824	12	25 %	50 %	25 %	0 %	51178262
6	NC_021399	AG	6	28167	28178	12	50 %	0 %	50 %	0 %	51178262
7	NC_021399	CTGA	3	44780	44791	12	25 %	25 %	25 %	25 %	51178262
8	NC_021399	GAAA	3	51249	51260	12	75 %	0 %	25 %	0 %	51178259
9	NC_021399	C	15	52486	52500	15	0 %	0 %	0 %	100 %	51178259
10	NC_021399	CAAG	3	72689	72700	12	50 %	0 %	25 %	25 %	51178259
11	NC_021399	ACCT	3	79345	79356	12	25 %	25 %	0 %	50 %	51178259
12	NC_021399	CAGG	3	84445	84456	12	25 %	0 %	50 %	25 %	51178259
13	NC_021399	GAGC	3	90764	90775	12	25 %	0 %	50 %	25 %	51178262
14	NC_021399	TCGG	3	101143	101154	12	0 %	25 %	50 %	25 %	51178262
15	NC_021399	GCT	4	131020	131031	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51178262
16	NC_021399	CTCC	3	161675	161686	12	0 %	25 %	0 %	75 %	51178262
17	NC_021399	AAGAG	3	172819	172833	15	60 %	0 %	40 %	0 %	51178262
18	NC_021399	CTC	4	174246	174257	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51178262
19	NC_021399	TTCA	3	182638	182649	12	25 %	50 %	0 %	25 %	51178262
20	NC_021399	AAGC	3	200581	200592	12	50 %	0 %	25 %	25 %	51178262
21	NC_021399	TCCC	3	201731	201742	12	0 %	25 %	0 %	75 %	51178262
22	NC_021399	AG	6	202961	202972	12	50 %	0 %	50 %	0 %	51178262
23	NC_021399	GA	6	203190	203201	12	50 %	0 %	50 %	0 %	51178262
24	NC_021399	GAATC	3	213003	213017	15	40 %	20 %	20 %	20 %	51178262
25	NC_021399	TATAG	14	221402	221471	70	40 %	40 %	20 %	0 %	51178262
26	NC_021399	GACT	3	227777	227788	12	25 %	25 %	25 %	25 %	51178262
27	NC_021399	GAAA	3	242386	242397	12	75 %	0 %	25 %	0 %	51178262
28	NC_021399	ACAG	3	244141	244152	12	50 %	0 %	25 %	25 %	51178262
29	NC_021399	CTA	4	245856	245867	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51178262
30	NC_021399	AAGG	3	247465	247476	12	50 %	0 %	50 %	0 %	51178262
31	NC_021399	CTT	4	248469	248480	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51178262
32	NC_021399	TACCC	3	255080	255094	15	20 %	20 %	0 %	60 %	51178262
33	NC_021399	TCT	4	255184	255195	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51178262
34	NC_021399	CTAT	3	257786	257797	12	25 %	50 %	0 %	25 %	51178262
35	NC_021399	CTCC	3	260064	260075	12	0 %	25 %	0 %	75 %	51178262
36	NC_021399	AGA	4	276878	276889	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51178262
37	NC_021399	TA	6	286143	286154	12	50 %	50 %	0 %	0 %	51178262
38	NC_021399	GAAT	3	307303	307314	12	50 %	25 %	25 %	0 %	51178262
39	NC_021399	AACT	3	314821	314832	12	50 %	25 %	0 %	25 %	51178262
40	NC_021399	AT	7	334872	334885	14	50 %	50 %	0 %	0 %	51178262
41	NC_021399	CAGA	3	345820	345831	12	50 %	0 %	25 %	25 %	51178262
42	NC_021399	TGT	4	357750	357761	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51178262
43	NC_021399	CAAG	3	381346	381357	12	50 %	0 %	25 %	25 %	51178262
44	NC_021399	CATT	3	387666	387677	12	25 %	50 %	0 %	25 %	51178262
45	NC_021399	C	13	396248	396260	13	0 %	0 %	0 %	100 %	51178262
46	NC_021399	C	14	403341	403354	14	0 %	0 %	0 %	100 %	51178262
47	NC_021399	ATTC	3	407750	407761	12	25 %	50 %	0 %	25 %	51178262
48	NC_021399	TTCG	3	435130	435141	12	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021399	GAG	4	436491	436502	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021399	AGA	4	448556	448567	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51178262
51	NC_021399	GCCG	3	449522	449533	12	0 %	0 %	50 %	50 %	51178262

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Butomus umbellatus mitochondrion